ETUDE PAR RESONANCE MAGNETIQUE NUCLEAIRE DE LA STRUCTURATION DE PEPTIDES LORS D'INTERACTIONS DANS LEUR CONTEXTE BIOLOGIQUE

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Book Synopsis ETUDE PAR RESONANCE MAGNETIQUE NUCLEAIRE DE LA STRUCTURATION DE PEPTIDES LORS D'INTERACTIONS DANS LEUR CONTEXTE BIOLOGIQUE by : MARC.. ANDRIEUX

Download or read book ETUDE PAR RESONANCE MAGNETIQUE NUCLEAIRE DE LA STRUCTURATION DE PEPTIDES LORS D'INTERACTIONS DANS LEUR CONTEXTE BIOLOGIQUE written by MARC.. ANDRIEUX and published by . This book was released on 1995 with total page 179 pages. Available in PDF, EPUB and Kindle. Book excerpt: DANS LES CAS OU LEUR TAILLE TROP IMPORTANTE INTERDIT LES ETUDES PAR RESONANCE MAGNETIQUE NUCLEAIRE DE PROTEINES, ON PEUT SE SERVIR DE PEPTIDES POUR ETUDIER DES CONFORMATIONS LOCALES. UN PEPTIDE PLACE DANS DES CONDITIONS EXPERIMENTALES MODELISANT SON ENVIRONNEMENT BIOLOGIQUE PEUT PRESENTER UNE STRUCTURE BIEN DEFINIE. DANS LE CAS DU RECEPTEUR D3 A LA DOPAMINE, NOUS AVONS MONTRE QUE LA ZONE IMPLIQUEE DANS LE COUPLAGE AUX PROTEINES G PRESENTAIT UNE CONFORMATION EN ALPHA-HELICE LORS DE L'INTERACTION AVEC DES MICELLES DE DODECYL SULFATE DE SODIUM UTILISEES COMME MODELE DE MEMBRANE CELLULAIRE. IL EST POSSIBLE PAR RESONANCE MAGNETIQUE NUCLEAIRE D'OBSERVER LA STRUCTURATION TRANSITOIRE D'UN PEPTIDE LORS D'UNE INTERACTION. UN MUTANT DE DELETION DE LA PHOSPHOGLYCERATE KINASE PRESENTE UNE RESTAURATION DE L'ACTIVITE CATALYTIQUE PAR COMPLEMENTATION AVEC UN PEPTIDE CORRESPONDANT A LA ZONE DELETEE. CE PEPTIDE EST EN ECHANGE ENTRE LE SITE DE FIXATION SUR LA PROTEINE ET LA SOLUTION. EN UTILISANT LE PHENOMENE D'EFFET NUCLEAIRE OVERHAUSER TRANSFERE, LA STRUCTURE DU PEPTIDE DANS L'ETAT LIE A ETE DETERMINEE. LA STRUCTURE DE CE FRAGMENT EST PROCHE DE CELLE ADOPTEE DANS LA STRUCTURE DE LA PHOSPHOGLYCERATE KINASE NATIVE TELLE QU'ELLE A ETE DETERMINEE PAR RADIOCRISTALLOGRAPHIE, EN PARTICULIER DANS LA ZONE CORRESPONDANT A L'HELICE QUATORZE

Détermination par résonance magnétique nucléaire de structures tridimentionnelles de peptides et de protéines

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Book Synopsis Détermination par résonance magnétique nucléaire de structures tridimentionnelles de peptides et de protéines by : Emeric Wasielewski

Download or read book Détermination par résonance magnétique nucléaire de structures tridimentionnelles de peptides et de protéines written by Emeric Wasielewski and published by . This book was released on 2004 with total page 181 pages. Available in PDF, EPUB and Kindle. Book excerpt: Les fonctions spécifiques des protéines résultent de leurs caractéristiques structurales et dynamiques. La spectroscopie de Résonance Magnétique Nucléaire (RMN) est l'une des principales techniques apportant ces deux types d'informations, tant pour de petits peptides que pour des protéines plus imposantes. Cependant, les stratégies d'études se différencient selon la taille des biomolécules. Durant mon travail de thèse, je me suis attaché à l'étude structurale par spectrométrie RMN de deux types de molécules intervenant dans deux contextes biologiques différents.Le premier contexte biologique abordé est celui du métabolisme du fer chez les bactéries Gram-négatif. Les études structurales de deux sidérophores peptidiques bactériens sont présentées : l'azoverdine d'Azomonas macrocytogenes ATCC 12 334 et la pyoverdine PaA de Pseudomonas aeruginosa ATCC 15 692. Le but de ces études est la compréhension du mécanisme de reconnaissance spécifique complexe métallique sidérophore/récepteur membranaire. Nous avons adapté à l'étude de ces peptides des méthodes utilisées sur les protéines. Ceci comprend une séquence de type HNCA utilisée en abondance naturelle de 13C et l'utilisation des couplages dipolaires résiduels (RDC). Nous avons également étudié le cas de plusieurs conformères en échange chimique intermédiaire.Le second contexte biologique abordé est celui de la transcription et de la réparation de l'ADN via l'étude structurale et dynamique de trois domaines de sous-unités du facteur humain de transcription/réparation TFIIH : MAT1, p44 et p62. La première partie décrit la détermination structurale du domaine RING C3HC4 de la sous-unité MAT1. La seconde partie présente une étude sur la dynamique et les propriétés d'échange métallique du domaine RING C8 de la sous-unité p44. Enfin, la troisième partie démontre l'apport des contraintes orientationnelles issues des RDC dans l'affinement des structures tridimensionnelles du domaine PH de la sous-unité p62.

ETUDES CONFORMATIONNELLES PAR RESONANCE MAGNETIQUE NUCLEAIRE ET PAR DICHROISME CIRCULAIRE DE PEPTIDE D'INTERET BIOLOGIQUE

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Book Synopsis ETUDES CONFORMATIONNELLES PAR RESONANCE MAGNETIQUE NUCLEAIRE ET PAR DICHROISME CIRCULAIRE DE PEPTIDE D'INTERET BIOLOGIQUE by : BENEDICTE.. PRECHEUR-AGULHON

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ETUDE STRUCTURALE ET DYNAMIQUE DES PEPTIDES EN SOLUTION PAR RMN

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Book Synopsis ETUDE STRUCTURALE ET DYNAMIQUE DES PEPTIDES EN SOLUTION PAR RMN by : Bruno Kieffer

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ETUDE PAR SPECTROSCOPIE DE RESONANCE MAGNETIQUE NUCLEAIRE D'ENDOTHELINES, DE LEUR PRECURSEUR ET DE PEPTIDES APPARENTES

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Book Synopsis ETUDE PAR SPECTROSCOPIE DE RESONANCE MAGNETIQUE NUCLEAIRE D'ENDOTHELINES, DE LEUR PRECURSEUR ET DE PEPTIDES APPARENTES by : PATRICK.. BORTMANN

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INTERACTION PEPTIDES-MEMBRANES

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Book Synopsis INTERACTION PEPTIDES-MEMBRANES by : Beate Bersch

Download or read book INTERACTION PEPTIDES-MEMBRANES written by Beate Bersch and published by . This book was released on 1992 with total page pages. Available in PDF, EPUB and Kindle. Book excerpt: LA CONNAISSANCE DE LA CONFORMATION MEMBRANAIRE D'UN NEUROPEPTIDE PEUT APPORTER DES INFORMATIONS IMPORTANTES SUR LE MODELE RECEPTEUR-PEPTIDE AINSI QUE SUR LA RELATION STRUCTURE-ACTIVITE. NOUS AVONS UTILISE UNE TECHNIQUE DE RESONANCE MAGNETIQUE NUCLEAIRE (RMN), LE NOE TRANSFERE (TRNOE), QUI NOUS PERMET DE DETERMINER LA CONFORMATION DE PEPTIDES DANS DES LIPOSOMES. CES EXPERIENCES ONT ETE EFFECTUEES EN PRESENCE DE LIPOSOMES PERDEUTERIES. POUR CELA, NOUS AVONS DU METTRE AU POINT LA SYNTHESE TOTALE DE DIFFERENTES CLASSES DE PHOSPHOLIPIDES PERDEUTERIES: LA PHOSPHATIDYLCHOLINE, LE PHOSPHATIDYLGLYCEROL, L'ACIDE PHOSPHATIDIQUE ET LA PHOSPHATIDYLETHANOLAMINE. LES TACHYKININES, UNE FAMILLE DE NEUROPEPTIDES IMPLIQUES DANS UN MULTITUDE D'EFFETS PHYSIOLOGIQUES, ONT ETE CHOISIES POUR LES ETUDES PAR RMN. DES AGONISTES SPECIFIQUES DE DEUX DES RECEPTEURS DES TACHYKININES ONT ETE ETUDIES EN SOLUTION AQUEUSE ET EN PRESENCE DE LIPOSOMES: LA SUBSTANCE P ET LE SENKTIDE (ANALOGUE ACTIF DE LA NEUROKININE B) POUR LES RECEPTEURS NK-1 ET NK-3 RESPECTIVEMENT. L'UTILISATION DE LA RMN 2D A PERMIS D'ATTRIBUER LES SPECTRES PROTONS DES PEPTIDES ET DE DEMONTRER, QU'ILS NE POSSEDENT AUCUNE CONFORMATION PREFERENTIELLE DANS L'EAU. PAR CONTRE, LES DEUX PEPTIDES SE STRUCTURENT EN PRESENCE DE MEMBRANES. LES CONFORMATIONS MEMBRANAIRES DE LA SUBSTANCE P ET DU SENKTIDE ONT PU ETRE DETERMINEES A PARTIR DES SPECTRES TRNOE EN DEUX DIMENSIONS EN COMBINAISON AVEC DES CALCULS DE LA GEOMETRIE DE DISTANCES. CES STRUCTURES ONT ETE COMPAREES AVEC DES DONNEES DE LA LITTERATURE ET NOUS AVONS DISCUTE LEUR SIGNIFICATION BIOLOGIQUE

ETUDE STRUCTURALE PAR RMN DE PEPTIDES ET PROTEINES DU SYSTEME VASOREGULATEUR

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Book Synopsis ETUDE STRUCTURALE PAR RMN DE PEPTIDES ET PROTEINES DU SYSTEME VASOREGULATEUR by : PHILIPPE.. SIZUN

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ETUDES PAR RESONANCE MAGNETIQUE NUCLEAIRE ET MODELISATION MOLECULAIRE DE LA STRUCTURE DE PEPTIDES DERIVES DES PROTEINES RETROVIRALES DE NUCLEOCAPSIDE (VIH-1 ET MOMULV), ET DE LEURS INTERACTIONS AVEC DES ACIDES NUCLEIQUES

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Book Synopsis ETUDES PAR RESONANCE MAGNETIQUE NUCLEAIRE ET MODELISATION MOLECULAIRE DE LA STRUCTURE DE PEPTIDES DERIVES DES PROTEINES RETROVIRALES DE NUCLEOCAPSIDE (VIH-1 ET MOMULV), ET DE LEURS INTERACTIONS AVEC DES ACIDES NUCLEIQUES by : HELENE.. DEMENE

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Structures tridimensionnelles de peptides par RMN et modélisation moléculaire [microforme]

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Publisher : National Library of Canada = Bibliothèque nationale du Canada
ISBN 13 : 9780612154438
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Book Synopsis Structures tridimensionnelles de peptides par RMN et modélisation moléculaire [microforme] by : Abdesslem Khiat

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ETUDE STRUCTURALE PAR RESONANCE MAGNETIQUE NUCLEAIRE HAUT CHX11F ET MODELISATION MOLECULAIRE DE PEPTIDES ANALOGUES DE LA NEUROTENSINE

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Book Synopsis ETUDE STRUCTURALE PAR RESONANCE MAGNETIQUE NUCLEAIRE HAUT CHX11F ET MODELISATION MOLECULAIRE DE PEPTIDES ANALOGUES DE LA NEUROTENSINE by : LAURENCE.. CONRAUX

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STRUCTURE ET DYNAMIQUE DE FRAGMENTS PEPTIDIQUES

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Book Synopsis STRUCTURE ET DYNAMIQUE DE FRAGMENTS PEPTIDIQUES by : François Macquaire

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DETERMINATION, PAR RMN, DE LA STRUCTURE TRIDIMENSIONNELLE DES PEPTIDES ET DES PROTEINES

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Book Synopsis DETERMINATION, PAR RMN, DE LA STRUCTURE TRIDIMENSIONNELLE DES PEPTIDES ET DES PROTEINES by : YINSHAN.. YANG

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Introduction À L'étude de la Conformation Des Peptides Et Des Protéines Par Résonance Magnétique Nucléaire À Deux Dimensions, RMN-2D, Des Protons

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Book Synopsis Introduction À L'étude de la Conformation Des Peptides Et Des Protéines Par Résonance Magnétique Nucléaire À Deux Dimensions, RMN-2D, Des Protons by : Jean-Michel Neumann

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Analyse de la structure tridimentionnelle des protéines par résonance magnétique nucléaire

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Book Synopsis Analyse de la structure tridimentionnelle des protéines par résonance magnétique nucléaire by : Anne Lesage

Download or read book Analyse de la structure tridimentionnelle des protéines par résonance magnétique nucléaire written by Anne Lesage and published by . This book was released on 1995 with total page 233 pages. Available in PDF, EPUB and Kindle. Book excerpt: Nous avons utilisé la résonance magnétique nucléaire d'une part pour l'étude structurale de peptides synthétiques mimant la jonction COL1-NC1 des collagènes FACIT, et d'autre part pour la détermination de la structure 3D du domaine d'interaction à l'ADN du régulateur transcriptionnel FRUR, domaine appelé FRUR (1-57). Les peptides ont été synthétisés et associés en trimères reliés par trois ponts disulfures inter-chaines. Les trimères formes ont été caractérisés par microsequençage, dichroîsme circulaire et RMN. Un modèle structural est proposé pour la jonction COL1-NC1 des collagènes FACIT. Des expériences RNM hétéronucleaires azote 15-proton à deux et trois dimensions ont été réalisées sur le domaine FRUR (1-57). Elles ont permis l'identification des effets nOe et la mesure des constantes de couplage HN-h : experiences 2D gHSQC, 3d NOESY-HMQC, 3D TOCSY-HMQC, 3D HNHA.

ETUDE PAR RESONANCE MAGNETIQUE NUCLEAIRE DU PEPTIDE A13G. RECHERCHE DE L'INTERACTION AVEC L'ALPRENOLOL

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Book Synopsis ETUDE PAR RESONANCE MAGNETIQUE NUCLEAIRE DU PEPTIDE A13G. RECHERCHE DE L'INTERACTION AVEC L'ALPRENOLOL by : BEATRICE.. DUPONT-QUENET

Download or read book ETUDE PAR RESONANCE MAGNETIQUE NUCLEAIRE DU PEPTIDE A13G. RECHERCHE DE L'INTERACTION AVEC L'ALPRENOLOL written by BEATRICE.. DUPONT-QUENET and published by . This book was released on 1994 with total page 181 pages. Available in PDF, EPUB and Kindle. Book excerpt: LE PEPTIDE A13G EST LA REPRESENTATION SYNTHETIQUE D'UNE REGION DETERMINANTE D'UN ANTICORPS ANTI-ALPRENOLOL: 37A4. DANS LE BUT DE CONFIRMER L'INTERACTION ENTRE CES DEUX MOLECULES, NOUS AVONS OBSERVE, PAR RESONANCE MAGNETIQUE NUCLEAIRE, LE COMPORTEMENT DU PEPTIDE SEUL ET EN PRESENCE D'ALPRENOLOL, EN SOLUTION AQUEUSE. L'ATTRIBUTION COMPLETE DU SPECTRE PROTON ET PARTIELLE EN CARBONE A ETE REALISEE. NOUS AVONS CONSTATE, QU'A PH ACIDE, CELUI-CI S'HYDROLYSAIT AU BOUT DE 5 JOURS AU NIVEAU DE LA LIAISON ASP-PRO. L'ETUDE CONFORMATIONNELLE N'A PAS PERMIS DE METTRE EN EVIDENCE UNE STRUCTURE SECONDAIRE REGULIERE DU PEPTIDE. SEULE, LA CONFIGURATION TRANS DES DEUX LIAISONS X-PRO A PU ETRE DEMONTREE. LE PEPTIDE PRESENTE LES MEMES CARACTERISTIQUES LORSQU'IL EST EN PRESENCE D'ALPRENOLOL. L'ETUDE DE L'INTERACTION, A TRAVERS DES MESURES D'EFFETS OVERHAUSER NUCLEAIRES INTERMOLECULAIRES ET DE TEMPS DE RELAXATION DES PROTONS DE L'ALPRENOLOL, A MONTRE QUE L'ALPRENOLOL NE RECONNAISSAIT PAS LE PEPTIDE A13G. CE DERNIER SERAIT UNE REPRESENTATION TROP RESTREINTE DE L'ANTICORPS ANTI-ALPRENOLOL

ETUDE PAR RESONANCE MEGNETIQUE NUCLEAIRE A UNE ET DEUX DIMENSIONS DE QUELQUES SUCRES GLYCOPEPTIDES ET OLIGONUCLEOTIDES

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Book Synopsis ETUDE PAR RESONANCE MEGNETIQUE NUCLEAIRE A UNE ET DEUX DIMENSIONS DE QUELQUES SUCRES GLYCOPEPTIDES ET OLIGONUCLEOTIDES by : BRIGITTE.. CHANEL GILLET

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DETERMINATION PAR RESONANCE MAGNETIQUE NUCLEAIRE DE LA STRUCTURE TRIDIMENSIONNELLE DE PETITES PROTEINES

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Book Synopsis DETERMINATION PAR RESONANCE MAGNETIQUE NUCLEAIRE DE LA STRUCTURE TRIDIMENSIONNELLE DE PETITES PROTEINES by : ESTHER.. KELLENBERGER

Download or read book DETERMINATION PAR RESONANCE MAGNETIQUE NUCLEAIRE DE LA STRUCTURE TRIDIMENSIONNELLE DE PETITES PROTEINES written by ESTHER.. KELLENBERGER and published by . This book was released on 2000 with total page 182 pages. Available in PDF, EPUB and Kindle. Book excerpt: LA PREMIERE PARTIE TRAITE D'INGENIERIE DES PROTEINES. UNE SEQUENCE DE TYPE RGD A ETE INTRODUITE DANS UNE TOXINE DE SCORPION CONTENANT TROIS PONTS DISULFURE. LA TOXINE CHIMERE POSSEDE DES PROPRIETES ANTIAGREGANTES. SA STRUCTURE TRIDIMENSIONNELLE REVELE QU'UNE HELICE ALPHA PEUT MIMER UN COUDE BETA DE TYPE II. UNE DEUXIEME PARTIE S'INTERESSE AUX PROTEINES QUI LIENT LE ZINC ET QUI SONT IMPLIQUEES DANS LA TRANSCRIPTION DES GENES DE CLASSES II CHEZ LES EUCARYOTES. _ UNE REVUE BIBLIOGRAPHIQUE DECRIT LES PROPRIETES DU ZINC ET LES DIFFERENTS MOTIFS STRUCTURAUX DE LIAISON AU ZINC. _ UN CHAPITRE EST CONSACRE A LA PURIFICATION DE LA SOUS-UNITE HRPB10ALPHA DE L'ARN POLYMERASE II HUMAINE. CETTE SOUS-UNITE DE 58 ACIDES AMINES LIE UN ION ZN 2 +. LE COMPORTEMENT BIOCHIMIQUE AINSI QUE LES PREMIERS SPECTRES ENREGISTRES SUR LA PROTEINE PURIFIEE METTENT EN EVIDENCE UNE TENDANCE A L'AGREGATION. _ UN CHAPITRE PRESENTE LA DETERMINATION DE LA STRUCTURE TRIDIMENSIONNELLE DU DOMAINE CARBOXY-TERMINAL DE LA SOUS-UNITE P44 (P44 3 2 1 - 3 9 5) DE TFIIH. TFIIH EST UN FACTEUR DE BASE DE LA TRANSCRIPTION. IL EST AUSSI UN ACTEUR ESSENTIEL DE LA REPARATION DE L'ADN PAR EXCISION DE NUCLEOTIDES. LE DOMAINE P44 3 2 1 - 3 9 5 LIE DEUX IONS ZN 2 +. L'ETUDE STRUCTURALE REVELE UN FEUILLET BETA ANTIPARALLELE A TROIS BRINS ASSOCIE A UNE HELICE ALPHA. ELLE TEMOIGNE EGALEMENT D'UNE DYNAMIQUE LOCALISEE AUTOUR DE L'UN DES SITES DE LIAISON AU ZINC. LE MOTIF DE COORDINATION DES IONS ZINC DE P44 3 2 1 - 3 9 5 EST ORIGINAL, BIEN QUE LA TOPOLOGIE DU DOMAINE SOIT COMMUN A D'AUTRES PROTEINES DE LIAISON AU ZINC. LE TRAVAIL SUR P44 A FAIT APPEL A DEUX TECHNIQUES PROPRES A LA RESONANCE MAGNETIQUE NUCLEAIRE DES MACROMOLECULES BIOLOGIQUES : (1) LE MARQUAGE ISOTOPIQUE ET (2) L'AUTOMATISATION DE L'ATTRIBUTION DES PICS DE CORRELATION NOES. L'UTILISATION ET L'EVALUATION DE CES TECHNIQUES SONT DETAILLEES DANS UNE PARTIE METHODOLOGIE.