ETUDE PAR RMN 2D DE LA STRUCTURE TRIDIMENSIONNELLE EN SOLUTION AQUEUSE, DE PROTEINES DE TRANSFERT DE LIPIDES, ET DE LEURS INTERACTIONS AVEC LES LIPIDES

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Book Synopsis ETUDE PAR RMN 2D DE LA STRUCTURE TRIDIMENSIONNELLE EN SOLUTION AQUEUSE, DE PROTEINES DE TRANSFERT DE LIPIDES, ET DE LEURS INTERACTIONS AVEC LES LIPIDES by : MARIE-CHRISTINE.. PETIT

Download or read book ETUDE PAR RMN 2D DE LA STRUCTURE TRIDIMENSIONNELLE EN SOLUTION AQUEUSE, DE PROTEINES DE TRANSFERT DE LIPIDES, ET DE LEURS INTERACTIONS AVEC LES LIPIDES written by MARIE-CHRISTINE.. PETIT and published by . This book was released on 1994 with total page 168 pages. Available in PDF, EPUB and Kindle. Book excerpt: LES PROTEINES DE TRANSFERT DE LIPIDES (NS-LTP) D'ORIGINE VEGETALE, FORMENT UNE FAMILLE DE PETITES PROTEINES (ENVIRON 9000 DALTONS), BASIQUES, QUI COMPRENNENT DANS LEURS SEQUENCES HUIT CYSTEINES ORGANISEES EN QUATRE PONTS DISULFURE. LE ROLE BIOLOGIQUE DE CES PROTEINES EST ENCORE MAL CONNU. IN VITRO, ELLES TRANSFERENT LES LIPIDES D'UNE MEMBRANE ARTIFICIELLE A UNE AUTRE. CE TRAVAIL PRESENTE LA DETERMINATION PAR RESONANCE MAGNETIQUE NUCLEAIRE (RMN), DE LA STRUCTURE TRIDIMENSIONNELLE EN SOLUTION DE LA NS-LTP EXTRAITE DU MAIS. DANS CE BUT DES EXPERIENCES DE RMN 2D DU TYPE TQF COSY ET COSY DQ, ONT ETE UTILISEES POUR RESOUDRE LES PROBLEMES D'ATTRIBUTION DES SPECTRES, INHERENTS A LA REPETITION DE CERTAINS ACIDES AMINES (SER, ALA, GLY). A PARTIR DES CONTRAINTES DEDUITES DES EXPERIENCES NOESY, LA STRUCTURE DE LA NS-LTP DE MAIS PU ETRE MODELISEE. IL S'AGIT D'UN ENROULEMENT DROIT DE QUATRE HELICES. AFIN D'APPREHENDER LES RELATIONS STRUCTURE/FONCTION DE CES PROTEINES, DES ETUDES ONT ETE ENTREPRISES SUR LES INTERACTIONS ENTRE LA NS-LTP DE MAIS ET DES PHOSPHOLIPIDES TELS QUE LA LYSOLAUROYL-PHOSPHATIDYLCHOLINE ET LA LYSO-PALMITOYL-PHOSPHATIDYLCHOLINE. POUR POUVOIR ETABLIR UNE COMPARAISON AVEC UNE PROTEINE DE LA MEME FAMILLE, DONT LA STRUCTURE A ETE RESOLUE AU LABORATOIRE, CES MEMES ETUDES ONT ETE REALISEES AVEC LA NS-LTP DE BLE. LES DONNEES DE LA RMN SUGGERENT UNE FIXATION DU LIPIDE A L'INTERIEUR DES POCHES HYDROPHOBES DES DEUX PROTEINES

MODELISATION DE LA STRUCTURE TRIDIMENSIONNELLE DE MACROMOLECULES A PARTIR DE DONNEES RMN

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Book Synopsis MODELISATION DE LA STRUCTURE TRIDIMENSIONNELLE DE MACROMOLECULES A PARTIR DE DONNEES RMN by : EDITH.. GINCEL

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STRUCTURE ET ACTIVITE DES PROTEINES DE TRANSFERT DE LIPIDES (LTP)

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Book Synopsis STRUCTURE ET ACTIVITE DES PROTEINES DE TRANSFERT DE LIPIDES (LTP) by : JEROME.. GOMAR

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DETERMINATION, PAR RMN, DE LA STRUCTURE TRIDIMENSIONNELLE DES PEPTIDES ET DES PROTEINES

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Book Synopsis DETERMINATION, PAR RMN, DE LA STRUCTURE TRIDIMENSIONNELLE DES PEPTIDES ET DES PROTEINES by : YINSHAN.. YANG

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ETUDE PAR RMN DE DOMAINES INTERFACIAUX DE PETITES PROTEINES MEMBRANAIRES

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Book Synopsis ETUDE PAR RMN DE DOMAINES INTERFACIAUX DE PETITES PROTEINES MEMBRANAIRES by : Véronica Beswick

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ETUDES STRUCTURALES PAR RMN ET MODELISATION MOLECULAIRE D'UNE PROTEINE ANTIMICROBIENNE D'ORIGINE VEGETALE ET D'UN COMPLEXE ENTRE UNE PROTEINE VEGETALE DE TRANSFERT DE LIPIDES (LTP) ET LA PROSTAGLANDINE B 2

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Book Synopsis ETUDES STRUCTURALES PAR RMN ET MODELISATION MOLECULAIRE D'UNE PROTEINE ANTIMICROBIENNE D'ORIGINE VEGETALE ET D'UN COMPLEXE ENTRE UNE PROTEINE VEGETALE DE TRANSFERT DE LIPIDES (LTP) ET LA PROSTAGLANDINE B 2 by : SEVERINE.. MOINDROT

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ETUDE PAR RESONANCE MAGNETIQUE NUCLEAIRE 2D ET 3D DE LA STRUCTURE TRIDIMENSIONNELLE DE LA BOITE A DE LA PROTEINE HMG1

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Book Synopsis ETUDE PAR RESONANCE MAGNETIQUE NUCLEAIRE 2D ET 3D DE LA STRUCTURE TRIDIMENSIONNELLE DE LA BOITE A DE LA PROTEINE HMG1 by : YUMIKO.. OHYAMA

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DETERMINATION DE LA STRUCTURE TRIDIMENSIONNELLE DE PROTEINES EN SOLUTION PAR R.M.N.

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Book Synopsis DETERMINATION DE LA STRUCTURE TRIDIMENSIONNELLE DE PROTEINES EN SOLUTION PAR R.M.N. by : REMI.. LE GOAS

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ETUDES STRUCTURALES DES PROTEINES DE TRANSFERT DE LIPIDES DU MAIS ET DU BLE

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Book Synopsis ETUDES STRUCTURALES DES PROTEINES DE TRANSFERT DE LIPIDES DU MAIS ET DU BLE by : DELPHINE.. CHARVOLIN

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ETUDE STRUCTURALE DE L'APO-NEOCARZINOSTATINE ET DU COMPLEXE APO-NEOCARZINOSTATINE/DAUNOMYCINE PAR RMN 2D DU PROTON ET MODELISATION MOLECULAIRE

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Book Synopsis ETUDE STRUCTURALE DE L'APO-NEOCARZINOSTATINE ET DU COMPLEXE APO-NEOCARZINOSTATINE/DAUNOMYCINE PAR RMN 2D DU PROTON ET MODELISATION MOLECULAIRE by : ELISABETH.. ADJADJ

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ETUDE STRUCTURALE PAR RMN DE PEPTIDES ET PROTEINES DU SYSTEME VASOREGULATEUR

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Book Synopsis ETUDE STRUCTURALE PAR RMN DE PEPTIDES ET PROTEINES DU SYSTEME VASOREGULATEUR by : PHILIPPE.. SIZUN

Download or read book ETUDE STRUCTURALE PAR RMN DE PEPTIDES ET PROTEINES DU SYSTEME VASOREGULATEUR written by PHILIPPE.. SIZUN and published by . This book was released on 1991 with total page pages. Available in PDF, EPUB and Kindle. Book excerpt: L'OBJECTIF PRINCIPAL DE CE TRAVAIL EST DE MONTRER COMMENT LA RESONANCE MAGNETIQUE NUCLEAIRE (RMN) PERMET D'ACCEDER A LA STRUCTURE TRIDIMENSIONNELLE DE PEPTIDES ET DE PROTEINES EN SOLUTION. L'ETUDE COMPAREE DE COMPOSES VASOREGULATEURS ALLANT DE PETITS PEPTIDES HORMONAUX A UNE PROTEINE DE 65 RESIDUS, L'HIRUDINE A PERMIS DE DEGAGER LES STRATEGIES 1D ET 2D LES PLUS APPROPRIEES. IL EST APPARU QUE LA TAILLE DU PEPTIDE JOUE UN ROLE FONDAMENTAL DANS LA PROBABILITE DE STRUCTURATION EN SOLUTION, L'ABSENCE DE COOPERATIVITE LIMITANT AINSI LA MOBILITE STRUCTURALE DE PETITS PEPTIDES. CETTE DERNIERE CROIT DES QUE LA TAILLE AUGMENTE OU QUE DES POINTS DE BLOCAGE CONFORMATIONNELS (PONTS DISULFURE) EXISTENT. POUR UNE PROTEINE TELLE QUE L'HIRUDINE, LA COMBINAISON DES DONNEES RMN EXTRAITE D'EXPERIENCES SPECIFIQUES (DEPLACEMENTS CHIMIQUES CONSTANTES DE COUPLAGE, EFFETS OVERHAUSER, ACCESSIBILITE DES PROTONS AMIDES) ET DE LA MODELISATION MOLECULAIRE CONTRAINTE A PERMIS DE PROPOSER UNE STRUCTURE 3D EN SOLUTION. UNE ANALYSE COMPARATIVE DES STRUCTURES OBTENUES ET DE CELLES PREVISIBLES GRACE AUX METHODES DE PREDICTION A MIS EN LUMIERE LA NOTION DE PREDISPOSITION CONFORMATIONNELLE POUVANT SERVIR DE BASE AUX ETUDES DE RELATION STRUCTURE-ACTIVITE

Caractérisation d'une protéine de fixation de lipides du blé dur (purification, séquençage, ADN complémentaire)

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Book Synopsis Caractérisation d'une protéine de fixation de lipides du blé dur (purification, séquençage, ADN complémentaire) by : François-Paul Monnet

Download or read book Caractérisation d'une protéine de fixation de lipides du blé dur (purification, séquençage, ADN complémentaire) written by François-Paul Monnet and published by . This book was released on 1990 with total page 242 pages. Available in PDF, EPUB and Kindle. Book excerpt: DANS LE CADRE DE L'ETUDE DES INTERACTIONS LIPIDES/PROTEINS DU BLE DUR, TROIS PROTEINES ONT ETE PURIFIEES. LA PREMIERE (7KDA) EST CAPABLE DE REALISER IN VITRO UN TRANSFERT DE LIPIDES ENTRE DES LIPOSOMES ET DES MITOCHONDRIES ET EST NOMMEE PROTEINE DE TRANSFERT DE LIPIDES DE 7KDA OU 7KDA LTP (LIPID TRANSFER PROTEIN). LES DEUX AUTRES PROTEINES (9KDA) MONTRENT DES COMPOSITIONS EN ACIDES AMINES SIMILAIRES A CELLES DE LTPS D'ORIGINE VEGETALE PRECEDEMMENT CARACTERISEES. UNE HELICE ALPHA A CARACTERE AMPHIPHILE EST PREDITE DU COTE N-TERMINAL DE LA LTP 7KDA QUI POURRAIT EXPLIQUER L'ACTIVITE DE TRANSFERT DE LIPIDES ASSOCIEE. POUR LES LTPS 9KDA AUCUNE STRUCTURE DE CE TYPE N'A ETE MISE EN EVIDENCE. LA LTP 7KDA EST SYNTHETISEE SOUS LA FORME D'UN PRECURSEUR DE PLUS FORTE MASSE MOLECULAIRE, L'EXTENSION N-TERMINALE PRESENTANT LES CARACTERISTIQUES D'UN PEPTIDE SIGNAL. LES LTPS SEMBLENT DONC TRAVERSER LA MEMBRANE DU R.E. ET CECI SEMBLE INCOMPATIBLE AVEC UN ROLE DE TRANSPORTEUR CYTOSOLIQUE DE LIPIDES IN VIVO. LES LTPS SONT SEMBLABLES AUX INHIBITEURS D'ALPHA-AMYLASE/TRYPSINE DES CEREALES DU POINT DE VUE DE LEUR FAIBLE MASSE MOLECULAIRE, LEUR ORGANISATION AUTOUR D'UN SQUELETTE CYSTEINE CONSERVE, LEUR SYNTHESE SOUS FORME D'UN PRECURSEUR COMPRENANT UN PEPTIDE SIGNAL ET LEURS PROPRIETES D'INTERACTION AVEC LES LIPIDES. L'ETUDE DU ROUTAGE ET DE LA LOCALISATION DE CES LTPS SERA POURSUIVIE

NOUVELLES METHODES POUR LA MODELISATION DE STRUCTURES TRIDIMENSIONNELLES DE MOLECULES EN SOLUTION EN RELATION AVEC LES DONNEES DE LA RMN 2D

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Book Synopsis NOUVELLES METHODES POUR LA MODELISATION DE STRUCTURES TRIDIMENSIONNELLES DE MOLECULES EN SOLUTION EN RELATION AVEC LES DONNEES DE LA RMN 2D by : BERNARD.. STAWARZ

Download or read book NOUVELLES METHODES POUR LA MODELISATION DE STRUCTURES TRIDIMENSIONNELLES DE MOLECULES EN SOLUTION EN RELATION AVEC LES DONNEES DE LA RMN 2D written by BERNARD.. STAWARZ and published by . This book was released on 1990 with total page pages. Available in PDF, EPUB and Kindle. Book excerpt: LA RESONANCE MAGNETIQUE NUCLEAIRE (RMN) PERMET D'APPORTER UN GRAND D'INFORMATIONS SUR LA STRUCTURE MOLECULAIRE. LA RMN DU PROTON #1H PERMET D'ACCEDER AUX DISTANCES INTERPROTONS EN UTILISANT LES EFFETS OVERHAUSER OU NOE. CES NOE SONT UTILISES POUR MODELISER LES STRUCTURES MOLECULAIRES PAR MECANIQUE OU DYNAMIQUE MOLECULAIRE AVEC OU SANS CONTRAINTES. LES STRUCTURES OBTENUES SONT, EN GENERAL, RAFFINEES PAR DES METHODES DE CALCUL EN RETOUR QUI CONSISTENT A MINIMISER UNE FONCTION DU TYPE (A-A#0)#2 OU A#0 REPRESENTE LA VALEUR EXPERIMENTALE. CE TRAVAIL CONSISTE A DEVELOPPER UNE METHODE GLOBALE D'OPTIMISATION DE STRUCTURE UTILISANT DIRECTEMENT LES INTENSITES NOE. UN NOUVEAU POTENTIEL DE CONTRAINTE A ETE INTEGRE DANS UN PROGRAMME DE CALCUL APPELE MUNIC (MODELLING USING NOE INTENSITY CONSTRAINT) S'ARTICULANT AUTOUR DU LOGICIEL DE MODELISATION MOLECULAIRE GROMOS. CETTE NOUVELLE TECHNIQUE A ETE APPLIQUEE A L'ETUDE DE LA STRUCTURE TRIDIMENSIONNELLE DE LA STENDOMYCINE, LIPOPEPTIDE CYCLIQUE ANTIFONGIQUE. LES QUALITES DE CONVERGENCE DU POTENTIEL DE CONTRAINTE DEVELOPPE ONT ETE MONTREES. IL EST TOUT A FAIT ENVISAGEABLE DE CONDUIRE UNE SIMULATION DE DYNAMIQUE MOLECULAIRE AVEC CONTRAINTES D'INTENSITES NOE DANS LE BUT DE DECRIRE LA DYNAMIQUE INTERNE DES SYSTEMES BIOLOGIQUES

Etude structurale des protéines et des acides nucléiques par RMN

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Book Synopsis Etude structurale des protéines et des acides nucléiques par RMN by : Hélène Van Melckebeke

Download or read book Etude structurale des protéines et des acides nucléiques par RMN written by Hélène Van Melckebeke and published by . This book was released on 2006 with total page 0 pages. Available in PDF, EPUB and Kindle. Book excerpt: La RMN est une méthode de choix pour la détermination de la structure tridimensionnelle des protéines et des acides nucléiques en solution. Cependant, la taille des systèmes que l'on peut étudier actuellement par RMN est limitée. Dans la première partie de ce travail, la structure du répresseur BlaI de la beta-lactarnase de B. licheniformis 749/1 et son interaction avec l'ADN ont été étudiées par RMN avec des méthodes classiques. Ces résultats ont permis de mieux caractériser la répression des gènes de plusieurs mécanismes de résistance aux antibiotiques, incluant la résistance à la méthicilline de la souche pathogène S. aureus. Le deuxième volet de ce travail concerne l'implémentation de filtres Hadamard qui augmentent la résolution des spectres dans certaines expériences de RMN multidimensionnelle. Ces filtres permettent de séparer les pics de corrélation des protéines et des acides nucléiques selon le type d'acide aminé et le type de base, respectivement. Ces développements ouvrent de nouveaux horizons vers l'étude de macromolécules biologiques de plus grosse taille par RMN.

ETUDE CRISTALLOGRAPHIQUE DE STRUCTURES DE PROTEINES EN PRESENCE D'AGENTS DENATURANTS

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Book Synopsis ETUDE CRISTALLOGRAPHIQUE DE STRUCTURES DE PROTEINES EN PRESENCE D'AGENTS DENATURANTS by : MICHELE.. SALEM

Download or read book ETUDE CRISTALLOGRAPHIQUE DE STRUCTURES DE PROTEINES EN PRESENCE D'AGENTS DENATURANTS written by MICHELE.. SALEM and published by . This book was released on 2000 with total page 194 pages. Available in PDF, EPUB and Kindle. Book excerpt: LA COMPREHENSION DES MECANISMES DU REPLIEMENT ET DE LA DENATURATION EST UN ASPECT ESSENTIEL DE LA CHIMIE DES PROTEINES. ELLE EST INDISPENSABLE A L'ETABLISSEMENT DE CE QU'ON APPELLE PARFOIS LE DEUXIEME CODE GENETIQUE, RELIANT LA STRUCTURE PRIMAIRE D'UNE PROTEINE A SA STRUCTURE TRIDIMENSIONNELLE. L'INTERET, SUSCITE PAR CES PROCESSUS A ETE AMPLIFIE PAR LES RECENTES DECOUVERTES SUR LES IMPLICATIONS MEDICALES QUE PEUT AVOIR LE REPLIEMENT ANORMALE D'UNE PROTEINE. BIEN QUE LES AGENTS DENATURANTS CHIMIQUES NE SOIENT PAS IMPLIQUES DANS LE PHENOMENE DE DENATURATION A L'INTERIEUR DE LA CELLULE, ILS SONT FREQUEMMENT UTILISES DANS LES ETUDES DU REPLIEMENT DES PROTEINES, CE QUI JUSTIFIE L'ETUDE DE LEUR MODE D'ACTION. CE TRAVAIL PORTE SUR L'ETUDE DES INTERACTIONS PROTEINES/AGENTS DENATURANTS A L'ETAT CRISTALLIN. LES TRAVAUX ONT ETE REALISES SUR 2 PROTEINES : LA BARNASE ET LE LYSOZYME, EN PRESENCE DE DIFFERENTS AGENTS DENATURANTS : UREE, CHLORURE DE GUANIDIUM, THIOUREE, BROMOETHANOL ET SDS. AFIN D'EFFECTUER UNE ETUDE STRUCTURALE A HAUTE RESOLUTION EN PRESENCE DE FORTES CONCENTRATIONS EN AGENTS DENATURANTS, LES CRISTAUX ONT ETE PREALABLEMENT RETICULES A L'AIDE DU GLUTARALDEHYDE. AU TOTAL, 7 COMPLEXES BARNASE-AGENTS DENATURANTS ET 5 COMPLEXES LYSOZYME-AGENTS DENATURANTS ONT PU ETRE AFFINES A DES RESOLUTIONS COMPRISES ENTRE 1.6 ET 2A. L'ANALYSE DE CES STRUCTURES A PERMIS (I) DE MONTRER QUE LES 2 PROTEINES SUBISSAIENT PEU DE MODIFICATIONS STRUCTURALES POUR LES CONCENTRATIONS ETUDIEES, ET (II) DE DETERMINER LES DIFFERENTS SITES DE FIXATION DE CES AGENTS SUR LA BARNASE ET LE LYSOZYME, ET DE CARACTERISER LEURS INTERACTIONS. LES RESULTATS OBTENUS MONTRENT QUE POUR LES CONCENTRATIONS ETUDIEES LES SITES DE FIXATION DE CES AGENTS SONT PEU NOMBREUX ET TOUS SITUES A LA SURFACE DE LA PROTEINE. LES INTERACTIONS SE FONT PRINCIPALEMENT VIA DES LIAISONS HYDROGENE AU NIVEAU DE LA CHAINE PRINCIPALE ET DES CHAINES LATERALES POLAIRES ; NEANMOINS QUELQUES INTERACTIONS HYDROPHOBES SONT OBSERVEES. CES RESULTATS SONT EN ACCORD AVEC DES ETUDES SIMILAIRES REALISEES PAR CRISTALLOGRAPHIE OU RMN PAR D'AUTRES AUTEURS, PARALLELEMENT A NOTRE TRAVAIL. DANS LE CAS DE LA BARNASE, NOUS AVONS PU COMPARER NOS RESULTATS AVEC CEUX OBTENUS PAR DYNAMIQUE MOLECULAIRE SUR LA DENATURATION DE CETTE PROTEINE EN PRESENCE D'UREE, ET CONCLURE A UNE BONNE CORRELATION.

ETUDE DES GENES CODANT POUR LES PROTEINES DE TRANSFERT DE LIPIDES DE NEUF ET SEPT KILODALTONS DE BLE DUR. PRODUCTION DE LA PROTEINE DE TRANSFERT DE LIPIDES DE NEUF KILODALTONS DANS ESCHERICHIA COLI

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Book Synopsis ETUDE DES GENES CODANT POUR LES PROTEINES DE TRANSFERT DE LIPIDES DE NEUF ET SEPT KILODALTONS DE BLE DUR. PRODUCTION DE LA PROTEINE DE TRANSFERT DE LIPIDES DE NEUF KILODALTONS DANS ESCHERICHIA COLI by : WILFRID.. DIERYCK

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Analyse quantitative des perturbations de déplacement chimique pour la détermination de structures tridimensionnelles de complexes protéine-ligand

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Book Synopsis Analyse quantitative des perturbations de déplacement chimique pour la détermination de structures tridimensionnelles de complexes protéine-ligand by : Clémentine Aguirre

Download or read book Analyse quantitative des perturbations de déplacement chimique pour la détermination de structures tridimensionnelles de complexes protéine-ligand written by Clémentine Aguirre and published by . This book was released on 2014 with total page 0 pages. Available in PDF, EPUB and Kindle. Book excerpt: Les interactions intermoléculaires entre une protéine et ses différents partenaires représentent des cibles de plus en plus prisées pour l'élaboration de composés thérapeutiques capables d'intervenir dans des processus biologiques. La méthode FBDD (Fragment-Based Drug Design) permet de concevoir des molécules bioactives tels que des inhibiteurs, à partir de la structure tridimensionnelle du complexe formé entre la protéine et une molécule fragment. Dans le cadre de ce projet de thèse nous proposons d'utiliser le déplacement chimique pour l'étude des structures 3D de ces complexes protéine-ligand. Nous nous focaliserons sur la mesure des perturbations de déplacement chimique CSP (Chemical Shift Perturbations) des atomes d'une protéine cible, induites par la liaison d'un fragment. Nous démontrerons la puissance de cet outil RMN à travers la simulation des CSP induits par l'interaction d'un fragment sur une protéine cible et leur comparaison aux CSP expérimentaux. L'analyse sera réalisée sur deux protéines cibles et la comparaison des données expérimentales et simulées permettra dans un premier temps de mettre en évidence un réarrangement structural de la protéine Bcl-xL lors de son interaction avec un fragment. Puis, dans un second temps, nous montrerons que cette analyse quantitative des CSP peut permettre de déterminer l'orientation des fragments dans le site d'interaction de la protéine PRDX5. Nous comparerons alors les performances de la méthode pour différents types de protons proposant ainsi de nouvelles pistes pour la compréhension du comportement des CSP vis-à-vis de leurs contributions électroniques.