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Author : Alexandra Lafaye
Publisher :
ISBN 13 :
Total Pages : 336 pages
Book Rating : 4.:/5 (491 download)
Download or read book Analyse du métabolome par chromatographie liquide couplée à la spectrométrie de masse written by Alexandra Lafaye and published by . This book was released on 2005 with total page 336 pages. Available in PDF, EPUB and Kindle. Book excerpt:
Author : Erwan Werner
Publisher :
ISBN 13 :
Total Pages : 113 pages
Book Rating : 4.:/5 (8 download)
Download or read book Analyse du métabolome par chromatographie liquide couplée à la spectrométrie de masse written by Erwan Werner and published by . This book was released on 2011 with total page 113 pages. Available in PDF, EPUB and Kindle. Book excerpt:
Author : Samia Boudah
Publisher :
ISBN 13 :
Total Pages : 0 pages
Book Rating : 4.:/5 (897 download)
Download or read book Développement et application de méthodes de chromatographie liquide couplées à la spectrométrie de masse à haute résolution pour les analyses métabolomiques et lipidomiques de larges cohortes written by Samia Boudah and published by . This book was released on 2014 with total page 0 pages. Available in PDF, EPUB and Kindle. Book excerpt: Le profilage métabolomique global de matrices biologiques dans de larges séries d'échantillon est un enjeu majeur. Dans ce contexte, notre travail vise à développer des approches LC-HRMS et outils bioinformatiques pour les analyses métabolomique et lipidomique de larges cohortes. Dans un premier temps, nous avons développé puis évalué la pertinence de 4 méthodes LC-HRMS dans l'annotation du métabolome/lipidome sérique humain. Ainsi, une base de données spectrales a été implémentée à l'aide de spectres MS, MS/MS et les temps de rétention de composés de référence afin d'assurer l'annotation de jeux de données. La combinaison de méthodes RP, HILIC et PFPP-HRMS a permis l'identification de 266 métabolites et 706 espèces lipidiques sériques répartis sur 20 et 24 classes chimiques respectivement dont 27% d'espèces isomères. Ces outils ont été appliqués, dans un second temps, à la stratification de 78 patients diabétiques. Outre le syndrome métabolique marqué (perturbation du métabolisme énergétique), nos analyses ont montré l'impact délétère de facteurs physiologiques confondants -âge et IMC-. Nous en avons évalué l'influence sur une cohorte de 227 salariés du CEA. Les empreintes lipidomiques sont robustes, néanmoins l'impact de l'IMC est marqué pour les lipides neutres. L'effet du genre démontre un catabolisme masculin important. L'effet de l'âge se manifeste par des activités enzymatiques altérées. Ces études combinent une analyse globale métabolomique et lipidomique des mêmes échantillons humains. Elles visent à construire une base de données relationnelle incluant données spectrales et biologiques servant à la caractérisation de biomarqueurs dans le cas d'études cliniques.
Author : Didier Patrick Ortelli
Publisher :
ISBN 13 :
Total Pages : 236 pages
Book Rating : 4.:/5 (82 download)
Download or read book Utilisation de la chromatographie liquide couplée à la spectrométrie de masse pour l'analyse de médicaments dans les fluides biologiques written by Didier Patrick Ortelli and published by . This book was released on 2001 with total page 236 pages. Available in PDF, EPUB and Kindle. Book excerpt: Ce travail avait pour buts de déterminer le potentiel de la chromatographie liquide couplée à la spectrométrie de masse pour l'analyse de médicaments dans les fluides biologiques et de tester de nouvelles techniques de préparation d'échantillons pouvant être couplées à la séparation chromatographique. La méthadone a été employée comme molécule modèle et analysée dans différents fluides biologiques dans le cadre d'une étude clinique. Différentes techniques d'extraction ont été testées. Parmi celles-ci, l'extraction sur phase solide en ligne a été particulièrement étudiée afin d'automatiser et de réduire le temps de l'analyse. Ainsi, les phases à accès restreint ont été testées pour l'analyse de la méthadone et ses métabolites. Finalement, deux applications employant la LC-MS ont été développées. La première concerne le dosage d'un composé antimalarique dans le plasma et la seconde concerne l'identification et le dosage de diterpénoides dans des extraits d'huile de graines de l'épurge.
Author : Céline Ducruix
Publisher :
ISBN 13 :
Total Pages : 448 pages
Book Rating : 4.:/5 (494 download)
Download or read book Analyse du métabolome par chromatographie couplée à la spectrométrie de masse written by Céline Ducruix and published by . This book was released on 2007 with total page 448 pages. Available in PDF, EPUB and Kindle. Book excerpt: Ce travail a pour objectif de développer des approches métabolomiques basées sur l’utilisation de la spectrométrie de masse afin de les appliquer à des thématiques biologiques. Pour cela, des méthodes d’analyse, de traitement des données, ainsi que d’analyses statistiques multivariées ont ainsi été mises au point. Cette approche a été appliquée à l’étude des effets du cadmium chez la plante Arabidopsis thaliana. des peptides chélatant ce métal qui n’avaient jamais été décrits dans cette espèce ont ainsi été caractérisés. La régulation de la voie métabolique impliquée dans la synthèse de ces peptides a également été étudiée en détails. L’analyse métabolomique a été appliquée à la recherche de biomarqueurs de fibrose pulmonaire sur des échantillons urinaires provenant de modèles murins. Enfin, des études ont également été menée afin d’affiner nos stratégies d’identification des métabolites d’intérêt biologiques mis en évidence par les analyses statistiques multivariées.
Author : Wolfram Weckwerth
Publisher : Springer Science & Business Media
ISBN 13 : 1597452440
Total Pages : 290 pages
Book Rating : 4.5/5 (974 download)
Download or read book Metabolomics written by Wolfram Weckwerth and published by Springer Science & Business Media. This book was released on 2008-02-04 with total page 290 pages. Available in PDF, EPUB and Kindle. Book excerpt: Metabolomics: Methods and Protocols examines the state-of-the-art in metabolomic analysis. Leading researchers in the field present protocols for the application of complementary analytical methods, such as gas chromatography-mass spectrometry (GC-MS). Metabolomics: Methods and Protocols contains forward-looking protocols, which provide the essential groundwork for future efforts in elucidating the structure of the unknowns detected in metabolomic studies.
Author : Ludovic Muller
Publisher :
ISBN 13 :
Total Pages : 184 pages
Book Rating : 4.:/5 (8 download)
Download or read book La spectrométrie de masse à ultrahaute résolution au service de la chimie des biomolécules written by Ludovic Muller and published by . This book was released on 2011 with total page 184 pages. Available in PDF, EPUB and Kindle. Book excerpt: Le spectromètre de masse hybride en tandem le LTQ-Orbitrap, dans lequel les ions sont détectés avec une grande précision en masse, a été utilisé dans les deux stratégies différentes de la métabolomique, c'est-à-dire l’approche globale et ciblée. Dans l’approche dite ciblée, il s’agit de mesurer la concentration de métabolites connus ou révélés par la transcriptomique ou la protéomique. Mais dès lors le problème majeur est la quantification absolue de ces métabolites, qui est généralement faite en LC/MS/MS en mode MRM (multiple réaction monitoring) dans les instruments hybrides de type spatiaux (exemple : triple quadripôle). Ce mode de balayage repose sur le suivi d’une voie de fragmentation du métabolite d’intérêt. La LC/FTMS ne nécessite pas de ciblé son analyse sur un seul ion précurseur. Elle permet le balayage sur toute une gamme de masse (de m/z), on propose ainsi une méthode de détection globale des masses basée sur la technologie Orbitrap . Dans l’approche globale, il s’agit de déterminer les flux métabolomiques dans un tissu ou fluide biologique en fonction de son environnement afin de déterminer des biomarqueurs. Bien que guidée par les statistiques, l’analyse de ces échantillons est complexe, aux vus du nombre de signaux détectés. La FTMS (Spectrométrie de Masse à Transformée de Fourrier), couplée généralement à la chromatographie liquide, permet d’avoir une unique composition élémentaire pour les métabolites de faibles masses moléculaires (inférieures à 500 u) permettant ainsi de faciliter l’identification des métabolites. Une alternative attrayante est l’injection directe automatisée (FIA) de l’échantillon complexe, mais elle entraine une perte d’information. Le but de ma thèse a été dès lors d’optimiser le traitement des données issu de FIA-FTMS et de quantifier la perte d’information inhérente à cette approche. Enfin, on utilise ce spectromètre pour l’étude de complexe non-covalent visant à caractériser l’interaction de complexes peptide-peptide et ADN-peptide. On observe une interaction non covalente très forte entre les résidus arginine et les groupements phosphate. Cette thèse montre le rôle joué par les formes zwitterioniques dans la stabilisation de tels complexes. Les mécanismes, expliquant les différentes voies de fragmentations, sont proposés et impliquent la formation de pont salin entre les espèces expliquant sa grande stabilité en phase gazeuse
Author : Hélène Pereira
Publisher :
ISBN 13 :
Total Pages : 196 pages
Book Rating : 4.:/5 (69 download)
Download or read book Développement de l'approche métabolomique par couplage chromatographie liquide written by Hélène Pereira and published by . This book was released on 2010 with total page 196 pages. Available in PDF, EPUB and Kindle. Book excerpt: L'étude du métabolome est un challenge analytique important, de part la grande diversité chimique des métabolites présents à des concentrations très variables dans les matrices biologiques. Ce travail présente une stratégie analytique mettant en oeuvre le couplage chromatographie liquide / spectrométrie de masse afin d'acquérir des profils métaboliques de fluides biologiques et d'identifier des biomarqueurs potentiels de dysfonctionnements métaboliques. Une attention particulière a été donnée à l'étude des sources de variablité analytique, depuis l'étape de préparations d'échantillons jusqu'au traitement des données. Un protocole optimisé a été proposé et appliqué à une intervention nutrionnelle (ANR METAPROFILE). L'identification a été basée sur l'utilisation des bases de données, ainsi que sur l'interprétation des informations spectrales (profils isotopiques et fragmentations MSn)
Author : Sandrine Cudré Correia De Almeida
Publisher :
ISBN 13 :
Total Pages : 370 pages
Book Rating : 4.:/5 (18 download)
Download or read book Etude des différentes stratégies en spectrométrie de masse, couplée à la chromatographie liquide, pour l'analyse des métabolites polaires dans les cellules humaines, animales et végétales written by Sandrine Cudré Correia De Almeida and published by . This book was released on 2017 with total page 370 pages. Available in PDF, EPUB and Kindle. Book excerpt:
Author : Jérôme Cotton
Publisher :
ISBN 13 :
Total Pages : 0 pages
Book Rating : 4.:/5 (911 download)
Download or read book Application de l'analyse métabolomique à la détection ciblée et globale de contaminants organiques dans des matrices agroalimentaires et environnementales par spectrométrie de masse à ultra-haute résolution written by Jérôme Cotton and published by . This book was released on 2015 with total page 0 pages. Available in PDF, EPUB and Kindle. Book excerpt: La pollution des produits agroalimentaires et des eaux environnementales par les substances phytosanitaires et les médicaments est une réelle préoccupation de santé publique. Il existe aujourd'hui de nombreuses méthodes d'analyses quantitatives développées sur des appareils de type triple quadripôle pour leur détection mais elles ne se préoccupent peu ou pas des résidus médicamenteux et des produits de dégradation abiotique ou biologique des polluants et sont limitées à un nombre restreint et figé de molécules.Dans ce contexte, nous avons développé une méthode d'analyse basée sur la métabolomique par chromatographie liquide haute performance couplée à la spectrométrie de masse à ultra-haute résolution (LC-HRMS). Deux matrices (miel et eau souterraine) ont ainsi été étudiées comme preuve de concept. Nous avons montré que la LC-HRMS associée à des outils de fouille de données permet (i) une recherche ciblée de polluants prioritaires, (ii) la détection sans a priori de contaminants inattendus ou inconnus et (iii) la recherche de métabolites nécessaire à la classification des échantillons en fonction de leur métadonnée (adultération, origine géographique, etc.). Ensuite, une approche semi-quantitative ciblée large spectre a été développée et validée pour la détection de pesticides, médicaments et métabolites dans l'eau par couplage de la SPE en ligne avec l'UHPLC-ESI-HRMS. Cette méthode permet la détection de 539 contaminants organiques en 36 minutes dans 5 millilitres d'eau au seuil minimum réglementaire de 0,1 μg/L. L'étude de 26 eaux du robinet de la région parisienne a permis de mettre en évidence la présence à l'état de trace de 37 polluants dont 6 médicaments.
Author : Georg Martin Richter
Publisher : Cuvillier Verlag
ISBN 13 : 3736989717
Total Pages : 162 pages
Book Rating : 4.7/5 (369 download)
Download or read book Development and Application of a Method for Quantitative Metabolome Analysis of Various Produc-tion Strains written by Georg Martin Richter and published by Cuvillier Verlag. This book was released on 2019-06-18 with total page 162 pages. Available in PDF, EPUB and Kindle. Book excerpt: Im Rahmen der Dissertation wurde eine Methode zur Quantifizierung der Metabolite des zentralen Kohlenstoffwechsels von Mikroorganismen entwickelt. Die Methode wurde genutzt, um das Metabolom verschiedenster Produktionsstämme im nanomolaren Bereich zu analysieren. Bei der Analyse der Daten wurden Ergebnisse aus Metabolom- und Fluxomforschung kombiniert, um einen ganzheitlichen Ansatz zu schaffen. Auf diese Weise konnte unter anderem der Einfluss verschiedener Kultivierungsverfahren auf das Energielevel von E. coli untersucht werden. Weitere Messungen untersuchten den Einfluss von genetischen Veränderungen, Stress und unterschiedlichen C-Quellen auf den zentralen Kohlenstoffwechsel von weiteren Mikroorganismen.
Author : Marine de Person
Publisher :
ISBN 13 :
Total Pages : 280 pages
Book Rating : 4.:/5 (492 download)
Download or read book Analyse par chromatographie en phase liquide couplée à la spectrométrie de masse d'acides aminés et de petits peptides non dérivés dans des matrices agroalimentaires written by Marine de Person and published by . This book was released on 2005 with total page 280 pages. Available in PDF, EPUB and Kindle. Book excerpt: L'analyse qualitative et quantitative des acides aminés et des petits peptides dans les matrices complexes représente un enjeu indéniable dans de nombreux domaines d'application (agroalimentaire, pharmaceutique, exobiologie, ...). Les méthodes d'analyse que nous proposons dans ce mémoire font appel à la chromatographie en phase liquide couplée à la spectrométrie de masse sans étape de dérivation. La premiere partie du mémoire est consacrée à l'identification et au dosage de petits peptides dans des vins de Champagne. La méthodologie d'analyse est basée sur le couplage de la chromatographie de paire d'ions en milieu acide à la spectrométrie de masse à source electrospray en mode d'ionisation positif. Elle a été optimisée puis validée selon les critères classiques de validation. La seconde partie du mémoire a trait au développement de deux nouvelles méthodes séparatives complémentaires, compatibles avec un mode d'ionisation négatif. La première fait appel à la chromatographie de paire d'ions en milieu alcalin avec des agents d'appariement d'ions volatils (n-alkylammonium) sur silice greffée octadécyle et sur carbone graphitique poreux. La seconde utilise la chromatographie d'interactions hydrophiles sur une phase stationnaire polymérique de type amino. Une validation de ces méthodes a été développée. Enfin, une étude comparative des performances de deux sources d'ionisation de type electrospray associées à des interfaces différentes a été réalisée dans le cadre de l'analyse des acides aminés non dérivés.
Author : Cédric Sager
Publisher :
ISBN 13 :
Total Pages : pages
Book Rating : 4.:/5 (112 download)
Download or read book Couplage chromatographie liquide-spectrométrie de masse (lc-es-ms) pour l'analyse de peptides written by Cédric Sager and published by . This book was released on 1996 with total page pages. Available in PDF, EPUB and Kindle. Book excerpt:
Author : Silas G. Villas-Boas
Publisher : John Wiley & Sons
ISBN 13 : 047010550X
Total Pages : 339 pages
Book Rating : 4.4/5 (71 download)
Download or read book Metabolome Analysis written by Silas G. Villas-Boas and published by John Wiley & Sons. This book was released on 2007-02-16 with total page 339 pages. Available in PDF, EPUB and Kindle. Book excerpt: Providing information on the main approaches for the analysis of metabolites, this textbook: Covers basic methodologies in sample preparation and separation techniques, as well as the most recent techniques of mass spectrometry. Differentiates between primary and secondary metabolites. Includes four chapters discussing successful metabolome studies of different organisms. Highlights the analytical challenges of studying metabolites. Illustrates applications of metabolome analysis through the use of case studies.
Author : Laurent Bismuth
Publisher :
ISBN 13 :
Total Pages : 216 pages
Book Rating : 4.:/5 (491 download)
Download or read book Chromatographie liquide couplée à la spectrométrie de masse written by Laurent Bismuth and published by . This book was released on 2000 with total page 216 pages. Available in PDF, EPUB and Kindle. Book excerpt:
Author : Farida Rabii
Publisher :
ISBN 13 :
Total Pages : pages
Book Rating : 4.:/5 (13 download)
Download or read book Analyse Des Agents de Chimiothérapie Par Extraction Sur Phase Solide Automatisée Couplée À la Chromatographie Liquide Et la Spectrométrie de Masse en Tandem (SPE-LC-ESI-MS/MS). written by Farida Rabii and published by . This book was released on 2012 with total page pages. Available in PDF, EPUB and Kindle. Book excerpt:
Author : Jean-Gabriel Rousseau
Publisher :
ISBN 13 :
Total Pages : 202 pages
Book Rating : 4.:/5 (492 download)
Download or read book Mise au point d'une méthode générale pour l'analyse de composés peu polaires par couplage chromatographie liquide/spectrométrie de masse (CL/APCI-SM) written by Jean-Gabriel Rousseau and published by . This book was released on 2001 with total page 202 pages. Available in PDF, EPUB and Kindle. Book excerpt:
