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Etude Mecanistique De La Biosynthese Des Centres Fer Soufre Chez Escherichia Coli Quel Role Pour La Proteine Sufa
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Book Synopsis Etude mécanistique de la biosynthèse des centres fer-soufre chez Escherichia coli : quel rôle pour la protéine SufA ? by : Maïté Sendra
Download or read book Etude mécanistique de la biosynthèse des centres fer-soufre chez Escherichia coli : quel rôle pour la protéine SufA ? written by Maïté Sendra and published by . This book was released on 2007 with total page 285 pages. Available in PDF, EPUB and Kindle. Book excerpt: Les protéines [Fe-S] sont des enzymes ubiquitaires, assurant des fonctions clés au sein des organismes vivants. La biosynthèse des centres [Fe-S], à savoir les processus permettant un assemblage correct des atomes de fer et de soufre au sein des protéines cibles, requièrent la participation de machineries protéiques complexes. Parmi elles se trouve la machinerie SUF qui intervient dans des conditions de stress oxydant et de carence en fer. Elle est composée de six gènes sufABCDSE. La protéine SufA est proposée comme étant une protéine scaffold ayant pour rôle de préassembler transitoirement des centres [Fe-S] et de les transférer à des protéines cibles. Elle possède trois résidus cystéines conservés proposés comme étant les ligands des centres [Fe-S]. SufA est obtenue principalement sous forme apo après purification. Le centre [Fe-S] peut être reconstitué chimiquement in vitro. Dans ces conditions, SufA contient un mélange de centres [2Fe-2S] et [4Fe-4S]. Nous avons alors isolé SufA native métallée après purification à partir de tout l’opéron suf en anaérobiose, et montré qu’elle contient un centre [Fe-S], plutôt de type [2Fe-2S], transférable efficacement à la ferrédoxine. Nous avons également étudié les mécanismes moléculaires de formation du cluster dans SufA. SufA est capable de fixer à la fois du soufre, au niveau de ses trois cystéines conservées, et du fer, majoritairement au niveau d’atomes d’azote et d’oxygène. Ces éléments sont mobilisables pour la formation d’un centre [Fe-S] en milieu réducteur. Enfin, des expériences préliminaires réalisées in vitro avec des mutants dirigés n’ont pas permis d’identifier la nature exacte des ligands du centre [Fe-S] dans SufA.
Book Synopsis Etude mécanistique de la biosynthèse des centres fer-soufre chez Escherichia coli : quel rôle pour la protéine SufA ? by : Maïté Sendra
Download or read book Etude mécanistique de la biosynthèse des centres fer-soufre chez Escherichia coli : quel rôle pour la protéine SufA ? written by Maïté Sendra and published by . This book was released on 2007 with total page 0 pages. Available in PDF, EPUB and Kindle. Book excerpt: Les protéines [Fe-S] sont des enzymes ubiquitaires, assurant des fonctions clés au sein des organismes vivants. La biosynthèse des centres [Fe-S], à savoir les processus permettant un assemblage correct des atomes de fer et de soufre au sein des protéines cibles, requièrent la participation de machineries protéiques complexes. Parmi elles se trouve la machinerie SUF qui intervient dans des conditions de stress oxydant et de carence en fer. Elle est composée de six gènes sufABCDSE. La protéine SufA est proposée comme étant une protéine scaffold ayant pour rôle de préassembler transitoirement des centres [Fe-S] et de les transférer à des protéines cibles. Elle possède trois résidus cystéines conservés proposés comme étant les ligands des centres [Fe-S]. SufA est obtenue principalement sous forme apo après purification. Le centre [Fe-S] peut être reconstitué chimiquement in vitro. Dans ces conditions, SufA contient un mélange de centres [2Fe-2S] et [4Fe-4S]. Nous avons alors isolé SufA native métallée après purification à partir de tout l'opéron suf en anaérobiose, et montré qu'elle contient un centre [Fe-S], plutôt de type [2Fe-2S], transférable efficacement à la ferrédoxine. Nous avons également étudié les mécanismes moléculaires de formation du cluster dans SufA. SufA est capable de fixer à la fois du soufre, au niveau de ses trois cystéines conservées, et du fer, majoritairement au niveau d'atomes d'azote et d'oxygène. Ces éléments sont mobilisables pour la formation d'un centre [Fe-S] en milieu réducteur. Enfin, des expériences préliminaires réalisées in vitro avec des mutants dirigés n'ont pas permis d'identifier la nature exacte des ligands du centre [Fe-S] dans SufA.
Book Synopsis Modélisation dynamique logique de la biogenèse des centres fer-soufre chez Escherichia coli by : Firas Hammami
Download or read book Modélisation dynamique logique de la biogenèse des centres fer-soufre chez Escherichia coli written by Firas Hammami and published by . This book was released on 2019 with total page 0 pages. Available in PDF, EPUB and Kindle. Book excerpt: Les centres Fer-Soufre (Fe-S) sont des cofacteurs essentiels ubiquitaires conservés dans tous les domaines du vivant. La biogenèse des centres Fe-S est extrêmement sensible à la carence en fer et au stress oxydant provoqué notamment par l'H2O2. Deux machineries, Isc et Suf, permettent l'assemblage et le transfert des centres Fe-S sur les apo-protéines cibles. Chez la bactérie modèle E.coli, Isc est considérée comme la machinerie utilisée en absence de stress, tandis que Suf est celle agissant dans des conditions de stress.Dans ce travail de thèse, nous proposons un modèle mathématique du réseau de régulation contrôlant la biogenèse des centres Fe-S, basé sur le formalisme logique, afin de mieux comprendre les mécanismes de régulation ainsi que la dynamique de ce processus en fonction des conditions environnementales que sont le fer et l'oxygène.Nous avons construit un graphe de régulation représentant les interactions entre les principaux acteurs de la biogenèse. Le graphe a ensuite été paramétré à l'aide de règles logiques décrivant le comportement dynamique du système.Ce modèle logique est centré sur trois modules décrivant la biogenèse des centres Fe-S, l'homéostasie du fer, et le stress oxydant centré sur l'H2O2. Les nœuds d'entrée du modèle représentent les conditions extracellulaires de fer et d'oxygène, tandis que les noeuds ErpA, NfuA (transporteurs de centres Fe-S) et Suf sont les nœuds de sortie du modèle.
Book Synopsis Détermination de la structure par RMN d'une protéine impliquée dans la biosynthèse de centres [Fe-S] by : Nicolas Duraffourg
Download or read book Détermination de la structure par RMN d'une protéine impliquée dans la biosynthèse de centres [Fe-S] written by Nicolas Duraffourg and published by . This book was released on 2006 with total page 174 pages. Available in PDF, EPUB and Kindle. Book excerpt: La protéine SufA d'Escherichia coli est une protéine homodimérique, dite d'échafaudage, qui permet l'assemblage de centres [Fe-S] avant de les transmettre à une protéine cible possèdant une fonction biologique. Elle appartient à un ensemble de protéines organisées en opéron (SUF) qui semble activé dans le cadre de stress oxydatif. Afin de mieux comprendre le mode de fixation du centre [Fe-S] par la protéine SufA, la détermination de la structure tridimensionnelle par RMN a été entreprise. Nous avons obtenu la structure monomérique de la protéine sans son centre [Fe-S] (forme apo) et effectué des études de résonance magnétique nucléaire (RMN) préliminaires de la protéine SufA avec son centre métallique reconstitué. Nous avons pu ainsi observer trois résidus cystéine, que des études biochimiques ont montré comme étant impliqués dans la chélation du centre [Fe-S], et affirmer qu'ils étaient proches du site métallique sans toutefois définir exactement le mode de coordination du centre [Fe-S]. La détermination de la structure du dimère, en cours, et des études RMN complémentaires sur l'holoprotéine (avec son centre [Fe-S]) devrait nous permettre de répondre à ces questions toujours en suspens. D'autre part nous avons observé des différences structurales par rapport aux structures cristallographiques (publiées au cours de ce travail de thèse), particulièrement dans la partie C-terminale de la protéine où se situent deux des cystéines observées
Book Synopsis Détermination de la structure par RMN d'une protéine impliquée dans la biosynthèse de centres [Fe-S], SufA by : Nicolas Duraffourg
Download or read book Détermination de la structure par RMN d'une protéine impliquée dans la biosynthèse de centres [Fe-S], SufA written by Nicolas Duraffourg and published by . This book was released on 2007 with total page 0 pages. Available in PDF, EPUB and Kindle. Book excerpt: La protéine SufA d'Escherichia coli est une protéine homodimérique, dite d'échafaudage, qui permet l'assemblage de centres [Fe-S] avant de les transmettre à une protéine cible possèdant une fonction biologique. Elle appartient à un ensemble de protéines organisées en opéron (SUF) qui semble activé dans le cadre de stress oxydatif. Afin de mieux comprendre le mode de fixation du centre [Fe-S] par la protéine SufA, la détermination de la structure tridimensionnelle par RMN a été entreprise. Nous avons obtenu la structure monomérique de la protéine sans son centre [Fe-S] (forme apo) et effectué des études de résonance magnétique nucléaire (RMN) préliminaires de la protéine SufA avec son centre métallique reconstitué. Nous avons pu ainsi observer trois résidus cystéine, que des études biochimiques ont montré comme étant impliqués dans la chélation du centre [Fe-S], et affirmer qu'ils étaient proches du site métallique sans toutefois définir exactement le mode de coordination du centre [Fe-S]. La détermination de la structure du dimère, en cours, et des études RMN complémentaires sur l'holoprotéine (avec son centre [Fe-S]) devrait nous permettre de répondre à ces questions toujours en suspens. D'autre part nous avons observé des différences structurales par rapport aux structures cristallographiques (publiées au cours de ce travail de thèse), particulièrement dans la partie C-terminale de la protéine où se situent deux des cystéines observées.
Book Synopsis Rôle de la protéine Nfs1 dans la biosynthèse des centres fer-soufre dans les cellules de mammifères by : Frédéric Canal
Download or read book Rôle de la protéine Nfs1 dans la biosynthèse des centres fer-soufre dans les cellules de mammifères written by Frédéric Canal and published by . This book was released on 2007 with total page 249 pages. Available in PDF, EPUB and Kindle. Book excerpt:
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