Développement de chimie de surface pour la réduction de l'adsorption non-spécifique de lysat cellulaire et application clinique de biocapteurs SPR

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Book Synopsis Développement de chimie de surface pour la réduction de l'adsorption non-spécifique de lysat cellulaire et application clinique de biocapteurs SPR by : Alexandra Aubé

Download or read book Développement de chimie de surface pour la réduction de l'adsorption non-spécifique de lysat cellulaire et application clinique de biocapteurs SPR written by Alexandra Aubé and published by . This book was released on 2016 with total page pages. Available in PDF, EPUB and Kindle. Book excerpt: Le travail présenté dans cette thèse porte sur le développement de chimie de surface et de biocapteurs pouvant être utilisés dans le milieu hospitalier afin d'améliorer les méthodes de dépistages et de suivi de traitement de diverses maladies et cancers. Les méthodes actuelles de dépistage du cancer reposent principalement sur l'analyse histologique des cellules par des experts dans le domaine. Cela complique la transmission de l'information au patient et retarde le moment où un traitement approprié peut être entamé. Grâce à de nouvelles techniques d'analyses simples et peu coûteuses comme la spectroscopie de résonance des plasmons de surface (SPR), il est possible de développer des tests qui pourront être effectués par le personnel de l'hôpital, en peu de temps et à peu de frais. Afin de pouvoir utiliser la SPR en milieu clinique, une chimie de surface appropriée doit être développée afin d'empêcher les matrices biologiques de masquer le signal des analytes d'intérêt. En effet, qu'il s'agisse de lysat cellulaire, de sérum ou de tout autre fluide biologique, le contenu protéique et lipidique peut s'adsorber de façon non-spécifique aux surfaces d'analyse, compromettant ainsi les résultats obtenus. Afin de pallier ce problème, le développement de chimie de surface a été effectué. Des monocouches de peptides et de liquides ioniques ont été utilisées afin de réduire l'adsorption non-spécifique de lysat cellulaire non-dilué sur des capteurs SPR. Parmi les peptides, le plus efficace s'est avéré être le 3 MPA (His)2(Leu)2(Phe)2 OH, un peptide chargé positivement formé de 6 acides aminés plutôt hydrophobes. Grâce à cette surface, l'adsorption non-spécifique de lysat cellulaire a pu être réduite jusqu'à 159 ± 27 ng/cm2, par rapport à 929 ± 186 ng/cm2 sur une surface d'or non protégée. Une étude en spectrométrie de masse a permis de mieux comprendre le phénomène d'adsorption non-spécifique de lysat cellulaire et de confirmer que ce sont principalement des lipides qui s'adsorbent non-spécifiquement au capteur SPR lorsque celui-ci est exposé à du lysat cellulaire. Malgré la nette amélioration par rapport à un capteur non protégé, le phénomène d'adsorption non-spécifique était encore significativement présent avec les monocouches de peptides. L'adsorption non-spécifique de lysat cellulaire a ensuite été drastiquement réduite grâce aux liquides ioniques hydrophobes et chargés. Le liquide ionique le plus performant a montré une adsorption non-spécifique d'à peine 2 ± 2 ng/cm2. Par la suite, un biocapteur permettant la détection de HER2, un biomarqueur de cancer du sein présent dans environ 30% des cas de cancers du sein agressifs, a été développé. Cela a permis de démontrer que le liquide ionique pouvait être utilisé pour la construction d'un biocapteur, ouvrant ainsi la porte à un large domaine d'analyses en lysat cellulaire. Finalement, les défis de l'analyse SPR avec des échantillons cliniques ont été explorés par le développement d'un biocapteur pour l'anti-asparaginase, permettant de faire le suivi de traitement de patients atteints de leucémie. L'asparaginase est administrée aux patients leucémiques, en combinaison avec plusieurs autres composés chimiothérapiques, afin de combattre ce cancer. Toutefois, plusieurs patients ont une réaction allergique à cette protéine de source bactérienne, mais ne démontrent pas de symptômes physiques. Le biocapteur développé visait donc à détecter les réactions immunitaires des patients afin de modifier leur traitement lorsque cela s'avère nécessaire. Un biocapteur pour la détection de l'anti-asparaginase dans le sérum non-dilué de patients leucémiques a donc été développé. Des échantillons cliniques ont été étudiés et les résultats obtenus pour le nouveau biocapteur SPR ont montré une bonne concordance avec les résultats obtenus en ELISA.

Développement d'outils analytiques pour la détection de biomolécules directement dans des fluides sanguins

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Book Synopsis Développement d'outils analytiques pour la détection de biomolécules directement dans des fluides sanguins by : Julien Breault-Turcot

Download or read book Développement d'outils analytiques pour la détection de biomolécules directement dans des fluides sanguins written by Julien Breault-Turcot and published by . This book was released on 2015 with total page pages. Available in PDF, EPUB and Kindle. Book excerpt: Cette thèse porte sur le développement de biocapteurs basés sur la technique de résonance des plasmons de surface (SPR) pour effectuer des analyses directement dans un fluide sanguin n'ayant subi aucune purification ou dilution. L'ensemble des biocapteurs discutés exploiteront un instrument SPR portable développé dans le groupe du professeur Masson. Le premier volet de la thèse portera sur le processus d'interférence lié à l'adsorption non spécifique du sérum à la surface du capteur. L'analyse des biomolécules adsorbées sera effectuée en combinant la SPR à la spectrométrie de masse. Les informations obtenues seront exploitées pour la construction de biocapteurs adaptés à l'analyse en milieu sanguin. Un premier biocapteur développé ciblera la protéine antigène prostatique spécifique (APS) contenue dans le sérum servant de biomarqueur pour dépister le cancer de la prostate. Pour détecter les faibles concentrations de cette protéine directement dans le sérum, un matériel plasmonique microstructuré sera utilisé pour amplifier les signaux obtenus et sera recouvert d'une monocouche peptidique minimisant l'adsorption non spécifique du sérum. L'instrument SPR aura été adapté pour permettre également la détection simultanée de fluorescence. Un test ELISA sera ainsi effectué en parallèle du test SPR. Chacune des techniques fournira un contrôle pour la deuxième, tout en permettant de détecter le biomarqueur au niveau requis pour dépister la maladie. La combinaison des deux méthodes permettra aussi d'élargir la gamme dynamique du test de dépistage. Pour terminer, l'instrument SPR portable sera utilisé dans le cadre de détection de petites biomolécules ayant un potentiel thérapeutique directement dans un échantillon de sang. Des peptides ayant une activité anti-athérosclérotique pourront ainsi être détectés à même un échantillon de sang ni purifié ni dilué, et ce à des concentrations de l'ordre du micromolaire. Une modification de la microfluidique via l'introduction d'une membrane poreuse au cœur de celle-ci sera la clé permettant d'effectuer de telles analyses. La présente thèse met de l'avant de nouvelles stratégies et des modifications instrumentales permettant d'analyser des protéines et des petites molécules directement dans un échantillon non purifié de sérum ou de sang. Les modifications apportées au système fluidique, à l'instrument SPR et au niveau du biocapteur employé permettront d'effectuer des biodétections dans des matrices aussi complexes que les fluides sanguins. Les présents travaux mettent en lumière la capacité d'un instrument SPR/fluorescence portable à faire en 12 minutes la biodétection d'un marqueur du cancer de la prostate directement dans un échantillon de sérum. Finalement, on rapporte ici un des premiers articles où un biocapteur SPR est utilisé à même un échantillon de sang non-purifié pour faire des biodétections.

Couplage d'un instrument SPR portable à un bioréacteur

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Book Synopsis Couplage d'un instrument SPR portable à un bioréacteur by : Philippe Blain

Download or read book Couplage d'un instrument SPR portable à un bioréacteur written by Philippe Blain and published by . This book was released on 2020 with total page pages. Available in PDF, EPUB and Kindle. Book excerpt: Même si les anticorps sont plus connus pour leur capacité à neutraliser les agents infectieux en se liant aux antigènes via leurs paratopes, leurs fragments cristallisables (Fc) sont aussi impliqués dans la signalisation des réponses immunitaires en se liant à des récepteurs spécifiques. Les interactions entre les récepteurs et les anticorps sont reconnues pour être affectées par la glycosylation des anticorps. Pour observer la cinétique de telles interactions biologiques, une des méthodes les plus utilisées est la spectroscopie de résonance des plasmons de surface (SPR). La synthèse et l'analyse, via SPR, d'anticorps en laboratoire sont un procédé long et exigeant si toutes les étapes sont réalisées manuellement. La possibilité d'effectuer le couplage d'un appareil SPR commercial à un bioréacteur pourrait être envisagée, mais le coût d'achat et d'opération d'un tel appareil SPR limiterait l'utilité d'un tel projet pour une possible utilisation à plus grande échelle. C'est pourquoi le couplage d'un appareil SPR de faible coût et d'un bioréacteur serait avantageux. Cela permettrait de superviser la synthèse des anticorps et leur affinité au récepteur en temps ''réel''. Ce mémoire de maîtrise explorera le développement de deux des composantes nécessaires pour la réalisation de ce couplage entre le SPR et un bioréacteur, soit la chimie de surface pour passiver le capteur SPR et un algorithme d'optimisation par nuée de particules (Particles swarm Optimisation) évolutive. L'algorithme réalisera une corrélation du signal obtenue d'un instrument P4-SPR aux équations cinétiques décrivant les interactions entre les anticorps et leurs récepteurs dans le but d'obtenir les constantes cinétiques et thermodynamiques (Kd,kon,koff). De plus, ce mémoire présentera une étude qui a été réalisée afin de minimiser l'adsorption non spécifique des molécules composant le biocapteur et maximiser le signal de l'anticorps Trastuzumab (TZM), utilisé dans le couplage de l'instrument P4-SPR au bioréacteur, sur des monocouches de composition variée.