ETUDES PAR DYNAMIQUE MOLECULAIRE ET SPECTROSCOPIE RMN DE LA STRUCTURE LOCALE DES PETITS PEPTIDES EN SOLUTION AQUEUSE METTANT EN JEU DES RESIDUS AROMATIQUES

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Book Synopsis ETUDES PAR DYNAMIQUE MOLECULAIRE ET SPECTROSCOPIE RMN DE LA STRUCTURE LOCALE DES PETITS PEPTIDES EN SOLUTION AQUEUSE METTANT EN JEU DES RESIDUS AROMATIQUES by : FREDERICO.. NARDI

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DETERMINATION, PAR RMN, DE LA STRUCTURE TRIDIMENSIONNELLE DES PEPTIDES ET DES PROTEINES

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Book Synopsis DETERMINATION, PAR RMN, DE LA STRUCTURE TRIDIMENSIONNELLE DES PEPTIDES ET DES PROTEINES by : YINSHAN.. YANG

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ETUDE STRUCTURALE ET DYNAMIQUE DES PEPTIDES EN SOLUTION PAR RMN

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Book Synopsis ETUDE STRUCTURALE ET DYNAMIQUE DES PEPTIDES EN SOLUTION PAR RMN by : Bruno Kieffer

Download or read book ETUDE STRUCTURALE ET DYNAMIQUE DES PEPTIDES EN SOLUTION PAR RMN written by Bruno Kieffer and published by . This book was released on 1992 with total page pages. Available in PDF, EPUB and Kindle. Book excerpt: LA RESONANCE MAGNETIQUE NUCLEAIRE (RMN) EST UNE METHODE DE CHOIX POUR L'ETUDE DE PEPTIDES DE PETITES ET MOYENNES TAILLES IMPLIQUES DANS DES PROCESSUS DE RECONNAISSANCE INTERMOLECULAIRE. LA COMPREHENSION DE CES MECANISMES DE RECONNAISSANCE FAIT INTERVENIR NON SEULEMENT LA STRUCTURE DES MOLECULES EN PRESENCE, MAIS AUSSI LEUR CAPACITE D'ADAPTATION CONFORMATIONNELLE QUI EST RELIEE A LA FLEXIBILITE DE CES MOLECULES. L'ETUDE ET LA QUANTIFICATION DES PHENOMENES DE RELAXATION ENTRE SPINS A L'INTERIEUR D'UN PEPTIDE PERMET D'ACCEDER A DES INFORMATIONS STRUCTURALES ET DYNAMIQUES. CEPENDANT, LA COMPLEXITE DES MECANISMES DE RELAXATION OU LA FAIBLE SENSIBILITE DE NOYAUX COMME LE CARBONE 13 RENDENT LA DETERMINATION DE CES PARAMETRES DIFFICILE. NOUS AVONS DEVELOPPE DES METHODES SPECTROSCOPIQUES ET INFORMATIQUES PERMETTANT DE QUANTIFIER ET D'ANALYSER CES PARAMETRES DE RELAXATION. NOUS AVONS APPLIQUE CES METHODES A L'ANALYSE DE LA STRUCTURE ET DE LA DYNAMIQUE DE DEUX TYPES DE PEPTIDES. D'UNE PART, NOUS AVONS MODELISE LA STRUCTURE ET LA FLEXIBILITE DE DEUX PEPTIDES CYCLIQUES MIMANT UN SITE ANTIGENIQUE DE L'HEMAGGLUTININE DU VIRUS DE LA GRIPPE. D'AUTRE PART, NOUS NOUS INTERESSES A LA STRUCTURE D'UN TETRAPEPTIDE ISSU DE LA FIBRONECTINE ET IMPLIQUE DANS LE PHENOMENE D'ADHESION CELLULAIRE

ETUDE STRUCTURALE PAR RMN DE PEPTIDES ET PROTEINES DU SYSTEME VASOREGULATEUR

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Book Synopsis ETUDE STRUCTURALE PAR RMN DE PEPTIDES ET PROTEINES DU SYSTEME VASOREGULATEUR by : PHILIPPE.. SIZUN

Download or read book ETUDE STRUCTURALE PAR RMN DE PEPTIDES ET PROTEINES DU SYSTEME VASOREGULATEUR written by PHILIPPE.. SIZUN and published by . This book was released on 1991 with total page pages. Available in PDF, EPUB and Kindle. Book excerpt: L'OBJECTIF PRINCIPAL DE CE TRAVAIL EST DE MONTRER COMMENT LA RESONANCE MAGNETIQUE NUCLEAIRE (RMN) PERMET D'ACCEDER A LA STRUCTURE TRIDIMENSIONNELLE DE PEPTIDES ET DE PROTEINES EN SOLUTION. L'ETUDE COMPAREE DE COMPOSES VASOREGULATEURS ALLANT DE PETITS PEPTIDES HORMONAUX A UNE PROTEINE DE 65 RESIDUS, L'HIRUDINE A PERMIS DE DEGAGER LES STRATEGIES 1D ET 2D LES PLUS APPROPRIEES. IL EST APPARU QUE LA TAILLE DU PEPTIDE JOUE UN ROLE FONDAMENTAL DANS LA PROBABILITE DE STRUCTURATION EN SOLUTION, L'ABSENCE DE COOPERATIVITE LIMITANT AINSI LA MOBILITE STRUCTURALE DE PETITS PEPTIDES. CETTE DERNIERE CROIT DES QUE LA TAILLE AUGMENTE OU QUE DES POINTS DE BLOCAGE CONFORMATIONNELS (PONTS DISULFURE) EXISTENT. POUR UNE PROTEINE TELLE QUE L'HIRUDINE, LA COMBINAISON DES DONNEES RMN EXTRAITE D'EXPERIENCES SPECIFIQUES (DEPLACEMENTS CHIMIQUES CONSTANTES DE COUPLAGE, EFFETS OVERHAUSER, ACCESSIBILITE DES PROTONS AMIDES) ET DE LA MODELISATION MOLECULAIRE CONTRAINTE A PERMIS DE PROPOSER UNE STRUCTURE 3D EN SOLUTION. UNE ANALYSE COMPARATIVE DES STRUCTURES OBTENUES ET DE CELLES PREVISIBLES GRACE AUX METHODES DE PREDICTION A MIS EN LUMIERE LA NOTION DE PREDISPOSITION CONFORMATIONNELLE POUVANT SERVIR DE BASE AUX ETUDES DE RELATION STRUCTURE-ACTIVITE

ETUDE STRUCTURALE PAR RESONANCE MAGNETIQUE NUCLEAIRE HAUT CHX11F ET MODELISATION MOLECULAIRE DE PEPTIDES ANALOGUES DE LA NEUROTENSINE

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Book Synopsis ETUDE STRUCTURALE PAR RESONANCE MAGNETIQUE NUCLEAIRE HAUT CHX11F ET MODELISATION MOLECULAIRE DE PEPTIDES ANALOGUES DE LA NEUROTENSINE by : LAURENCE.. CONRAUX

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ETUDE DYNAMIQUE ET CONFORMATIONNELLE DE PEPTIDES PAR RMN

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Book Synopsis ETUDE DYNAMIQUE ET CONFORMATIONNELLE DE PEPTIDES PAR RMN by : PATRICIA.. RABIER

Download or read book ETUDE DYNAMIQUE ET CONFORMATIONNELLE DE PEPTIDES PAR RMN written by PATRICIA.. RABIER and published by . This book was released on 1999 with total page 266 pages. Available in PDF, EPUB and Kindle. Book excerpt: LA RELAXATION DU 1 3C NOUS FOURNIT DES INFORMATIONS SUR LA DYNAMIQUE DES PROTEINES. LA NATURE DES MOUVEMENTS DANS LES PROTEINES EST MAL CONNUE, NEANMOINS, IL EST GENERALEMENT ADMIS QU'ILS AIDENT A LA RECONNAISSANCE MUTUELLE ENTRE MOLECULES AINSI QU'A LA CATALYSE ENZYMATIQUE. GRACE AU DEVELOPPEMENT DE TECHNIQUES RMN PERMETTANT D'ENREGISTRER PLUS RAPIDEMENT LES PARAMETRES DE RELAXATION, NOUS AVONS ENTREPRIS L'ETUDE DYNAMIQUE DE DIFFERENTS PEPTIDES. PMP-D2 (35 RESIDUS) A AINSI ETE ETUDIE EN FONCTION DE LA TEMPERATURE ; PMP-C (36 RESIDUS), PRESENTANT 35% D'HOMOLOGIE AVEC LE PRECEDENT MAIS NATURELLEMENT FUCOSYLE. L'ETUDE DES DEUX FORMES GLYCOSYLEE OU NON DE CE PEPTIDE REVELE QUE LE FUCOSE RALENTIT LA FREQUENCE DES MOUVEMENTS DU PEPTIDE ET PAS UNIQUEMENT DE LA REGION A LAQUELLE IL EST ATTACHE. L'ETUDE DE PMP-D2 MET EN VALEUR LA COMPLEXITE DES MOUVEMENTS ANIMANT UN PEPTIDE. ENFIN, UN DERNIER CHAPITRE EST CONSACRE A L'ANALYSE CONFORMATIONNELLE DE PETITS PEPTIDES, FRAGMENTS DE PROTEINES. DE TELS FRAGMENTS SONT SOUVENT ETUDIES POUR DES RAISONS PRATIQUES. ILS SONT FACILEMENT SYNTHETISABLES ET LEUR ANALYSE CONFORMATIONNELLE EST PLUS FACILE ET PLUS RAPIDE. NEANMOINS, DES FRAGMENTS, ISOLES DE LEUR ENVIRONNEMENT PROTEIQUE, N'ONT SOUVENT PAS UNE CONFORMATION BIEN DEFINIE.

Structures tridimensionnelles de peptides par RMN et modélisation moléculaire [microforme]

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Publisher : National Library of Canada = Bibliothèque nationale du Canada
ISBN 13 : 9780612154438
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Book Synopsis Structures tridimensionnelles de peptides par RMN et modélisation moléculaire [microforme] by : Abdesslem Khiat

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TECHNIQUES DE MODELISATION MOLECULAIRE DEDIEES A L'ETUDE STRUCTURALE DE PEPTIDES ET PROTEINES EN SOLUTION, A PARTIR DE DONNEES DE RMN. APPLICATION A L'ETUDE DE LA COMPLEMENTATION D'UN MUTANT DE LA PHOSPHOGLYCERATE KINASE ET DU CHANGEMENT CONFORMATIONNEL PH-DEPENDANT DE L'ALPHA-COBRATOXINE

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Book Synopsis TECHNIQUES DE MODELISATION MOLECULAIRE DEDIEES A L'ETUDE STRUCTURALE DE PEPTIDES ET PROTEINES EN SOLUTION, A PARTIR DE DONNEES DE RMN. APPLICATION A L'ETUDE DE LA COMPLEMENTATION D'UN MUTANT DE LA PHOSPHOGLYCERATE KINASE ET DU CHANGEMENT CONFORMATIONNEL PH-DEPENDANT DE L'ALPHA-COBRATOXINE by : Éric Leroy

Download or read book TECHNIQUES DE MODELISATION MOLECULAIRE DEDIEES A L'ETUDE STRUCTURALE DE PEPTIDES ET PROTEINES EN SOLUTION, A PARTIR DE DONNEES DE RMN. APPLICATION A L'ETUDE DE LA COMPLEMENTATION D'UN MUTANT DE LA PHOSPHOGLYCERATE KINASE ET DU CHANGEMENT CONFORMATIONNEL PH-DEPENDANT DE L'ALPHA-COBRATOXINE written by Éric Leroy and published by . This book was released on 1996 with total page 226 pages. Available in PDF, EPUB and Kindle. Book excerpt: LES TECHNIQUES DE MODELISATION MOLECULAIRE PERMETTENT DE RECONSTRUIRE ET D'ETUDIER DES MODELES DE STRUCTURE 3D DE MOLECULES PROTEIQUES EN SOLUTION A PARTIR DE DONNEES DE RESONANCE MAGNETIQUE NUCLEAIRE. DES MODELES DE STRUCTURE 3D D'UN DODECAPEPTIDE DE SYNTHESE COMPLEMENTANT UN MUTANT DE LA PHOSPHOGLYCERATE KINASE ONT ETE RESOLUS A PARTIR DE DONNEES D'EFFET NUCLEAIRE OVERHAUSER TRANSFERE. CES MODELES CONFORTENT L'HYPOTHESE DE LA COMPLEMENTATION STRUCTURALE DU MUTANT. LA MODELISATION DU COMPLEXE SOLVATE MUTANT/PEPTIDE A FAIT APPARAITRE DES LIMITES DANS LA CAPACITE DES CHAMPS DE FORCE A TRAITER LES ERREURS CONFORMATIONNELLES LOCALES. L'ETABLISSEMENT DE MODELES DE STRUCTURE 3D DE L'ALPHA-COBRATOXINE A PH NEUTRE A PERMIS D'ETUDIER, A L'ECHELLE ATOMIQUE, LES DIFFERENCES CONFORMATIONNELLES PH-DEPENDANTES DE CETTE PROTEINE. LE CHANGEMENT CONFORMATIONNEL ENTRE LES DEUX ETATS STABLES DE LA MOLECULE A ALORS ETE MODELISE PAR LA METHODE DE SIMULATION DE DYNAMIQUE DIRIGEE. CETTE TECHNIQUE A PERMIS DE METTRE EN EVIDENCE LES DIFFERENTS RESIDUS IMPLIQUES DANS LA TRANSITION

ETUDE STRUCTURALE ET DYNAMIQUE PAR RMN DE DEUX FAMILLES DE PEPTIDES

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Book Synopsis ETUDE STRUCTURALE ET DYNAMIQUE PAR RMN DE DEUX FAMILLES DE PEPTIDES by : GEORGES.. MER

Download or read book ETUDE STRUCTURALE ET DYNAMIQUE PAR RMN DE DEUX FAMILLES DE PEPTIDES written by GEORGES.. MER and published by . This book was released on 1996 with total page 208 pages. Available in PDF, EPUB and Kindle. Book excerpt: NOUS AVONS DETERMINE LES STRUCTURES TRIDIMENSIONNELLES, PAR RESONANCE MAGNETIQUE NUCLEAIRE (RMN), DE TROIS INHIBITEURS DE PROTEASES A SERINE DE L'INSECTE LOCUSTA MIGRATORIA: PMP-C, PMP-C FUCOSYLE (LA FORME NATURELLE) ET PMP-D2. LES TROIS MOLECULES ONT DES STRUCTURES TERTIAIRES TRES SIMILAIRES. ELLES COMPORTENT TROIS PONTS DISULFURE ET PRESENTENT UN COURT FEUILLET BETA A TROIS BRINS ANTIPARALLELES S'ORGANISANT AUTOUR D'UN CUR DE RESIDUS HYDROPHOBES. CETTE ETUDE, ASSOCIEE A UNE ANALYSE FONCTIONNELLE REALISEE DANS LE GROUPE DE HELENE HIETTER (INSTITUT DE NEUROCHIMIE DU CNRS, STRASBOURG), A PERMIS DE MONTRER QUE LE SITE REACTIF EST SITUE ENTRE DEUX DEMI-CYSTINES DE L'EXTREMITE CARBOXY-TERMINALE ET QUE CES PEPTIDES SONT LES PREMIERS REPRESENTANTS D'UNE NOUVELLE FAMILLE D'INHIBITEURS DE PROTEASES. D'UN POINT DE VUE PLUS FONDAMENTAL, PAR LA MESURE DES PARAMETRES DE RELAXATION DU CARBONE 13, NOUS AVONS MONTRE QUE PMP-D2 ETAIT ANIME DE MOUVEMENTS LENTS (DANS LE DOMAINE DE LA MILLISECONDE). CES MOUVEMENTS POURRAIENT ETRE RELIES A L'ISOMERISATION CONFORMATIONNELLE D'UN OU PLUSIEURS PONTS DISULFURE. UNE ETUDE COMPAREE DES DEUX FORMES DE PMP-C (AVEC ET SANS FUCOSE) NOUS A PERMIS D'ANALYSER L'EFFET D'UNE GLYCOSYLATION SUR LA STRUCTURE ET LA DYNAMIQUE D'UN PEPTIDE. NOS RESULTATS MONTRENT QUE LE FUCOSE ADOPTE UNE ORIENTATION PRIVILEGIEE, QU'IL NE MODIFIE PAS LA CONFORMATION DE LA CHAINE PRINCIPALE DU PEPTIDE, MAIS QU'IL AFFECTE LA DYNAMIQUE INTERNE ET STABILISE LA MOLECULE. L'ENERGIE DE STABILISATION EST D'ENVIRON 1 KCAL/MOL A 20C. D'AUTRE PART, NOUS PRESENTONS L'ANALYSE CONFORMATIONNELLE D'UNE SERIE DE PEPTIDES ANTIAGREGANTS PLAQUETTAIRES. CETTE ETUDE A REVELE QUE LES CARBONES ET PROTONS ALPHA D'UNE SEQUENCE ANTIAGREGANTE DU TYPE ARG-GLY-ASP-PHE EN COUDE BETA ETAIENT SUPERPOSABLES AUX CARBONES ET PROTONS ALPHA DES MEMES RESIDUS DANS UNE SEQUENCE ARG-GLY-XXX-PHE-ASP EN HELICE ALPHA. CES TRAVAUX ONT PAR AILLEURS DEBOUCHE SUR L'UTILISATION D'UNE PETITE TOXINE DE SCORPION COMME SUPPORT POUR FIXER UNE SEQUENCE DONNEE D'ACIDES AMINES DANS UNE CONFORMATION EN HELICE ALPHA

ETUDE PAR RMN 2D DE LA STRUCTURE TRIDIMENSIONNELLE EN SOLUTION AQUEUSE, DE PROTEINES DE TRANSFERT DE LIPIDES, ET DE LEURS INTERACTIONS AVEC LES LIPIDES

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Book Synopsis ETUDE PAR RMN 2D DE LA STRUCTURE TRIDIMENSIONNELLE EN SOLUTION AQUEUSE, DE PROTEINES DE TRANSFERT DE LIPIDES, ET DE LEURS INTERACTIONS AVEC LES LIPIDES by : MARIE-CHRISTINE.. PETIT

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STRUCTURE ET DYNAMIQUE DE FRAGMENTS PEPTIDIQUES

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Book Synopsis STRUCTURE ET DYNAMIQUE DE FRAGMENTS PEPTIDIQUES by : François Macquaire

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ANALYSE CONFORMATIONNELLE DE PEPTIDES. ETUDE DE RELATIONS STRUCTURE/ACTIVITE

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Book Synopsis ANALYSE CONFORMATIONNELLE DE PEPTIDES. ETUDE DE RELATIONS STRUCTURE/ACTIVITE by : SONJA.. MEDDEB

Download or read book ANALYSE CONFORMATIONNELLE DE PEPTIDES. ETUDE DE RELATIONS STRUCTURE/ACTIVITE written by SONJA.. MEDDEB and published by . This book was released on 1994 with total page 203 pages. Available in PDF, EPUB and Kindle. Book excerpt: CETTE THESE PORTE SUR LA DETERMINATION DE LA STRUCTURE TRIDIMENSIONNELLE DE PEPTIDES A L'AIDE DE DONNEES RMN DANS LE BUT DE DETERMINER DES RELATIONS STRUCTURE/ACTIVITE. DEUX ETUDES SONT PRESENTEES. LA PREMIERE CONCERNE DES PEPTIDES DE SEQUENCE KRDS ET DERIVES. ISOLE A PARTIR DE LA LACTOTRANSFERRINE HUMAINE, LE PEPTIDE DE SEQUENCE KRDS A UNE ACTIVITE ANTITHROMBOTIQUE. UNE ETUDE RMN A ETE REALISEE SUR CE PEPTIDE QUI EST STABLE ET STRUCTURE DANS L'EAU. LES DONNEES RMN ETANT INSUFFISANTES POUR DETERMINER LA STRUCTURE, NOUS AVONS PROCEDE A UNE EXPLORATION SYSTEMATIQUE DE L'ESPACE CONFORMATIONNELLE PAR RECUIT SIMULE SANS INTRODUIRE DE CONTRAINTES RMN. UN ENSEMBLE DE STRUCTURES A AINSI ETE GENERE. LES RESULTATS OBTENUS CORROBORENT LES RESULTATS OBTENUS EN RMN. UN TRAVAIL D'ANALYSE A PERMIS DE GROUPER CES STRUCTURES EN DIFFERENTES CLASSES SUR LA BASE DE LA MATRICE D'INTERACTION ELECTROSTATIQUE ASSOCIEE A CHAQUE STRUCTURE. DES ETUDES SIMILAIRES ONT ETE REALISEES SUR DES PEPTIDES DERIVES. LA COMPARAISON DES CLASSES OBTENUES POUR CES DIFFERENTS PEPTIDES A CONDUIT A EMETTRE L'HYPOTHESE D'UNE RELATION STRUCTURE/ACTIVITE. LA SECONDE ETUDE PORTE SUR DES PEPTIDES POSSEDANT UNE ACTIVITE ANTIBACTERIENNE, SECRETES DANS LA PEAU DE L'AMPHIBIEN XENOPUS LAEVIS. LA COMPARAISON DES PEPTIDES PRECURSEURS A CONDUIT A LA SYNTHESE D'UN TETRADECAPEPTIDE COMPORTANT LA SEQUENCE CONSENSUS RXVRG HAUTEMENT CONSERVEE. CE PEPTIDE A SERVI DE SUBSTRAT POUR ISOLER UNE ENZYME DE MATURATION POST TRADUCTIONNELLE DENOMMEE RXVRG-ENDOPROTEASE QUI COUPE ENTRE L'ARGININE ET LA GLYCINE. NOUS AVONS REALISE UNE EXPLORATION DE L'ESPACE CONFORMATIONNEL PAR RECUIT SIMULE, EN INTRODUISANT DES CONTRAINTES RMN, SUR CE TETRADECAPEPTIDE MODELE AINSI QUE SUR DEUX DERIVES. UNE INCOMPATIBILITE DE CERTAINES DONNEES RMN A CONDUIT A LA DETERMINATION DE DEUX MODELES POUR LE TETRADECAPEPTIDE. DE MEME POUR L'UNDECAPEPTIDE CORRESPONDANT AUX RESIDUS 4-14 DU TETRADECAPEPTIDE. UNE HYPOTHESE DE RELATION STRUCTURE/ACTIVITE EST EMISE. (LES LOGICIEL CHARMM ET XPLOR ONT ETE UTILISES)

Dynamique et orientation de peptides transmembranaires

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Total Pages : 196 pages
Book Rating : 4.:/5 (8 download)

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Book Synopsis Dynamique et orientation de peptides transmembranaires by : Léa Rougier

Download or read book Dynamique et orientation de peptides transmembranaires written by Léa Rougier and published by . This book was released on 2010 with total page 196 pages. Available in PDF, EPUB and Kindle. Book excerpt: Ce mémoire montre une approche nouvelle, couplant calculs quantiques de propriétés RMN et expériences de RMN du solide. Le but est de mettre en place une méthodologie permettant de déterminer l'orientation et la dynamique de peptides modèles en membrane modèle, plus particulièrement pour le peptide WALP 23 en membrane de DMPC. Dans un premier temps, une étude complète a été menée sur les calculs quantiques de tenseurs d'anisotropies de déplacement chimique (CSA), afin de déterminer les éléments importants à prendre en compte dans ce type de calcul. Ces calculs ont ensuite été couplés à des mesures de RMN du solide, permettant de déterminer les paramètres d'orientation et de dynamique du peptide, en utilisant une approche qui consiste à prendre en compte différentes contraintes RMN. Dans un deuxième temps, une étude couplant calculs quantiques de tenseurs CSA et structures issues de dynamique moléculaire a été menée afin de prendre en compte des effets de dynamique interne du peptide.

Détermination par résonance magnétique nucléaire de structures tridimentionnelles de peptides et de protéines

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Total Pages : 181 pages
Book Rating : 4.:/5 (492 download)

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Book Synopsis Détermination par résonance magnétique nucléaire de structures tridimentionnelles de peptides et de protéines by : Emeric Wasielewski

Download or read book Détermination par résonance magnétique nucléaire de structures tridimentionnelles de peptides et de protéines written by Emeric Wasielewski and published by . This book was released on 2004 with total page 181 pages. Available in PDF, EPUB and Kindle. Book excerpt: Les fonctions spécifiques des protéines résultent de leurs caractéristiques structurales et dynamiques. La spectroscopie de Résonance Magnétique Nucléaire (RMN) est l'une des principales techniques apportant ces deux types d'informations, tant pour de petits peptides que pour des protéines plus imposantes. Cependant, les stratégies d'études se différencient selon la taille des biomolécules. Durant mon travail de thèse, je me suis attaché à l'étude structurale par spectrométrie RMN de deux types de molécules intervenant dans deux contextes biologiques différents.Le premier contexte biologique abordé est celui du métabolisme du fer chez les bactéries Gram-négatif. Les études structurales de deux sidérophores peptidiques bactériens sont présentées : l'azoverdine d'Azomonas macrocytogenes ATCC 12 334 et la pyoverdine PaA de Pseudomonas aeruginosa ATCC 15 692. Le but de ces études est la compréhension du mécanisme de reconnaissance spécifique complexe métallique sidérophore/récepteur membranaire. Nous avons adapté à l'étude de ces peptides des méthodes utilisées sur les protéines. Ceci comprend une séquence de type HNCA utilisée en abondance naturelle de 13C et l'utilisation des couplages dipolaires résiduels (RDC). Nous avons également étudié le cas de plusieurs conformères en échange chimique intermédiaire.Le second contexte biologique abordé est celui de la transcription et de la réparation de l'ADN via l'étude structurale et dynamique de trois domaines de sous-unités du facteur humain de transcription/réparation TFIIH : MAT1, p44 et p62. La première partie décrit la détermination structurale du domaine RING C3HC4 de la sous-unité MAT1. La seconde partie présente une étude sur la dynamique et les propriétés d'échange métallique du domaine RING C8 de la sous-unité p44. Enfin, la troisième partie démontre l'apport des contraintes orientationnelles issues des RDC dans l'affinement des structures tridimensionnelles du domaine PH de la sous-unité p62.

Détermination Par Rmn de Structures 3d de Peptides Et de Protéines

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Publisher : Omniscriptum
ISBN 13 : 9786131520228
Total Pages : 200 pages
Book Rating : 4.5/5 (22 download)

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Book Synopsis Détermination Par Rmn de Structures 3d de Peptides Et de Protéines by : Emeric Wasielewski

Download or read book Détermination Par Rmn de Structures 3d de Peptides Et de Protéines written by Emeric Wasielewski and published by Omniscriptum. This book was released on 2011-05 with total page 200 pages. Available in PDF, EPUB and Kindle. Book excerpt: Les fonctions sp cifiques des prot ines r sultent de leurs caract ristiques structurales et dynamiques. La spectroscopie RMN apporte ces deux informations, avec des strat gies d' tudes diff rentes selon la taille des biomol cules. Ce travail pr sente les tudes par RMN de deux types de mol cules intervenant dans deux contextes biologiques diff rents. D'abord le m tabolisme du fer chez les bact ries Gram-n gatif: compr hension de la reconnaissance sp cifique complexe m tallique sid rophore/r cepteur membranaire. Deux sid rophores peptidiques bact riens ont t tudi s (azoverdine d'Azomonas macrocytogenes ATCC 12334 et pyoverdine PaA de Pseudomonas aeruginosa ATCC 15692) en adaptant des m thodes utilis es sur les prot ines (HNCA en abondance naturelle de 13C, couplages dipolaires r siduels (RDC)). Le cas de conform res de PaA en change chimique interm diaire a t tudi . Ensuite la transcription et la r paration de l'ADN via l' tude de trois domaines de sous-unit s du facteur humain de transcription/r paration TFIIH: MAT1 (domaine RING C3HC4), p44 (dynamique et propri t s d' change m tallique du domaine RING C8) et p62 (utilisation des RDC pour le domaine PH).

INTERACTION PEPTIDES-MEMBRANES

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Total Pages : pages
Book Rating : 4.:/5 (49 download)

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Book Synopsis INTERACTION PEPTIDES-MEMBRANES by : Beate Bersch

Download or read book INTERACTION PEPTIDES-MEMBRANES written by Beate Bersch and published by . This book was released on 1992 with total page pages. Available in PDF, EPUB and Kindle. Book excerpt: LA CONNAISSANCE DE LA CONFORMATION MEMBRANAIRE D'UN NEUROPEPTIDE PEUT APPORTER DES INFORMATIONS IMPORTANTES SUR LE MODELE RECEPTEUR-PEPTIDE AINSI QUE SUR LA RELATION STRUCTURE-ACTIVITE. NOUS AVONS UTILISE UNE TECHNIQUE DE RESONANCE MAGNETIQUE NUCLEAIRE (RMN), LE NOE TRANSFERE (TRNOE), QUI NOUS PERMET DE DETERMINER LA CONFORMATION DE PEPTIDES DANS DES LIPOSOMES. CES EXPERIENCES ONT ETE EFFECTUEES EN PRESENCE DE LIPOSOMES PERDEUTERIES. POUR CELA, NOUS AVONS DU METTRE AU POINT LA SYNTHESE TOTALE DE DIFFERENTES CLASSES DE PHOSPHOLIPIDES PERDEUTERIES: LA PHOSPHATIDYLCHOLINE, LE PHOSPHATIDYLGLYCEROL, L'ACIDE PHOSPHATIDIQUE ET LA PHOSPHATIDYLETHANOLAMINE. LES TACHYKININES, UNE FAMILLE DE NEUROPEPTIDES IMPLIQUES DANS UN MULTITUDE D'EFFETS PHYSIOLOGIQUES, ONT ETE CHOISIES POUR LES ETUDES PAR RMN. DES AGONISTES SPECIFIQUES DE DEUX DES RECEPTEURS DES TACHYKININES ONT ETE ETUDIES EN SOLUTION AQUEUSE ET EN PRESENCE DE LIPOSOMES: LA SUBSTANCE P ET LE SENKTIDE (ANALOGUE ACTIF DE LA NEUROKININE B) POUR LES RECEPTEURS NK-1 ET NK-3 RESPECTIVEMENT. L'UTILISATION DE LA RMN 2D A PERMIS D'ATTRIBUER LES SPECTRES PROTONS DES PEPTIDES ET DE DEMONTRER, QU'ILS NE POSSEDENT AUCUNE CONFORMATION PREFERENTIELLE DANS L'EAU. PAR CONTRE, LES DEUX PEPTIDES SE STRUCTURENT EN PRESENCE DE MEMBRANES. LES CONFORMATIONS MEMBRANAIRES DE LA SUBSTANCE P ET DU SENKTIDE ONT PU ETRE DETERMINEES A PARTIR DES SPECTRES TRNOE EN DEUX DIMENSIONS EN COMBINAISON AVEC DES CALCULS DE LA GEOMETRIE DE DISTANCES. CES STRUCTURES ONT ETE COMPAREES AVEC DES DONNEES DE LA LITTERATURE ET NOUS AVONS DISCUTE LEUR SIGNIFICATION BIOLOGIQUE

DEVELOPPEMENTS METHODOLOGIQUES ET ETUDES DYNAMIQUES DE PROTEINES EN SOLUTION PAR RELAXATION EN RMN

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Total Pages : 188 pages
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Book Synopsis DEVELOPPEMENTS METHODOLOGIQUES ET ETUDES DYNAMIQUES DE PROTEINES EN SOLUTION PAR RELAXATION EN RMN by : FLORENCE.. CORDIER

Download or read book DEVELOPPEMENTS METHODOLOGIQUES ET ETUDES DYNAMIQUES DE PROTEINES EN SOLUTION PAR RELAXATION EN RMN written by FLORENCE.. CORDIER and published by . This book was released on 1998 with total page 188 pages. Available in PDF, EPUB and Kindle. Book excerpt: DANS LA PREMIERE PARTIE DE CE TRAVAIL, NOUS AVONS PROPOSE LE PRINCIPE DE DIMENSIONALITE REDUITE DANS DES EXPERIENCES HETERONUCLEAIRES MULTIDIMENSIONNELLES SUR DES PROTEINES MARQUEES #1#5N/#1#3C. DEUX EXPERIENCES (3D-MQ-HNCOCA ET 3D-MQ-NOESY DOUBLEMENT FILTREE #1#5N/#1#5N ET/OU #1#5N/#1#3C) UTILISANT CE PRINCIPE ONT ETE MISES AU POINT ET EN ONT MONTRE L'INTERET POUR L'ATTRIBUTION ET LE CALCUL DE STRUCTURE TRIDIMENSIONNELLE PRELIMINAIRE. LA MAJEURE PARTIE DE CE TRAVAIL CONCERNE L'ETUDE DE LA DYNAMIQUE DES PROTEINES DANS LA GAMME PS-MS PAR LA MESURE DE PARAMETRES DE RELAXATION. DANS UN PREMIER TEMPS, LES PARAMETRES DE RELAXATION DES NOYAUX #1#5N CONTENANT L'INFORMATION SUR LA MOBILITE DES VECTEURS N-H DU CYTOCHROME C#2 DE RHODOBACTER CAPSULATUS ONT ETE INTERPRETES EN PARAMETRES DYNAMIQUES GRACE A L'APPROCHE DE LIPARI ET SZABO. LES MOUVEMENTS INTERNES SONT CARACTERISES PAR UN PARAMETRE D'ORDRE ET UN TEMPS DE CORRELATION INTERNE ET SONT SUPERPOSES A UN MOUVEMENT DE REORIENTATION ISOTROPE CARACTERISE PAR UN TEMPS DE CORRELATION GLOBAL. LA QUALITE DES PARAMETRES DYNAMIQUES EXTRAITS NOUS ONT INCITE A CONSIDERER UN MOUVEMENT GLOBAL ANISOTROPE, CARACTERISE PAR UN TENSEUR DE DIFFUSION D. CELUI-CI A PU ETRE CARACTERISE AVEC UNE EXCELLENTE PRECISION ET LES PARAMETRES DE MOBILITE INTERNE ONT PU ENSUITE ETRE EXTRAITS PAR CETTE APPROCHE HYBRIDE AVEC UNE PLUS GRANDE FIABILITE, METTANT EN EVIDENCE LA NATURE RELATIVEMENT COMPACTE DE CETTE PROTEINE MEME SI UNE PLUS GRANDE FLEXIBILITE EST OBSERVEE DANS CERTAINES BOUCLES. ENFIN, L'ETUDE DU VECTEUR CA-CO A ETE ENTREPRISE DANS L'OPTIQUE DE CARACTERISER L'ANISOTROPIE DES MOUVEMENTS LOCAUX, A COTE DE L'INFORMATION ISSUE DU VECTEUR N-H. DES SIMULATIONS DE DYNAMIQUE MOLECULAIRE ONT PERMIS DE PROPOSER DES MODELES DE MOUVEMENTS DU PLAN PEPTIDIQUE POUR CERTAINS RESIDUS ET UNE EXPERIENCE RMN TRIPLE-RESONANCE DESTINEE A LA MESURE DE LA VITESSE DE RELAXATION CROISEE CA-CO A ETE MISE EN PLACE. CE PARAMETRE A FINALEMENT PU ETRE CONVERTI EN PARAMETRE D'ORDRE.