ETUDE DE LA SEQUENCE CARBOXYLE TERMINALE DE PEPTIDES ET DE PROTEINES PAR COUPLAGE ENTRE SPECTROMETRIE DE MASSE ET DEGRADATIONS ENZYMATIQUES

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Book Synopsis ETUDE DE LA SEQUENCE CARBOXYLE TERMINALE DE PEPTIDES ET DE PROTEINES PAR COUPLAGE ENTRE SPECTROMETRIE DE MASSE ET DEGRADATIONS ENZYMATIQUES by : PIERRE.. GAVARD

Download or read book ETUDE DE LA SEQUENCE CARBOXYLE TERMINALE DE PEPTIDES ET DE PROTEINES PAR COUPLAGE ENTRE SPECTROMETRIE DE MASSE ET DEGRADATIONS ENZYMATIQUES written by PIERRE.. GAVARD and published by . This book was released on 1991 with total page pages. Available in PDF, EPUB and Kindle. Book excerpt: CES DERNIERES ANNEES, L'ETUDE DES PROTEINES PAR SPECTROMETRIE DE MASSE A CONNU UN GRAND DEVELOPPEMENT. D'AUTRE PART, LA DETERMINATION DE SEQUENCE, PAR L'EXTREMITE C-TERMINALE DES PROTEINES RESTE PROBLEMATIQUE ETANT DONNEES LES METHODES EXISTANTES. UNE TELLE ANALYSE EST CEPENDANT PARFOIS OBLIGATOIRE LORSQUE LA DETERMINATION PAR L'EXTREMITE N-TERMINALE EST IMPOSSIBLE (PEPTIDES N-BLOQUES) OU DIFFICILE. AINSI, AU COURS DE CE TRAVAIL, LES AUTEURS ONT ETUDIE LES POSSIBILITES DE COUPLAGE ENTRE REACTION ENZYMATIQUE ET SPECTROMETRIE DE MASSE PAR BOMBARDEMENT D'ATOMES RAPIDE (FAB) POUR TENTER D'APPORTER UNE SOLUTION A L'ANALYSE DE SEQUENCES PROTEIQUES PAR L'EXTREMITE CARBOXYLE TERMINALE. DANS UN PREMIER TEMPS, LES AUTEURS ONT DEVELOPPE UN COUPLAGE EN LIGNE D'UNE DIGESTION ENZYMATIQUE PAR UNE EXOPEPTIDASE ET DE LA SPECTROMETRIE DE MASSE EN UTILISANT LA FAB A FLOT CONTINU. CECI AURA PERMIS DE CONNAITRE LA SEQUENCE DES SIX PREMIERS ACIDES AMINES CARBOXYLE TERMINAUX D'UN PEPTIDE EN COMPRENANT QUATORZE. L'UTILISATION DE LA SPECTROMETRIE DE MASSE EN TANDEM SUR UN ION MH#+ D'UN PEPTIDE ACCUMULE PAR SUITE D'UNE ETAPE LENTE A PERMIS DE LE SEQUENCER EN TOTALITE. LES AUTEURS ONT ENSUITE DEVELOPPE LE COUPLAGE DE DEUX REACTIONS ENZYMATIQUES CONSECUTIVES. LA PREMIERE DEGRADATION, EFFECTUEE PAR UNE EXOPEPTIDASE EST SUIVIE PAR UNE SECONDE, EFFECTUEE PAR UNE ENDOPEPTIDASE. CETTE STRATEGIE PERMET DE CONNAITRE LA SEQUENCE CARBOXYLE TERMINALE DE PROTEINES QUE LEUR MASSE REND NON ANALYSABLES DIRECTEMENT PAR NOTRE APPAREIL. CES DEUX REACTIONS ONT TOUT D'ABORD ETE ASSOCIEES EN CONTINU VIA LA FAB A FLOT CONTINU PUIS EN DISCONTINU AVEC UNE ANALYSE EN FAB STATIQUE ET APPLIQUEES A UN PEPTIDE DE VINGT-NEUF ACIDES AMINES. LA SPECTROMETRIE DE MASSE A PERMIS AUX AUTEURS DE RETROUVER LA SEQUENCE CARBOXYLE TERMINALE DE CE PEPETIDE EN SE BASANT UNIQUEMENT SUR LES DIFFERENCES DE MASSES ET DONC DE S'AFFRANCHIR, DANS UNE CERTAINE LIMITE, DES DIFFERENCES DE VITESSE D'HYDROLYSE POUR CHAQUE ACIDE AMINE. GRACE A CES TECHNIQUES, LES AUTEURS ONT PU LOCALISER ET DIFFERENCIER DES PEPTIDES ISOMERES BRANCHES PAR DES GROUPES GLUTAMYLES ANALOGUES SYNTHETIQUES DE LA PARTIE C-TERMINALE DE LA TUBULINE

DEVELOPPEMENT DU COUPLAGE DE LA CHROMATOGRAPHIE LIQUIDE AVEC LA SPECTROMETRIE DE MASSE PAR L'INTERFACE FAB A FLUX CONTINU. CARACTERISATION DES PROTEINES H, T ET L DU COMPLEXE DE LA GLYCINE DECARBOXYLASE DES FEUILLES DE POIS

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Book Synopsis DEVELOPPEMENT DU COUPLAGE DE LA CHROMATOGRAPHIE LIQUIDE AVEC LA SPECTROMETRIE DE MASSE PAR L'INTERFACE FAB A FLUX CONTINU. CARACTERISATION DES PROTEINES H, T ET L DU COMPLEXE DE LA GLYCINE DECARBOXYLASE DES FEUILLES DE POIS by : VERONIQUE.. LOUVET MERAND

Download or read book DEVELOPPEMENT DU COUPLAGE DE LA CHROMATOGRAPHIE LIQUIDE AVEC LA SPECTROMETRIE DE MASSE PAR L'INTERFACE FAB A FLUX CONTINU. CARACTERISATION DES PROTEINES H, T ET L DU COMPLEXE DE LA GLYCINE DECARBOXYLASE DES FEUILLES DE POIS written by VERONIQUE.. LOUVET MERAND and published by . This book was released on 1994 with total page 178 pages. Available in PDF, EPUB and Kindle. Book excerpt: AU COURS DE CE TRAVAIL NOUS AVONS UTILISE DIFFERENTES TECHNIQUES DE SPECTROMETRIE DE MASSE DESTINEES A RESOUDRE DES PROBLEMES ANALYTIQUES DANS LE DOMAINE DE LA STRUCTURE DES PROTEINES. DANS LE BUT DE GAGNER DU TEMPS ET DE LA SENSIBILITE DANS LES ANALYSES, NOUS AVONS DEVELOPPE LE COUPLAGE DE LA CHROMATOGRAPHIE LIQUIDE (HPLC) AVEC LA SPECTROMETRIE DE MASSE (MS) EN MODE FAB FAST ATOM BOMBARDMENT PAR L'INTERFACE FAB A FLUX CONTINU (CF/FAB). CE COUPLAGE A ETE REALISE AVEC DES COLONNES CAPILLAIRES DE DIAMETRE INTERNE 0,25 MM. IL S'EST AVERE ETRE BIEN ADAPTE A L'ETUDE DE MELANGES COMPLEXES DE PEPTIDES DE MASSES INFERIEURES A 5000 DA AVEC UNE SENSIBILITE DE L'ORDRE DE 20 A 200 PMOL POUR UN PEPTIDE DE MASSE 1000 DA. CETTE SENSIBILITE DECROIT AU FUR ET A MESURE QUE NOUS ELEVONS DANS LE DOMAINE DE MASSE. PAR LA SUITE, LES TECHNIQUES DE COUPLAGE DE L'HPLC AVEC LA SPECTROMETRIE DE MASSE, PAR L'INTERFACE CF/FAB MAIS AUSSI PAR L'INTERFACE ELECTROSPRAY (ESI), ONT ETE UTILISEES POUR L'ETUDE DE LA STRUCTURE PRIMAIRE ET DES MODIFICATIONS POST-TRADUCTIONNELLES DES PROTEINES H, T ET L DU COMPLEXE DE LA GLYCINE DECARBOXYLASE DES MITOCHONDRIES DES FEUILLES DE POIS. AINSI, LES ANALYSES DES FRAGMENTS ISSUS DE COUPURES CHIMIQUES OU ENZYMATIQUES DES PROTEINES H (14,1 KDA) ET T (40,9 KDA) ONT PERMIS DE VERIFIER LES SEQUENCES DE CES DEUX PROTEINES ETABLIES A PARTIR DE LEURS ADNC. NOUS AVONS AUSSI LOCALISER LA POSITION EXACTE DU COFACTEUR LIPOATE DE LA PROTEINE H. LA MESURE DE LA MASSE DE LA PROTEINE L (49,7 KDA) CONFIRME LA SEQUENCE DE LA PROTEINE. DE PLUS, ELLE MONTRE QU'IL N'Y A DE LIAISON COVALENTE NI ENTRE LES DEUX SOUS UNITES DE LA PROTEINE, NI ENTRE LA PROTEINE ET SON COFACTEUR, ET QUE LA PROTEINE L CONTIENT UNE MODIFICATION POST-TRADUCTIONNELLE DE 32 DA ENVIRON

Analysis of Protein Post-Translational Modifications by Mass Spectrometry

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Publisher : John Wiley & Sons
ISBN 13 : 1119250897
Total Pages : 377 pages
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Book Synopsis Analysis of Protein Post-Translational Modifications by Mass Spectrometry by : John R. Griffiths

Download or read book Analysis of Protein Post-Translational Modifications by Mass Spectrometry written by John R. Griffiths and published by John Wiley & Sons. This book was released on 2016-10-18 with total page 377 pages. Available in PDF, EPUB and Kindle. Book excerpt: Covers all major modifications, including phosphorylation, glycosylation, acetylation, ubiquitination, sulfonation and and glycation Discussion of the chemistry behind each modification, along with key methods and references Contributions from some of the leading researchers in the field A valuable reference source for all laboratories undertaking proteomics, mass spectrometry and post-translational modification research

ANALYSE STRUCTURALE DE PROTEINES PAR SPECTROMETRIE DE MASSE

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Total Pages : 206 pages
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Book Synopsis ANALYSE STRUCTURALE DE PROTEINES PAR SPECTROMETRIE DE MASSE by : CATHERINE.. DEON

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Mass Spectrometry of Proteins and Peptides

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Publisher : Humana Press
ISBN 13 : 9781607611042
Total Pages : 470 pages
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Book Synopsis Mass Spectrometry of Proteins and Peptides by : Mary S. Lipton

Download or read book Mass Spectrometry of Proteins and Peptides written by Mary S. Lipton and published by Humana Press. This book was released on 2008-11-01 with total page 470 pages. Available in PDF, EPUB and Kindle. Book excerpt: When the last edition of this book was published in 2000, the field of proteomics was in its infancy. At that time, multidimensional liquid chromatographic separations were being introduced as an alternative to traditional gel-based techniques for separating complex protein and peptide mixtures prior to mass spectrometric detection. Today, this approach – referred to as shotgun proteomics – is considered routine for lar- scale global analyses of protein mixtures. Now in its adolescence, proteomics is fundamentally transforming biological and medical research. Much of this transformation can be attributed to technological advancements, particularly in mass spectrometry. Much wider accessibility of hi- resolution and mass measurement accuracy instrumentation in recent years has ini- ated a new revolution in the field by providing more reliable data and shifting the focus from cataloging proteins to precisely quantifying changes in protein abundance over time and in response to stimuli. Advanced mass spectrometers and novel ion d- sociation schemes such as electron transfer/capture dissociation make it possible to venture boldly into the maze of protein posttranslational modifications, which are an integral component of understanding functional proteomics in the spatial and t- poral domains. Another area that has benefited from these advancements is top-down proteomics, an emerging method essential for characterizing various protein variants that has potentially high impact in biomedical research.

Computational Methods for Mass Spectrometry Proteomics

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Publisher : John Wiley & Sons
ISBN 13 : 9780470724293
Total Pages : 296 pages
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Book Synopsis Computational Methods for Mass Spectrometry Proteomics by : Ingvar Eidhammer

Download or read book Computational Methods for Mass Spectrometry Proteomics written by Ingvar Eidhammer and published by John Wiley & Sons. This book was released on 2008-02-28 with total page 296 pages. Available in PDF, EPUB and Kindle. Book excerpt: Proteomics is the study of the subsets of proteins present in different parts of an organism and how they change with time and varying conditions. Mass spectrometry is the leading technology used in proteomics, and the field relies heavily on bioinformatics to process and analyze the acquired data. Since recent years have seen tremendous developments in instrumentation and proteomics-related bioinformatics, there is clearly a need for a solid introduction to the crossroads where proteomics and bioinformatics meet. Computational Methods for Mass Spectrometry Proteomics describes the different instruments and methodologies used in proteomics in a unified manner. The authors put an emphasis on the computational methods for the different phases of a proteomics analysis, but the underlying principles in protein chemistry and instrument technology are also described. The book is illustrated by a number of figures and examples, and contains exercises for the reader. Written in an accessible yet rigorous style, it is a valuable reference for both informaticians and biologists. Computational Methods for Mass Spectrometry Proteomics is suited for advanced undergraduate and graduate students of bioinformatics and molecular biology with an interest in proteomics. It also provides a good introduction and reference source for researchers new to proteomics, and for people who come into more peripheral contact with the field.

UTILISATION DE LA SPECTROMETRIE DE MASSE ELECTROSPRAY POUR L'ETUDE STRUCTURALE DES PROTEINES

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Total Pages : 237 pages
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Book Synopsis UTILISATION DE LA SPECTROMETRIE DE MASSE ELECTROSPRAY POUR L'ETUDE STRUCTURALE DES PROTEINES by : Philippe Guy

Download or read book UTILISATION DE LA SPECTROMETRIE DE MASSE ELECTROSPRAY POUR L'ETUDE STRUCTURALE DES PROTEINES written by Philippe Guy and published by . This book was released on 1996 with total page 237 pages. Available in PDF, EPUB and Kindle. Book excerpt: NOUS DECRIVONS LES PROGRES RECENTS DE LA SPECTROMETRIE DE MASSE DANS L'ETUDE STRUCTURALE DES PROTEINES. NOS ETUDES ASSOCIENT LA DEGRADATION CHIMIQUE D'EDMAN, LES HYDROLYSES ENZYMATIQUES ET LES ANALYSES PAR ESIMS POUR RESOUDRE DES PROBLEMES SPECIFIQUES A LA CARACTERISATION DE LA STRUCTURE PRIMAIRE DES PROTEINES. AINSI NOUS MONTRONS QU'IL EST POSSIBLE DE PREPARER DES SELS D'AMMONIUM QUATERNAIRES D'ISOTHIOCYANATES PAR SYNTHESE CHIMIQUE ET DE LES UTILISER DANS LES CONDITIONS DE LA DEGRADATION D'EDMAN. LA DETECTION DES PRODUITS RESULTANTS EST REALISEE PAR ESIMS AFIN D'AMELIORER LA SENSIBILITE ET D'ASSURER LA CARACTERISATION DE CERTAINS RESIDUS. LA CONNAISSANCE DE LA STRUCTURE PRIMAIRE DES PROTEINES NOUS A CONDUIT A L'ETUDE DE LA LOCALISATION DES PONTS DISULFURES, RESPONSABLES EN PARTIE DU MAINTIEN DE LA STRUCTURE TRIDIMENSIONNELLE DES PROTEINES. UNE APPROCHE NOUVELLE UTILISANT LA TRIS-(2-CARBOXYETHYL) PHOSPHINE POUR LA REDUCTION DES PONTS DISULFURES ET LE N-HYDROXYMETHYL BENZAMIDE COMME METHODE D'ALKYLATION DES CYSTEINES LIBRES EN MILIEU ACIDE EST PRESENTEE. APRES AVOIR REALISE UNE ETUDE COMPARATIVE DE PEPTIDES LIES A L'AIDE D'UN PONT DISULFURE PAR SM AVEC DIVERS MODES D'IONISATION, NOUS AVONS IDENTIFIE CEUX DES PUROINDOLINES A ET B DE BLE. ENFIN, PAR ESIMS, NOUS AVONS OBTENU DES RENSEIGNEMENTS SUR LA STABILITE ET LA CONFORMATION DES CYTOCHROMES C#2 ET C#5#5#3 SAUVAGES ET MUTES. NOUS AVONS MIS EN EVIDENCE LA PRESENCE DE PLUSIEURS CONFORMERES DE PROTEINES PAR OBSERVATION DE LA DISTRIBUTION DES ETATS DE CHARGES ET PAR LA MESURE DES ECHANGES ISOTOPIQUES (H/D). NOUS AVONS AINSI CLASSE EN FONCTION DE LEUR STABILITE, LES MUTANTS DES DEUX CYTOCHROMES PAR RAPPORT AUX TYPES SAUVAGES. DE PLUS, NOUS AVONS MIS AU POINT ET REALISE L'ETUDE DES SITES DE DEUTERIATION DES HYDROGENES AMIDIQUES DU SQUELETTE POLYPEPTIDIQUE. CELLE-CI UTILISE LES ECHANGES ISOTOPIQUES SUIVIS D'UNE DIGESTION RAPIDE PAR LA PEPSINE PERMETTANT D'OBTENIR DES INFORMATIONS LOCALES SUR LA PENETRATION DU SOLVANT DEUTERIE DANS LA PROTEINE

Protein Sequencing and Identification Using Tandem Mass Spectrometry

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Publisher : Wiley-Interscience
ISBN 13 : 0471231886
Total Pages : 320 pages
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Book Synopsis Protein Sequencing and Identification Using Tandem Mass Spectrometry by : Michael Kinter

Download or read book Protein Sequencing and Identification Using Tandem Mass Spectrometry written by Michael Kinter and published by Wiley-Interscience. This book was released on 2005-04-12 with total page 320 pages. Available in PDF, EPUB and Kindle. Book excerpt: How to design, execute, and interpret experiments for protein sequencing using mass spectrometry The rapid expansion of searchable protein and DNA databases in recent years has triggered an explosive growth in the application of mass spectrometry to protein sequencing. This timely and authoritative book provides professionals and scientists in biotechnology research with complete coverage of procedures for analyzing protein sequences by mass spectrometry, including step-by-step guidelines for sample preparation, analysis, and data interpretation. Michael Kinter and Nicholas Sherman present their own high-quality, laboratory-tested protocols for the analysis of a wide variety of samples, demonstrating how to carry out specific experiments and obtain fast, reliable results with a 99% success rate. Readers will get sufficient experimental detail to apply in their own laboratories, learn about the proper selection and operation of instruments, and gain essential insight into the fundamental principles of mass spectrometry and protein sequencing. Coverage includes: Peptide fragmentation and interpretation of product ion spectra Basic polyacrylamide gel electrophoresis Preparation of protein digests for sequencing experiments Mass spectrometric analysis using capillary liquid chromatography Techniques for protein identification by database searches Characterization of modified peptides using tandem mass spectrometry And much more

Détection et localisation de modifications post-traductionnelles ou de mutations sur des protéines par spectrométrie de masse

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Total Pages : 212 pages
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Book Synopsis Détection et localisation de modifications post-traductionnelles ou de mutations sur des protéines par spectrométrie de masse by : Françoise Pratbernou

Download or read book Détection et localisation de modifications post-traductionnelles ou de mutations sur des protéines par spectrométrie de masse written by Françoise Pratbernou and published by . This book was released on 1990 with total page 212 pages. Available in PDF, EPUB and Kindle. Book excerpt: LA SPECTROMETRIE DE MASSE FAB OCCUPE A L'HEURE ACTUELLE UNE PLACE IMPORTANCE DANS L'ETUDE DES PROTEINES; ELLE TROUVE SA PLEINE UTILISATION DANS CERTAINES ANALYSES TRES DIFFICILES A REALISER PAR LES METHODES TRADITIONNELLES COMME LA LOCALISATION ET LA DETERMINATION DE MODIFICATIONS POST-TRADUCTIONNELLES ET DE MUTATIONS EN PATHOLOGIE HUMAINE. DES ANALYSES UTILISANT CONJOINTEMENT DES METHODES DE SPECTROMETRIE DE MASSE: FAB-MAPPING ET SPECTROMETRIE DE MASSE EN TANDEM ET DES DEGRADATIONS ENZYMATIQUES NOUS ONT PERMIS DE CARACTERISER DE NOUVEAUX MUTANTS DE L'HEMOGLOBINE (MUTANT GRENOBLE ET MUTANT R). LA STRATEGIE UTILISEE A ETE PREALABLEMENT TESTEE SUR DES MUTANTS CONNUS. L'IDENTIFICATION DE DEUX RESIDUS ACETYLE SUR DES ENZYMES ERYTHROCYTAIRES MPGM ET DPGM A ETE REALISE SELON DES STRATEGIES VOISINES. AFIN D'ESSAYER DE RESOUDRE LES PROBLEMES POSES PAR LA DESORPTION DE PEPTIDES EN MELANGE DANS LE MODE D'IONISATION FAB, NOUS AVONS, EN REGARD AVEC DES DONNEES DE LA LITTERATURE, REALISE UNE SERIE DE DERIVATIONS TENDANT A AUGMENTER L'HYDROPHOBIE DES DIFFERENTS CONSTITUANTS ET ACCROITRE AINSI LE RENDEMENT D'IONISATION. CETTE TECHNIQUE DE DERIVATION A PERMIS LA VISUALISATION DE LA TOTALITE DES PEPTIDES ISSUS DE LA CHAINE AINSI QUE L'IDENTIFICATION DE MODIFICATIONS POST-TRADUCTIONNELLES SUR LE PEPTIDE C TERMINAL DE LA TUBULINE QUI N'ETAIT PAS DESORBE A L'ETAT NATIF

Etude conformationnelle de peptides et protéines par mesure de mobilité ionique couplée à la spectrométrie de masse

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Book Synopsis Etude conformationnelle de peptides et protéines par mesure de mobilité ionique couplée à la spectrométrie de masse by : Florian Albrieux

Download or read book Etude conformationnelle de peptides et protéines par mesure de mobilité ionique couplée à la spectrométrie de masse written by Florian Albrieux and published by . This book was released on 2010 with total page 0 pages. Available in PDF, EPUB and Kindle. Book excerpt: Ce travail de thèse porte sur l'analyse conformationelle de biomolécules en phase gazeuse. L'étude d'objets complexes en phase gazeuse permet de connaître les facteurs intrinsèques stabilisant leur structure. La première étape de mes travaux a été le couplage entre un appareil de mobilité ionique (IMS) et un appareil de spectrométrie de masse (MS). Nous avons simulé (SimIon) et développé différentes optiques ioniques fonctionnant à haute pression (entonnoirs à ions, piège ionique). Ces modifications expérimentales nous ont permis de commencer des études conformationnelles de biomolécules en phase gazeuse.Les premières expériences avaient pour objectif d'observer les facteurs stabilisants une structure secondaire sur des séries de peptides analogues. La première étude a été réalisée sur des séries de polyalalanines et de polyglycines de formules Arg(Ala)4XxxAla4Lys et Arg(Gly)4Xxx(Gly)4Lys, où Xxx est l'un des 20 acides aminés naturels. Nous nous sommes intéressés à l'influence de l'acide aminé central sur la conformation globale. Puis nous avons observés la stabilité de l'hélice de la partie transmembranaire de la protéine M2 du virus de la grippe A et de différents mutants. Ces études ont permit de montrer l'importance de la solvatation des charges en phase gazeuse.Enfin nous avons initié une étude sur le repliement des protéines en utilisant une protéine modèle, le lysozyme. Nous nous sommes plus particulièrement intéressés aux mécanismes de repliements en fonction du degré d'oxydation de cette dernière.

Application du couplage chromatographie liquide-spectrométrie de masse à l'étude de la biodisponibilité de peptides issus de produits laitiers et à la protéomique

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Total Pages : 252 pages
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Book Synopsis Application du couplage chromatographie liquide-spectrométrie de masse à l'étude de la biodisponibilité de peptides issus de produits laitiers et à la protéomique by : François Delalande

Download or read book Application du couplage chromatographie liquide-spectrométrie de masse à l'étude de la biodisponibilité de peptides issus de produits laitiers et à la protéomique written by François Delalande and published by . This book was released on 2003 with total page 252 pages. Available in PDF, EPUB and Kindle. Book excerpt: Le couplage chromatographie liquide-spectrométrie de masse est devenu une méthode de choix pour la quantification de molécules dans une matrice, la détermination des séquences primaires de peptides et de protéines ainsi que la mise en évidence de modifications post-traductionnelles. Les progrès réalisés tant au niveau de la LC qu'au niveau de la spectrométrie de masse ont aussi révolutionné la biologie en permettant une identification sur des quantités femtomolaires de protéines séparées par électrophorèse bidimensionelle dans le cadre d'études protéomiques et la détection toujours plus sensible de molécules d'intérêt par exemple dans les fluides biologiques (plasma, urine, LCR).Mon travail de thèse a porté sur le choix et la mise au point de stratégies instrumentales et analytiques en optimisant de façon poussée tous les paramètres du couplage LC-MS et LC-MS-MS. La première partie concerne la mise au point expérimentale de techniques de microLC-MS et microLC-MS-MS pour la caractérisation de composés peptidiques et la mesure de leur biodisponibilité. La seconde partie porte sur le développement, l'optimisation et l'utilisation de la nano-LC-MS pour l'étude protéomique avec une première étude protéomique visant à caractériser les interactions entre le riz et le rice yellow mottle virus. Ce travail a permis par les techniques MALDI-MS et LC-MS-MS, de mettre en évidence les protéines du riz recrutées par les protéines de capside du virus et l'identification des protéines différentiellement exprimées selon la variété de riz (résistant/sensible). La seconde étude protéomique concerne la caractérisation de marqueurs d'expressions liés à l'anomalie "Mantled" chez le palmier à huile faisant appel au séquençage de novo. Pour conclure, nous avons utilisé les multiples potentiels du couplage microLC-MS et nanoLC-MS-MS pour répondre à différents problèmes biologiques. Ces réponses n'ont pu être obtenues que grâce à la mise au point de méthodologie particulière.

Protein Analysis using Mass Spectrometry

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Publisher : John Wiley & Sons
ISBN 13 : 1119359368
Total Pages : 282 pages
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Book Synopsis Protein Analysis using Mass Spectrometry by : Mike S. Lee

Download or read book Protein Analysis using Mass Spectrometry written by Mike S. Lee and published by John Wiley & Sons. This book was released on 2017-05-26 with total page 282 pages. Available in PDF, EPUB and Kindle. Book excerpt: Presents Practical Applications of Mass Spectrometry for Protein Analysis and Covers Their Impact on Accelerating Drug Discovery and Development Covers both qualitative and quantitative aspects of Mass Spectrometry protein analysis in drug discovery Principles, Instrumentation, Technologies topics include MS of peptides, proteins, and ADCs , instrumentation in protein analysis, nanospray technology in MS protein analysis, and automation in MS protein analysis Details emerging areas from drug monitoring to patient care such as Identification and validation of biomarkers for cancer, targeted MS approaches for biomarker validation, biomarker discovery, and regulatory perspectives Brings together the most current advances in the mass spectrometry technology and related method in protein analysis

Développement de la spectrométrie de masse appliquée au séquençage protéique en association avec la dégradation d'Edman

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ISBN 13 :
Total Pages : 279 pages
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Book Synopsis Développement de la spectrométrie de masse appliquée au séquençage protéique en association avec la dégradation d'Edman by : Armelle Buzy

Download or read book Développement de la spectrométrie de masse appliquée au séquençage protéique en association avec la dégradation d'Edman written by Armelle Buzy and published by . This book was released on 1993 with total page 279 pages. Available in PDF, EPUB and Kindle. Book excerpt: LE BUT DE CE TRAVAIL EST DE DEVELOPPER DES STRATEGIES ANALYTIQUES UTILISANT DIFFERENTES TECHNIQUES DE SPECTROMETRIE DE MASSE (SM) EN ASSOCIATION AVEC LA DEGRADATION D'EDMAN POUR LE SEQUENCAGE PROTEIQUE. LA PREMIERE PARTIE DU TRAVAIL A PERMIS D'ESTIMER LES POSSIBILITES DE METHODES DE SM EN TANDEM POUR LA DETERMINATION DE LA SEQUENCE DE PETITS PEPTIDES. DANS LA DEUXIEME PARTIE DU TRAVAIL, LA SOUS-UNITE AA6 DE L'HEMOCYANINE DU SCORPION ANDROCTONUS AUSTRALIS A ETE CHOISIE COMME MODELE D'ETUDE. LES HEMOCYANINES SONT DES PIGMENTS RESPIRATOIRES PRESENTS CHEZ LES MOLLUSQUES ET ARTHROPODES. LA SOUS-UNITE AA6 A ETE SCINDEE CHIMIQUEMENT ET ENZYMATIQUEMENT. LES PEPTIDES OBTENUS ONT ETE ANALYSES PAR SM ET DEGRADATION D'EDMAN. LA SM A APPORTE DES DONNEES SOUVENT INDISPENSABLES A LA DEGRADATION D'EDMAN EN LEVANT DES INCERTITUDES SUR LA TAILLE DES PEPTIDES ET SUR L'IDENTITE DE CERTAINS RESIDUS. CERTAINS PETITS PEPTIDES ONT ETE CARACTERISES DIRECTEMENT PAR SM EN TANDEM. TOUS LES PEPTIDES ONT ETE POSITIONNES GRACE AUX HOMOLOGIES AVEC DES SEQUENCES D'HEMOCYANINES D'AUTRES ARTHROPODES. TROIS PONTS DISULFURES ONT ETE REVELES ET LOCALISES PAR L'ETUDE EN SM DE LA PROTEINE SOUS SES FORMES NATIVE, ALKYLEE ET REDUITE-ALKYLEE. LES ETUDES REALISEES ONT CONDUIT A LA SEQUENCE COMPLETE DE LA PROTEINE (626 RESIDUS, 72 KDA) ET A LA MISE AU POINT D'UNE METHODOLOGIE UTILISANT CONJOINTEMENT LE SEQUENCAGE CHIMIQUE ET LA SM. LA TROISIEME PARTIE DU TRAVAIL A PORTE SUR L'ETUDE DE LA SEQUENCE DE LA CATALASE DE LA BACTERIE PROTEUS MIRABILIS. LA SEQUENCE N-TERMINALE PROPOSEE PAR GENETIQUE MOLECULAIRE (307 RESIDUS) A ETE VERIFIEE ET LA SEQUENCE C-TERMINALE (177 RESIDUS) DETERMINEE

Sequencing of Proteins and Peptides

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ISBN 13 : 9780444810229
Total Pages : 425 pages
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Book Synopsis Sequencing of Proteins and Peptides by : G. Allen

Download or read book Sequencing of Proteins and Peptides written by G. Allen and published by . This book was released on 1989 with total page 425 pages. Available in PDF, EPUB and Kindle. Book excerpt: Although there is a continuing high level of activity in direct studies on protein primary structures, the requirement for partial sequences has provided a major impetus for the development and dissemination of highly sensitive techniques. While retaining the still applicable formidable basis of the original volume, this Revised Edition reflects the shift towards the use of more sophisticated automated high-performance chromatographic techniques. Sequencing of Proteins and Peptides provides you with the most up-to-date information selected to be the most appropriate for laboratory or reference use since, as in the first edition, it is impossible to cover the field of protein sequence determination fully. New information covers: #FABMS #protein recovery methods #Amino acid analysis #Tandem, plasma description, FAB, and Thermospray mass spectrometry. As in the First edition, Appendixes give information on manufacturers and supplies, purification, and safety in the lab.

APPLICATION DE LA SPECTROMETRIE DE MASSE A LA DETERMINATION DES SEQUENCES DE PEPTIDES ET DE PROTEINES

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Total Pages : 378 pages
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Book Synopsis APPLICATION DE LA SPECTROMETRIE DE MASSE A LA DETERMINATION DES SEQUENCES DE PEPTIDES ET DE PROTEINES by : BERNARD.. VERNEUIL

Download or read book APPLICATION DE LA SPECTROMETRIE DE MASSE A LA DETERMINATION DES SEQUENCES DE PEPTIDES ET DE PROTEINES written by BERNARD.. VERNEUIL and published by . This book was released on 1982 with total page 378 pages. Available in PDF, EPUB and Kindle. Book excerpt:

ANALYSES STRUCTURALES DE PROTEINES ET DE COMPLEXES DE COORDINATION PAR SPECTROMETRIE DE MASSE

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Book Synopsis ANALYSES STRUCTURALES DE PROTEINES ET DE COMPLEXES DE COORDINATION PAR SPECTROMETRIE DE MASSE by : FRANCIS.. BITSCH

Download or read book ANALYSES STRUCTURALES DE PROTEINES ET DE COMPLEXES DE COORDINATION PAR SPECTROMETRIE DE MASSE written by FRANCIS.. BITSCH and published by . This book was released on 1991 with total page pages. Available in PDF, EPUB and Kindle. Book excerpt: LE BUT DE NOTRE THESE A ETE DE DEVELOPPER DES METHODES ET DE STRATEGIES D'ANALYSES STRUCTURALES DE PEPTIDES, DE PROTEINES ET DE COMPLEXES DE COORDINATION PAR SPECTROMETRIE DE MASSE. L'ETUDE DES MASSIFS ISOTOPIQUES NOUS A PERMIS DE DETERMINER LES CONDITIONS D'UTILISATION DES MESURES DE MASSE MONOISOTOPIQUES ET MOYENNES. NOUS AVONS ETUDIE DANS QUELLES CONDITIONS CES MESURES PERMETTAIENT DE METTRE EN EVIDENCE DES MODIFICATIONS COURAMMENT RENCONTREES SUR DES PROTEINES. L'INTERPRETATION DES FRAGMENTATIONS DES IONS PEPTIDIQUES EN LSIMS NOUS A PERMIS D'OBTENIR DES INFORMATIONS DE SEQUENCE PEPTIDIQUE SUR DES VARIANTS DE L'HIRUDINE RECOMBINANTE AINSI QUE SUR DES PEPTIDES DE COUPURES DE LA PROTAMINE SP DE SEICHE. L'ETUDE DE LA FRAGMENTATIONS DES LIAISONS DISULFURES EN LSIMS NOUS ONT PERMIS DE PROPOSER UNE NOUVELLE STRATEGIE DANS L'ATTRIBUTION DES PONTS DISULFURES; CELLE-CI A ETE APPLIQUEE A LA DETERMINATION DES PONTS DISULFURES DE LA DEFENSINE A NATURELLE ET RECOMBINANTE. NOUS AVONS APPLIQUE L'IONISATION PAR ELECTROSPRAY (ES-MS) A LA CARACTERISATION DE PEPTIDES ET DE PROTEINES INTACTES, NATURELLES OU PRODUITES PAR LA SYNTHESE CHIMIQUE OU LE GENIE GENETIQUE. L'UTILISATION DE LA FAB-MS ET DE L'ES-MS NOUS A PERMIS D'ELUCIDER LES STRUCTURES DE COMPLEXES DE COORDINATION MACROMOLECULAIRES (CARTENATES) POUR LESQUELS LA CARACTERISATION EST DIFFICILE PAR LES METHODES ACTUELLES D'ANALYSE (R.M.N.)

Protein and Peptide Analysis by Mass Spectrometry

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Publisher : Humana Press
ISBN 13 : 9781489940735
Total Pages : 350 pages
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Book Synopsis Protein and Peptide Analysis by Mass Spectrometry by : John R. Chapman

Download or read book Protein and Peptide Analysis by Mass Spectrometry written by John R. Chapman and published by Humana Press. This book was released on 2013-08-11 with total page 350 pages. Available in PDF, EPUB and Kindle. Book excerpt: The purpose of the preface is to explain the book's objectives and how to use it; give warnings, disclaimers, and the like.* The main objective of Protein and Peptide Analysis by Mass Spec trometry is quite straightforward—to present authoritative, up-to-date, and practical accounts of the use of mass spectrometry in the analysis of pep tides and proteins. How to use it? Every reader will have their own particular interests and will surely be drawn toward the chapters that cover these interests. Within the remaining chapters, however, techniques are described with analytical possibilities that such a reader can then only guess at. So, read the book fully. Again, as is customary in the Methods in Molecular Biology series, the chapter format (Introduction, Materials, Methods, and Notes) allows the authors to introduce the techniques, to explain their relevance and applicability, and, above all, to provide detail—detail that represents each author's accumulated experience and enables the reader to use and benefit from these methods. So, read the book fully, and read it diligently. Warnings and disclaimers: Mass spectrometry today offers the pro tein chemist ready access to a wealth of information that is otherwise avail able only with great difficulty, or perhaps not at all. With this goal in sight, any warnings and disclaimers will almost surely be ignored. So, a warning anyway; the use of mass spectrometry might be habit forming.