Etude Des Interactions Entre La Plante Arabidopsis Thaliana L Heynh Et Le Ver De Terre Aporrectodea Caliginosa Savigny

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Etude des interactions entre la plante Arabidopsis thaliana (L.) Heynh et le ver de terre Aporrectodea caliginosa (Savigny)

Author : Ulrike Jana
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Book Synopsis Etude des interactions entre la plante Arabidopsis thaliana (L.) Heynh et le ver de terre Aporrectodea caliginosa (Savigny) by : Ulrike Jana

Download or read book Etude des interactions entre la plante Arabidopsis thaliana (L.) Heynh et le ver de terre Aporrectodea caliginosa (Savigny) written by Ulrike Jana and published by . This book was released on 2009 with total page 0 pages. Available in PDF, EPUB and Kindle. Book excerpt: L'arsenic et l'antimoine bien que n'étant pas recensés parmi les polluants majeurs de l'environnement sont souvent retrouvés associés à d'autres contaminants. En France, et plus particulièrement dans la région Auvergne, de nombreux sites miniers où s'effectuait l'extraction de l'antimoine sont désormais à l'abandon. Pouvant présenter des risques pour les populations avoisinantes, leur réhabilitation est donc une mission d'intérêt public. L'idée de ce travail de doctorat est de tester l'effet d'un catalyseur : le ver de terre sur l'efficacité des processus de phytoremédiation. En tant qu'« ingénieurs du sol », ils sont à la base des processus de pédogénèse et peuvent donc assurer la restructuration du sol. De plus, de nombreuses études ont montré leurs effets positifs sur la production de biomasse végétale. Cependant, les mécanismes moléculaires responsables de cette acroissement de production demeurent méconnus. Un système expérimental novateur, jamais utilisé en Ecologie des Sols et couplant la plante modèle Arabidopsis thaliana (L.) Heynh et Aporrectodea caliginosa (Savigny), un ver de terre endogé commun des régions tempérées, a été mis en place afin de 1) identifier les principales voies métaboliques modifiées en réponse aux vers de terre et pouvant expliquer leurs effets positifs sur la croissance et le développement des végétaux, 2) étudier la nutrition minérale en fer et en phosphate, notamment au niveau des variations d'expression des transporteurs de ces deux éléments, 3) tester ce système pour la phytoextraction de sédiments, issus d'un ancien site minier, contaminés à l'arsenic et à l'antimoine. Les résultats montrent que l'amélioration des processus de minéralisation est déterminante dans l'accroissement de la biomasse d'Arabidopsis thaliana qui se traduit aussi par une élévation des teneurs en azote dans les parties aériennes. Cependant, la présence de phytohormones, produites par des bactéries activées par leur transit dans le ver de terre semble également impliquée dans le renforcement de l'absorption d'azote. A l'échelle moléculaire, les vers entraînent une surexpression du gène HBT, impliqué dans la division cellulaire et semblent diminuer le stress oxydant puisque la quantité de transcrits SOD Cu/Zn diminue. Les résultats montrent de plus que les vers de terre augmentent de façon significative l'absorption et l'accumulation de fer, de phosphate et d'autres minéraux essentiels à la croissance du végétal. Moléculairement, l'augmentation de l'absorption des nutriments se traduit par une augmentation de la transcription de certains gènes codant des transporteurs tels que PHT1.3, qui est un transporteur de haute affinité pour le phosphate. Une augmentation de la transcription et également de l'activité de la protéine FRO2, qui est à l'origine de la chélation et de la réduction du fer a été observée. Dans les feuilles, les vers de terre induisent de manière systémique la surexpression d'un transporteur de phosphate localisé dans les chloroplastes, PHT2.1 et la surexpression de transporteurs du fer appartenant à la famille des NRAMPs, notamment NRAMP1,2 et 6. Dans le contexte d'une problématique de phytoremédiation, l'effet des vers de terre sur la capacité de phytoextraction d'Arabidopsis a été testé et, il ressort clairement de cette étude que les vers de terre permettent une meilleure absorption d'antimoine et d'arsenic. Cependant, ces deux métalloïdes tendent à rester dans les racines et ne sont que faiblement transferrés vers les parties aériennes. Cette formidable augmentation des concentrations en polluants dans les racines entraîne un retard de croissance considérable et affecte, dans une moindre mesure cependant, l'activité photosynthétique et les échanges gazeux d'Arabidopsis. Ainsi, ce travail de thèse a donc tout d'abord démontré la sensibilité aux vers de terre de la plante modèle Arabidopsis thaliana. Ce système expérimental novateur offre de nouvelles possibilités de recherches dans le domaine des études des interactions entre les vers de terre et les plantes, notamment en raison de la grande diversité de mutants d'Arabidopsis. De plus, ce travail a également permis de démontrer le rôle crucial de catalyseur que peuvent jouer les vers de terre en vue d'optimisation des processus de phytoextraction.

Effet du ver de terre Aporrectodea caliginosa sur la croissance des plantes, leur développement et leur résistance aux pathogènes

Author : Ruben Puga Freitas
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Book Synopsis Effet du ver de terre Aporrectodea caliginosa sur la croissance des plantes, leur développement et leur résistance aux pathogènes by : Ruben Puga Freitas

Download or read book Effet du ver de terre Aporrectodea caliginosa sur la croissance des plantes, leur développement et leur résistance aux pathogènes written by Ruben Puga Freitas and published by . This book was released on 2012 with total page 0 pages. Available in PDF, EPUB and Kindle. Book excerpt: Les plantes se développent et évoluent en interaction avec les organismes du sol. L'impact des vers de terre sur la croissance des plantes, généralement positif, a été attribué à des modifications physiques, chimiques ou biochimiques du sol, souvent sans démonstration rigoureuse. Dans ce travail, les techniques développées en sciences du végétal (culture in vitro, utilisation de mutants et transcriptomique) ont été utilisées afin de comprendre les mécanismes à l'origine de l'effet des vers de terre sur les plantes. Nos résultats apportent de nouvelles connaissances fondamentales: (1) la production de molécules-signal à l'intérieur des déjections de vers de terre a un impact significatif sur la croissance d'Oryza sativa et Lolium perenne. (2) Ces molécules agissent sur la voie de signalisation fortement liée à l'auxine, comme suggéré par l'effet significatif du ver de terre sur la croissance du double mutant d'A. thaliana aux1-7;axr4-2. (3) L'abondance de ces molécules-signal en présence de vers de terre pourrait être liée à la stimulation de certaines populations bactériennes capables de synthétiser de l'auxine. (4) Le ver de terre induit une accumulation de transcrits pour des gènes sous contrôle de l'acide jasmonique et de l'éthylène. Ces hormones sont notamment impliquées dans un mécanisme de résistance systémique induite (ISR), connu pour être induit par certaines rhizobactéries promotrices de la croissance des plantes. Enfin, (5) le piétin échaudage, maladie due à un champignon pathogène, déclenche chez le blé (Triticum aestivum) une réaction d'hypersensibilité et une modification de la signalisation hormonale, qui sont considérées comme des mécanismes de contrôle du métabolisme de la plante qui facilitent l'infection du pathogène. La sévérité de cette maladie est réduite en présence de vers de terre. La synthèse de ces résultats indique que les vers de terre, comme d'autres organismes du sol, modifient l'équilibre hormonal de la plante. L'homéostasie hormonale apparaît comme un élément incontournable pour prédire l'issue des interactions multiples que les plantes entretiennent avec les organismes du sol.

DEUX ASPECTS DES INTERACTIONS ENTRE LES PLANTES ET LES CHAMPIGNONS PHYTOPATHOGENES

Author : PHILIPPE.. REIGNAULT
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Book Synopsis DEUX ASPECTS DES INTERACTIONS ENTRE LES PLANTES ET LES CHAMPIGNONS PHYTOPATHOGENES by : PHILIPPE.. REIGNAULT

Download or read book DEUX ASPECTS DES INTERACTIONS ENTRE LES PLANTES ET LES CHAMPIGNONS PHYTOPATHOGENES written by PHILIPPE.. REIGNAULT and published by . This book was released on 1996 with total page 170 pages. Available in PDF, EPUB and Kindle. Book excerpt: L'INTERACTION ENTRE ARABIDOPSIS THALIANA ET PERONOSPORA PARASITICA A ETE CHOISIE COMME MODELE POUR L'ETUDE DES MECANISMES GENETIQUES ET MOLECULAIRES DE LA RECONNAISSANCE PLANTE/AGENT PATHOGENE. LES REACTIONS DE 46 ECOTYPES D'A. THALIANA A L'ISOLAT NOCO2 DE P. PARASITICA ONT ETE EXAMINEES. TRENTE ET UN ECOTYPES SE SONT AVERES RESISTANTS. LES PHENOTYPES CORRESPONDANTS VARIAIENT ENTRE UNE NECROSE NETTE ET UNE NECROSE FAIBLE ACCOMPAGNEE D'UNE FAIBLE SPORULATION FONGIQUE. DES POPULATIONS DE DESCENDANTS ONT ETE OBTENUES PAR CROISEMENTS ENTRE L'ECOTYPE SENSIBLE COL-0 ET 9 ECOTYPES RESISTANTS (WS-0, PR-0, OY-0, PO-1, BCH-1, GE-1, DI-1, JI-1 ET TE-0) ET ONT ETE TESTEES AVEC NOCO2. LES SEGREGATIONS OBTENUES ONT MONTRE LA PRESENCE D'UNE RESISTANCE (RPP) MONOGENIQUE POUR TOUS LES ECOTYPES EXCEPTE OY-0, POUR LEQUEL LA RESISTANCE ETAIT DIGENIQUE. LES POSITIONS GENOMIQUES DE QUATRE LOCUS RPP ONT ETE DETERMINEES. IL S'AGIT DES LOCUS RPP14.1 DE WS-0, RPP14.2 DE PR-0, RPP14.3 ET RPP 5.2 DE OY-0. RPP14.1 A ETE LOCALISE DANS UN INTERVALLE DE 3,2 CM SUR LE CHROMOSOME 3, AU SEIN D'UNE REGION CONNUE POUR CONTENIR D'AUTRES LOCUS RPP.RPP14.2 DE PR-0 ET RPP14.3 DE OY-0 ONT ETE LOCALISES DANS LE MEME INTERVALLE. DE PLUS, UNE ANALYSE DE SEGREGATION CONCUE POUR SEPARER LES LOCUS RPP14.1 ET RPP14.2 A MONTRE UNE FORTE LIAISON SUGGERANT UN POSSIBLE ALLELISME. LE SECOND LOCUS RPP DE OY-0, RPP5.2, A ETE LOCALISE SUR LE CHROMOSOME 4 ET MONTRE UNE FORTE LIAISON AVEC RPP5.1, AUPARAVANT IDENTIFIE CHEZ L'ECOTYPE LA-ER. LE REGROUPEMENT DES LOCUS RPP SUR LE GENOME D'A. THALIANA EST AINSI ETENDU A DE NOUVEAUX LOCUS QUI CONSTITUENT DES CIBLES POTENTIELLES POUR LE CLONAGE ET L'ETUDE DES GENES RPP. BOTRYTIS CINEREA EST RESPONSABLE DE NOMBREUSES MALADIES SUR UNE LARGE GAMME DE PLANTES SANS SPECIALISATION APPARENTE. IL PRODUIT UNE BATTERIE D'ENZYMES DE DEGRADATION DE LA PAROI VEGETALE SUSPECTEES ETRE IMPORTANTES POUR L'AGRESSIVITE DU CHAMPIGNON. LA TRANSFORMATION GENETIQUE DE B. CINEREA AYANT ETE MISE AU POINT, DIFFERENTES STRATEGIES D'OBTENTION D'UNE SOUCHE DEFICIENTE POUR L'UNE DES ACTIVITES PECTINASES PRODUITES, LA PECTINE METHYLESTERASE (PME), SONT DISCUTEES. LE CLONAGE MOLECULAIRE DU(DES) GENE(S) CORRESPONDANT(S) A ETE TENTE A L'AIDE DE DIFFERENTES TECHNIQUES ET LA STRATEGIE DE GENETIQUE INVERSE A PARTIR DE L'ENZYME PURIFIEE SEMBLE LA PLUS REALISABLE. A PARTIR DU SURNAGEANT DE CULTURE DE LA SOUCHE BD 90, L'ENZYME FUT PURIFIEE ET CARACTERISEE. UNE BANDE UNIQUE A 42 KDA A ETE OBTENUE EN SDS-PAGE. CETTE BANDE CORRESPOND A DEUX ISOFORMES DISTINCTES EN IEF-PAGE A DES VALEURS DE PI DE 7,0 ET 7,4. L'ACTIVITE PME EST PRODUITE PENDANT LA PHASE EXPONENTIELLE DE CROISSANCE DU CHAMPIGNON DANS UN MILIEU CZAPECK-PECTINE. LES MEMES ISOFORMES DE L'ENZYME SONT PRODUITES AVEC DIFFERENTES SOURCES DE CARBONE. ALORS QUE D'AUTRES PECTINASES DE B. CINEREA SONT POLYMORPHIQUES, AUCUNE DIFFERENCE N'A ETE OBSERVEE DANS LE PROFIL PME DE 25 SOUCHES D'ORIGINES DIVERSES. DES ANTICORPS POLYCLONAUX ONT ETE OBTENUS CONTRE LA PME PURIFIEE. ILS RECONNAISSENT LA PME DE B. CINEREA MAIS EGALEMENT LA PME PURIFIEE DE LA BACTERIE ERWINIA CHRYSANTHEMI ET CERTAINES PMES DE LA PLANTE VIGNA RADIATA. DE PLUS, DES ANTICORPS POLYCLONAUX DIRIGES CONTRE LES PMES D'E. CHRYSANTHEMI ET DE LA PLANTE GLYCINE MAX RECONNAISSENT LA PME DE B. CINEREA. CES COMPARAISONS IMMUNOCHIMIQUES MONTRENT LA PRESENCE D'EPITOPES COMMUNS ENTRE CES PMES D'ORIGINES DIFFERENTES.

Étude des mécanismes moléculaires et biochimiques du transport de sucres dans les relations source/puits et au cours de l'interaction entre Arabidopsis thaliana et le champignon nécrotrophe Botrytis cinerea

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Author : Florian Veillet
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Book Synopsis Étude des mécanismes moléculaires et biochimiques du transport de sucres dans les relations source/puits et au cours de l'interaction entre Arabidopsis thaliana et le champignon nécrotrophe Botrytis cinerea by : Florian Veillet

Download or read book Étude des mécanismes moléculaires et biochimiques du transport de sucres dans les relations source/puits et au cours de l'interaction entre Arabidopsis thaliana et le champignon nécrotrophe Botrytis cinerea written by Florian Veillet and published by . This book was released on 2016 with total page 0 pages. Available in PDF, EPUB and Kindle. Book excerpt: La distribution des sucres est un processus clé dans le développement de la plante et cours des interactions plantes/microorganismes.Une recherche des acteurs moléculaires impliqués dans la répartition des ressources carbonées au cours de l'interaction avec le champignon nécrotrophe B. cinerea a été réalisée. Plusieurs familles de transporteurs de sucres et d'invertases ont été ciblées, permettant d'établir une cartographie des gènes régulés transcriptionnellement lors de l'interaction. Le rôle de certains gènes candidats a été étudié par une approche de génomique fonctionnelle afin de mettre en évidence une fonction biologique de l'allocation du carbone dans la résistance de la plante aux champignons nécrotrophes. Un système d'interaction simplifié, basé sur un dialogue moléculaire sans contact physique entre une culture cellulaire d'A. thaliana et B. cinerea, a été développé. Il a permis de mesurer les flux de sucres ainsi que les activités enzymatiques et métaboliques pour chaque partenaire. Nos résultats montrent que B. cinerea entraine une forte augmentation de l'activité invertasique pariétale dans les tissus infectés, indiquant qu'une transition source/puits a lieu. Plusieurs transporteurs de sucres sont différentiellement exprimés, certains d'entre eux modulant le devenir de l'interaction. L'activité d'absorption d'hexoses et le métabolisme primaire des cellules hôtes sont fortement stimulés, démontrant l'importance de la compétition pour les sucres à l'interface plante/agent pathogène. En conclusion, l'absorption des sucres alimente le métabolisme énergétique des cellules hôtes et participe aux mécanismes de défense de la plante.

Effet de vers de terre sur les plantes

Author : Kam-Rigne Laossi
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Total Pages : 318 pages
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Book Synopsis Effet de vers de terre sur les plantes by : Kam-Rigne Laossi

Download or read book Effet de vers de terre sur les plantes written by Kam-Rigne Laossi and published by . This book was released on 2009 with total page 318 pages. Available in PDF, EPUB and Kindle. Book excerpt: Les vers de terre constituent une composante majeure de la faune du sol et il est désormais bien établi qu’ils affectent la croissance des plantes. Bien que les espèces de plantes répondent différemment aux vers de terre au cours d’un cycle de vie, très peu de travaux ont étudié l’effet des vers de terre sur la compétition entre plantes et sur leur démographie. Les vers de terre peuvent affecter la stratégie d’allocation des ressources des plantes et ainsi, influencer leur survie et leur fécondité. Ils pourraient donc affecter la démographie de différentes espèces de plantes et donc, au-delà d’une génération, la structure des communautés végétales. Nous avons étudié dans une série d’expériences l’effet d’un ver endogé (A. caliginosa) et d’un ver anécique (L. terrestris) et de leur interaction sur quatre plantes annuelles (T. dubium, V. persica, P. annua et C. glomeratum) du niveau individuel (réponse de chaque espèce végétale considérée individuellement) au niveau de la communauté végétale (réponse des plantes en situation de compétition au sein d’une communauté végétale). Nous avons ainsi montré que les vers de terre affectent la croissance des plantes et que cet effet varie en fonction de l’espèce végétale et du type de sol utilisé. De plus, ils modulent la compétition entre plantes sur le court et le long terme et leurs effets sur les plantes peuvent être transmis à la génération suivante, par un effet maternel. Enfin, ils modifient la démographie des plantes en influençant leur fécondité, leur survie et la germination des graines. Dans une expérience en mésocosmes qui a maintenu pendant trois générations des communautés des quatre plantes annuelles avec et sans vers, nous avons pu vérifier que les mécanismes démographiques mis en évidence dans les expériences à court terme modifient bien la structure de la communauté sur le long terme. Toutefois, il apparaît pour le moment impossible de prédire quelles espèces végétales vont bénéficier des vers de terre. Cela est probablement dû à l’action simultanée de nombreux mécanismes en interaction. Il reste à étudier ces interactions, et à construire un cadre conceptuel permettant de prédire quels groupes fonctionnels de plante vont bénéficier de l’action des vers de terre à court et long terme, c’est à dire en terme de biomasse et de nombre d’individus.

Arabidopsis Thaliana as a Model for Host Plant- Herbivore- Natural Enemy Interactions

Author : Jenny Elspeth Barker
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Book Synopsis Arabidopsis Thaliana as a Model for Host Plant- Herbivore- Natural Enemy Interactions by : Jenny Elspeth Barker

Download or read book Arabidopsis Thaliana as a Model for Host Plant- Herbivore- Natural Enemy Interactions written by Jenny Elspeth Barker and published by . This book was released on 2003 with total page pages. Available in PDF, EPUB and Kindle. Book excerpt:

Effects of Plant-plant Airborne Interactions on Performance of Neighboring Plants Using Wild Types and Genetically Modified Lines of Arabidopsis Thaliana

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Author : Claire Thelen
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Total Pages : 30 pages
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Book Synopsis Effects of Plant-plant Airborne Interactions on Performance of Neighboring Plants Using Wild Types and Genetically Modified Lines of Arabidopsis Thaliana by : Claire Thelen

Download or read book Effects of Plant-plant Airborne Interactions on Performance of Neighboring Plants Using Wild Types and Genetically Modified Lines of Arabidopsis Thaliana written by Claire Thelen and published by . This book was released on 2020 with total page 30 pages. Available in PDF, EPUB and Kindle. Book excerpt: Understanding plant-plant communication further elucidates how plants interact with their en-vironment, and how this communication can be manipulated for agricultural and ecological purposes. Part of understanding plant-plant communication is discovering the mechanisms behind plant-plant recognition, and whether plants can distinguish between genetically like and unlike neighbors. It has been previously shown that plants can "communicate" with neighboring plants through airborne volatile organic compounds (VOCs), which can act as signals related to different environmental stressors.This study focused on the interaction among different genotypes of the annual plant Arabidopsis thaliana. Specifically, a growth chamber experiment was performed to compare how different genotypes of neighboring plants impacted a focal plant's fitness-related phenotypes and developmental stages. The focal plant genotype was wild type Col-0, and the neighboring genotypes included the wild type Landsberg (Ler-0), and the genetically modified (GM) geno-types: Etr1-1 and Jar1-1. These GM lines have a single point-mutation that impacts their ability to produce a particular VOC. This allows for the evaluation of a particular role that a VOC may have on plant-plant airborne communication. Plants were grown in separate pots to eliminate potential belowground interactions through the roots, and distantly positioned to avoid aboveground physical contact between plants. In addition, to avoid potential VOC cross-contamination between different treatments (genotypes), each neighboring plant treatment oc-curred in separate, sealed growth chambers.Results showed that when A. thaliana Col-0 plants were grown alongside neighbors of different genotypes, they exhibited some significant differences in fitness-related traits, such as increased rosette width, stem height, aboveground biomass, and total fruit number. However, these results differed with neighbor identity, and when the experiment was repeated. Arabidopsis thaliana also experienced developmental delays in bolting and flowering time, when exposed to neighbors having a mutation in their ethylene receptors (Etr1-1), but not from any other genotypes.These results indicate that Arabidopsis thaliana is capable of differentiating neighbor identities through airborne VOCs. Since all mutations caused some significant changes to A. thaliana's growth, it is likely that A. thaliana is sensitive to multiple changes in VOC signatures. However, there was high variability between replications, and some phenotypes did not experience expected changes based on previous studies. Therefore, more studies should be performed to discover the effects of different VOCs on plant-plant communication via airborne volatiles.

Étude de l'implication des transporteurs de sucres dans l'interaction entre Arabidopsis thaliana et le champignon nécrotrophe Botrytis cinerea

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Author : Pauline Lemonnier
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Book Synopsis Étude de l'implication des transporteurs de sucres dans l'interaction entre Arabidopsis thaliana et le champignon nécrotrophe Botrytis cinerea by : Pauline Lemonnier

Download or read book Étude de l'implication des transporteurs de sucres dans l'interaction entre Arabidopsis thaliana et le champignon nécrotrophe Botrytis cinerea written by Pauline Lemonnier and published by . This book was released on 2014 with total page 0 pages. Available in PDF, EPUB and Kindle. Book excerpt: Au cours des interactions plante/agent pathogène, la disponibilité en sucres est un des enjeux majeurs pour les deux partenaires. Il s'établit donc une compétition vis-à-vis des ressources carbonées entre l'agent pathogène hétérotrophe pour le carbone et la plante consommant de l'énergie pour se défendre. Les transporteurs de sucres sont les acteurs moléculaires qui interviennent dans cette compétition et probablement dans le devenir de l'interaction. L'objectif de cette étude est de déterminer l'implication des transporteurs de sucres au cours de l'interaction entre la plante modèle Arabidopsis thaliana et le champignon nécrotrophe Botrytis cinerea.Parmi la famille des transporteurs d'hexoses (STPs) d'A. thaliana, l'expression du gène STP13 est régulée positivement durant l'infection par B. cinerea. Le rôle potentiel de STP13 au cours de cette interaction a donc été étudié à l'aide de plantes transgéniques (Knock-Out et surexpresseur). Le suivi du développement des symptômes et la mesure d'absorption du glucose ont permis de montrer des modifications phénotypiques entre les différents génotypes étudiés. Les résultats indiquent une corrélation entre le niveau d'expression de STP13, le transport de glucose et le développement du champignon, confortant ainsi le rôle de STP13 dans la tolérance face à B. cinerea.Les résultats préliminaires de l'étude du transport de glucose à l'échelle cellulaire montrent une inhibition dans des conditions mimant l'infection. Ces analyses ont été effectuées grâce à un modèle constitué d'une suspension cellulaire d'A. thaliana subissant un traitement éliciteur à partir d'un extrait protéique de B. cinerea.Nous nous sommes également intéressés au transport de saccharose à l'échelle de la plante infectée. Nos résultats suggèrent que l'inoculation par le champignon modifie les flux de saccharose classiquement observés créant ainsi une nouvelle force d'appel. Ainsi, la feuille infectée se comporte comme un nouveau puits. Ces travaux de recherche s'inscrivent dans la nécessité d'une meilleure compréhension des mécanismes de transport des sucres qui permettra à terme d'agir sur les capacités de résistance des plantes vis-à-vis d'agents pathogènes.

Etude moléculaire de l'interaction compatible plante-nématodes à galles

Author : Fabien Jammes
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ISBN 13 :
Total Pages : 284 pages
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Book Synopsis Etude moléculaire de l'interaction compatible plante-nématodes à galles by : Fabien Jammes

Download or read book Etude moléculaire de l'interaction compatible plante-nématodes à galles written by Fabien Jammes and published by . This book was released on 2005 with total page 284 pages. Available in PDF, EPUB and Kindle. Book excerpt: Lors d’une interaction compatible, les nématodes à galles phytoparasites du genre Meloidogyne ont élaboré des mécanismes originaux et complexes aboutissant à la formation de sites nourriciers permanents, indispensables à leur développement. Ces structures, appelées cellules géantes, sont hypertrophiées et polynucléées. Afin d’étudier les événements qui participent à la lmise en place des celules géantes chez Arabidopsis thaliana, deux approches, le piégeage de promoteurs et l’analyse différentielle à l’aide de puces à ADN, ont été utilisées. Le piégeage de promoteurs a permis d’identifier le gène NEC exprimé de façon très précoce dans la galle. Ce gène code pour une protéine mitochondriale de fonction inconnue, capable de lier d=le calcium et qui présente un domaine commun à des protéines de type nucléases Mg2+- dépendantes. L’analyse fonctionnelle détaillée de cette protéine a permis d’envisager son rôle dans la formation des sites nourriciers et au cours du développement de la place. En parallèle, une analyse différentielle des gènes régulés dans les galles a été réalisée à l’aide de puces CATMA. Nous avons ainsi pu fournir pour la première fois une vision globale du transcriptome d’Arabidopsis thaliana lors de la formation de la galle induite par Meloidogyne. Cette étude, qui a été conduite selon une cinétique d’infection, nous a permis d’une part, de mettre en évidence des éléments spécifiques de la réponse précoce ou tardive de la plante et d’autre part, d’identifier des processus biologiques majoritairement activés ou réprimés au sein de la galle.

Rôle de l’effecteur de type III DspA au cours de l’interaction entre arabidopsis thaliana et Erwinia amylovora

Author : Alexandre Degrave
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Total Pages : 168 pages
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Book Synopsis Rôle de l’effecteur de type III DspA au cours de l’interaction entre arabidopsis thaliana et Erwinia amylovora by : Alexandre Degrave

Download or read book Rôle de l’effecteur de type III DspA au cours de l’interaction entre arabidopsis thaliana et Erwinia amylovora written by Alexandre Degrave and published by . This book was released on 2009 with total page 168 pages. Available in PDF, EPUB and Kindle. Book excerpt: La bactérie phytopathogène Erwinia amylovora est l’agent responsable du feu bactérien des Maloideae. Son pouvoir pathogène dépend de l’effecteur de type III DspA, une protéine injectée dans la cellule hôte par le système de sécrétion de type III bactérien (SSTT) et qui provoque une nécrose Gaudriault et al., 1997). L’objectif de ce travail de thèse était de déterminer le rôle de DspA dans la cellule végétale. Pour cela, nous avons choisi d’utiliser la plante Arabidopsis thaliana comme modèle d’étude, puisque l’inoculation d’E. amylovora provoque chez A. thaliana une nécrose dépendante de DspA. La première partie de ma thèse a consisté à caractériser l’interaction entre A.thaliana et E.amylovora. Les résultats montrent qu’E.amylovora se multiplie légèrement dans les feuilles inoculées de manière dépendante du SSTT et de DspA. De plus, la mort cellulaire est associée à la mise en place de réactions de défense chez la plante dont certaines sont induites par DspA. Par une approche transcriptomique, nous avons ensuite confirmé que DspA participe fortement à l’activation des voies de défenses. Les résultats obtenus suggèrent par ailleurs que DspA interfère notamment avec la biosynthèse des ribosomes. Enfin, des plantes A.thaliana transgéniques exprimant dspA sous contrôle d’un promoteur inductible à l’oestradiol ont été construites. L’analyse de ces plantes montre qu’une faible expression de dspA inhibe la croissance de la plante alors qu’un fort niveau d ‘expression déclenche la mort cellulaire. L’analyse des plantes transgéniques montre que DspA est principalement localisée dans le nucléole et que son expression inhibe la machinerie traductionnelle de la cellule végétale.

Etude des interactions plantes-microbes et microbes-microbes au sein de la rhizosphère, sous un aspect coûts-bénéfices, dans un contexte de variation environnementale

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Author : Clémentine Lepinay
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Book Synopsis Etude des interactions plantes-microbes et microbes-microbes au sein de la rhizosphère, sous un aspect coûts-bénéfices, dans un contexte de variation environnementale by : Clémentine Lepinay

Download or read book Etude des interactions plantes-microbes et microbes-microbes au sein de la rhizosphère, sous un aspect coûts-bénéfices, dans un contexte de variation environnementale written by Clémentine Lepinay and published by . This book was released on 2013 with total page 257 pages. Available in PDF, EPUB and Kindle. Book excerpt: La compréhension des interactions qui associent les plantes et les microorganismes du sol est une étape incontournable pour une gestion durable de nos écosystèmes notamment en agriculture. Parmi les services écosystémiques résultant de leurs interactions, on peut citer la productivité végétale répondant, en partie, aux besoins alimentaires de la population mondiale et la régulation des cycles biogéochimiques. Les services écosystémiques, qui émergent de telles interactions, reposent sur des liens trophiques pouvant être représentés par un compromis entre coûts et bénéfices pour les différents partenaires de l’interaction. Les plantes, organismes autotrophes ou producteurs primaires, sont des organismes clefs qui font entrer le carbone dans l’écosystème, via la photosynthèse. Une partie de ce carbone est libérée sous forme de molécules plus ou moins complexes, au niveau de leurs racines, par le processus de rhizodéposition. Ces composés servent de molécules signal et de nutriments pour les microorganismes du sol, essentiellement hétérotrophes, c’est l’effet rhizosphère. Ce processus est donc coûteux pour la plante mais bénéfique aux microorganismes. Les microorganismes contribuent, en retour, à la nutrition et la santé des plantes ce qui est coûteux mais leur assure une source bénéfique de nutriments. Ces échanges trophiques reposent néanmoins sur un équilibre dépendant des conditions biotiques et abiotiques qui affectent chaque partenaire. La biodiversité microbienne, de par la multitude d’interactions au sein des communautés microbiennes, est un facteur biotique important. Parmi les facteurs abiotiques, le contexte environnemental actuel, soumis aux changements globaux, est propice à une déstabilisation de ces interactions. L'objectif de ce travail est donc de comprendre comment vont varier les coûts et bénéfices, pour chaque partenaire, suite à des modifications de l’environnement affectant l’un ou l’autre. L’intérêt étant de savoir si les bénéfices pour les plantes et les microorganismes, qui permettent les services écosystémiques, seront affectés. Pour répondre à cet objectif, un cadre d’interaction plantes-microbes simplifié a été choisi et une déstabilisation, au niveau de la plante, a été effectuée au moyen d’une augmentation en CO2 atmosphérique. L’interaction entre Medicago truncatula et Pseudomonas fluorescens a ainsi été étudiée. Les interactions ont ensuite été complexifiées en utilisant une communauté microbienne dans son ensemble et, cette fois, la modification a été appliquée au compartiment microbien soumis à une dilution de sa diversité. L’effet du gradient de diversité microbienne obtenu a été mesuré sur la croissance et la reproduction de trois espèces végétales modèles (Medicago truncatula, Brachypodium distachyon et Arabidopsis thaliana). Enfin, l’analyse s’est focalisée sur la communauté microbienne en identifiant la part active, c'est-à-dire les microorganismes qui utilisent les composés libérés par la plante. Ces microorganismes, qui interagissent réellement avec la plante, ont été détectés grâce à une analyse ADN SIP utilisant l’isotope 13C. Les principaux résultats observés, que la modification affecte l’un ou l’autre des partenaires, sont une déstabilisation des coûts et bénéfices. La première étude montre une variation temporaire des interactions en faveur de la plante en condition de CO2 augmenté. Dans le cas d’une dilution de la diversité microbienne, les coûts pour la plante sont conditionnés par la dépendance naturelle des plantes vis-à-vis des microorganismes symbiotiques qui interagissent avec le reste de la communauté. Cela est confirmé par la dernière expérimentation qui met en évidence les interactions microbes-microbes qui conditionnent la structure de la communauté microbienne interagissant avec la plante. [...]

Source-sink Interactions Shape Herbivore-induced Defense Responses in Arabidopsis Thaliana

Author : Abigail P. Ferrieri
Publisher :
ISBN 13 :
Total Pages : 262 pages
Book Rating : 4.:/5 (872 download)

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Book Synopsis Source-sink Interactions Shape Herbivore-induced Defense Responses in Arabidopsis Thaliana by : Abigail P. Ferrieri

Download or read book Source-sink Interactions Shape Herbivore-induced Defense Responses in Arabidopsis Thaliana written by Abigail P. Ferrieri and published by . This book was released on 2012 with total page 262 pages. Available in PDF, EPUB and Kindle. Book excerpt: Plant tissues are not attacked uniformly, nor are they uniformly responsive to insect herbivores, in part because they are modular organisms made up of source and sink tissues. This results in complex patterns of defense that may vary spatially and temporally. My dissertation evaluates the importance of source-sink interactions and sink competition in shaping plant defense responses in Arabidopsis thaliana to feeding by two chewing lepidopterans--Pieris rapae (dietary specialist) and Spodoptera exigua (dietary generalist)--and in response to simulated herbivory with the defense elicitor, methyl-jasmonate. I investigated whether the presence of competing sinks naturally occurring during plant development (e.g. reproductive sinks and roots) facilitates or constrains the induction of defense metabolites (glucosinolates and phenolics) by altering whole-plant distribution and metabolic utilization of carbon. The use of short-lived radio-isotopes 11C (t1/2=20.4 min)as 11CO2, and 18F (t1/2= 110 min) as 2-[18F]fluoro-2-deoxy-D-glucose, provides new insight into the roles that plant architecture and competition between sinks play in determining how newly acquired carbon resources are used by plants in their defense against insect herbivory.

Impact des métaux lourds sur les interactions plante/ ver de terre/ microflore tellurique

Author : Thi My Dung Huynh
Publisher :
ISBN 13 :
Total Pages : 0 pages
Book Rating : 4.:/5 (69 download)

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Book Synopsis Impact des métaux lourds sur les interactions plante/ ver de terre/ microflore tellurique by : Thi My Dung Huynh

Download or read book Impact des métaux lourds sur les interactions plante/ ver de terre/ microflore tellurique written by Thi My Dung Huynh and published by . This book was released on 2009 with total page 0 pages. Available in PDF, EPUB and Kindle. Book excerpt: L'objectif de ce travail était d'étudier les interactions entre une plante à phytoremédiatrice ?, Lantana camara (Verbenaceae), le ver de terre, Pontoscolex corethrurus (Glossoscolecidae) et les microorganismes telluriques d'un sol pollué au plomb. Dans un premier temps, il apparaît que dans les sols contaminés, la présence de ver conduit à un accroissement de la biomasse des parties aériennes et racinaires des plantes ainsi qu'à une augmentation de l'absorption de plomb. La caractérisation physico-chimique des agrégats racinaires a montré que l'activité des vers augmente le taux de matière organique, la capacité d'échange cationique ainsi que l'azote total, le potassium total et disponible. De plus, la présence des vers augmente certaines activités enzymatiques de la rhizosphère. La croissance accrue de L. camara pourrait résulter de ces différentes actions. L'action des vers de terre sur les plantes se ferait via les communautés microbiennes telluriques. Ainsi, la biomasse des microorganismes, bactéries et champignons, des agrégats racinaires augmente en présence de vers. La PCR-DGGE n'a pas permis de mettre en évidence de modifications de la structure taxonomique des communautés bactériennes sous l'influence du Pb et/ou du vers, par contre l'analyse des profils physiologiques par plaques Biolog montre clairement une diversification fonctionnelle bactérienne. Les communautés fongiques voient, elles, leur diversité taxonomique, augmenter sous l'action des vers. La restructuration des populations microbiennes, en présence de vers, des agrégats racinaires élaborés par les plantes en milieu pollué au plomb est l'élément déterminant pour la compréhension de l'impact de P. corethrurus sur la croissance et la phytoremédiation de L. camara. L'association de ces deux organismes aurait donc un potentiel considérable pour le traitement de sites industriels pollués au plomb.

Interactions entre "terra preta" et vers de terre

Author : Diana Noguera
Publisher :
ISBN 13 :
Total Pages : 164 pages
Book Rating : 4.:/5 (69 download)

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Book Synopsis Interactions entre "terra preta" et vers de terre by : Diana Noguera

Download or read book Interactions entre "terra preta" et vers de terre written by Diana Noguera and published by . This book was released on 2009 with total page 164 pages. Available in PDF, EPUB and Kindle. Book excerpt: La fertilité des sols tropicaux est souvent peu durable dans les systèmes de cultures et les pâturages. Ce problème de fertilité est en grande partie du à la très rapide décomposition de la matière organique dans ces sols et à leur faible capacité à retenir les nutriments minéraux. De plus, dans un contexte où une grande partie des agriculteurs ont peu accès aux intrants (engrais minéraux) il est important de trouver des méthodes de gestion durable et nécessitant peu d’intrants. Une solution pourrait être d’enrichir le sol en charbon de bois fragmenté pour créer des ‘‘terres noires’’ comme celles découvertes récemment en Amazonie et qui auraient été implantées il y a des siècles par des groupes amérindiens aujourd’hui disparus. Une autre solution pourrait être de promouvoir des systèmes agricoles favorables aux vers de terre dont les activités augmentent généralement la croissance des plantes. Les mécanismes impliqués commencent à être connus tant pour les vers que pour les terres noires mais les interactions entre vers et terres noires n’ont jamais été abordées. J’ai étudié dans une série d’expériences l’effet de vers de terre (P. corethrurus), du charbon bois et de leur interaction sur le croissance du riz: 1) réponse du riz dans différents types du sol (expérience en microcosmes), 2) réponse des 5 variétés du riz dans un type sol et dans deux niveaux de fertilisation minérale (expérience en microcosmes), 3) réponse physiologique et cellulaire du riz à la présence de vers de terre et de charbon bois et 4) effet des vers de terre sur la formation de ‘‘terres noires’’ et leur fertilité (expérience en mésocosmes). Nous avons ainsi montré que les vers de terre et le charbon bois affectent la croissance des plantes et que les effets vers de terre et charbon bois varient en fonction du type de sol utilisé et diminuent avec la fertilisation minérale. Les résultats de la deuxième expérience montrent que les différentes variétés de riz répondent différemment à la présence de charbon bois et de vers. Enfin, il y a peu d’interactions significatives à court terme (3 mois) entre l’effet des vers et celui du charbon de bois. L’expérience en mésocosmes a de même montré que les vers de terre ont un effet limité sur la formation des terres noires et interagissent peu avec le charbon de bois, sur le moyen terme (2 ans). Au niveau physiologique, dans le sol où les vers et le charbon de bois ont un effet positif sur la croissance du riz, le charbon de bois accélère à la fois le catabolisme (protéase) et l’anabolisme (synthèse de la rubisco) de l’azote. Les vers de terre ont un effet plus modéré, avec une légère tendance à une diminution du catabolisme de l’azote.

La maîtrise de l'information scientifique, clé de l' "après séquençage "

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Author : Alexandra Louis
Publisher :
ISBN 13 :
Total Pages : 330 pages
Book Rating : 4.:/5 (492 download)

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Book Synopsis La maîtrise de l'information scientifique, clé de l' "après séquençage " by : Alexandra Louis

Download or read book La maîtrise de l'information scientifique, clé de l' "après séquençage " written by Alexandra Louis and published by . This book was released on 2001 with total page 330 pages. Available in PDF, EPUB and Kindle. Book excerpt: La connaissance d'un génome complet donne pour la première fois l'opportunité d'étudier un gène dans le contexte génomique auquel il appartient. En particulier ceci permet d'effectuer une analyse fonctionnelle des gènes à travers l'étude des relations existantes, entre les gènes ou les produits des gènes, au sein de ce génome. Afin que l'analyse fonctionnelle d'un gène tire le meilleur parti de la compréhension de ces relations, il est indispensable d'organiser le savoir disponible sur le génome étudié de manière à ce que les gènes liés les uns aux autres puissent être facilement détectés. Nous avons travaillé à un projet visant à développer une base de donnée spécialisée dédiée al̀'analyse fonctionnelle du génome d'Arabidopsis thaliana. Le concept utilisé pour organiser les données au sein de la base repose sur la notion de voisinage. Pour chaque gène, une liste de gênes voisins basée sur différent type de relations est construite. Les gènes (ou produits des gênes) peuvent être liés les uns aux autres selon des critères variés incluant la proximité sur le chromosome, l'homologie de séquences, l'implication dans une même voie métabolique, l'usage du code ou encore la co-citation dans la littérature scientifique. Chaque voisinage permet de donner un éclairage spécifique sur le gène étudié et fournit des éléments pour la recherche de sa fonction. L'exploitation des données bibliographiques associées au génome d'A. thaliana et l'étude du voisinage par homologie de séquences protéiques constituent une part importante du projet. Dans un premier temps, nous nous sommes intéréssés à la relation qui découle de la co-citation entre deux gènes dans une référence bibliographique, et nous détaillons les problèmes liés au génome que nous avons étudié et la représentation des relations. Dans un deuxième temps, nous nous sommes focalisé sur l'étude des familles construites par homologie de séquence protéique, en utilisant une méthode de comparaison massive de séquences.

Impact de la nutrition azotée sur l'interaction entre Arabidopsis thaliana et la bactérie phytopathogène Erwinia amylovora

Author : Mahsa Farjad
Publisher :
ISBN 13 :
Total Pages : 0 pages
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Book Synopsis Impact de la nutrition azotée sur l'interaction entre Arabidopsis thaliana et la bactérie phytopathogène Erwinia amylovora by : Mahsa Farjad

Download or read book Impact de la nutrition azotée sur l'interaction entre Arabidopsis thaliana et la bactérie phytopathogène Erwinia amylovora written by Mahsa Farjad and published by . This book was released on 2017 with total page 0 pages. Available in PDF, EPUB and Kindle. Book excerpt: L'azote (N) est l'un des principaux nutriments nécessaires pour la croissance des plantes et le rendement de cultures. Il est bien documenté que les changements dans la disponibilité du nitrate, principale source d'azote dans les sols agricoles, influent largement sur le processus de développement de la plante, y compris sur ses réponses de défense. La première partie de ce travail correspond à une analyse transcriptomique réalisée afin d'étudier les changements transcriptionnels au cours de l'infection d'A. thaliana par E. amylovora, dans les plantes cultivées à deux régimes de nutrition azotée (limitant ou non). L'analyse des données montre que, globalement, la réponse transcriptomique à la bactérie chez les plantes cultivées en azote limitant ou non est proche malgré la différence de développement de ces plantes. Malgré ces réponses globalement proches, des différences d'expression en réponse à l'infection ont été observés pour certaines voies de signalisation, notamment pour la voie de l'acide jasmonique. L'analyse de l'interaction entre les deux stress (N et bactérie) montre qu'en réponse à la combinaison des deux stress, 32.5% de gènes ont une réponse spécifique de la combinaison des stress, suggérant une interaction entre les réponses aux stresses simples. Parmi ces gènes, plusieurs sont liés à la défense contre les agents pathogènes, comme les facteurs de transcription de type WRKYs et les protéines de résistance. Dans la deuxième partie de ce travail, nous avons démontré l'effet de la disponibilité en azote sur l'expression des facteurs du pouvoir pathogène d'E. amylovora in planta. En effet, la bactérie E. amylovora se multiplie mieux dans des plantes cultivées à faible azote (2 mM NO3−) qu'à fort azote (10 mM NO3−). De plus, nous n'avions observé qu'un mutant affecté dans le pouvoir pathogène d'E. amylovora est aussi agressif que la souche sauvage dans des plantes cultivées à fort azote (10 mM NO3−), alors qu'on observe une différence d'agressivité entre les deux souches dans des plantes cultivées à faible azote (2 mM NO3−). Les expériences menées indiquent que l'effecteur de type 3 DspA/E, principal facteur du pouvoir pathogène d'E. amylovora, est significativement plus exprimé in planta à faible azote (2 mM NO3−) qu'à fort azote (10 mM NO3−). De plus, le niveau d'expression de ce facteur de virulence d'E. amylovora in planta est inversement corrélé avec l'expression des gènes de la voie de l'acide jasmonique PDF1.2 et JAR1. On a également observé une diminution de niveau des précurseurs chloroplastiques de l'acide jasmonique dans les plantes sensibles à Ea cultivées à faible N.

Etude des acteurs et des interactions entre les voies de recombinaison chez Arabidopsis thaliana

Author : Heïdi Serra
Publisher :
ISBN 13 :
Total Pages : 0 pages
Book Rating : 4.:/5 (945 download)

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Book Synopsis Etude des acteurs et des interactions entre les voies de recombinaison chez Arabidopsis thaliana by : Heïdi Serra

Download or read book Etude des acteurs et des interactions entre les voies de recombinaison chez Arabidopsis thaliana written by Heïdi Serra and published by . This book was released on 2014 with total page 0 pages. Available in PDF, EPUB and Kindle. Book excerpt: La réparation des cassures double brin (CDB) de l'ADN par recombinaison est essentielle au maintien de l'intégrité du génome de tous les être vivants. Ce processus doit cependant être finement régulé puisque la recombinaison peut générer des mutations ou des réarrangements chromosomiques, parfois extrêmement délétères pour la cellule. Les CDB peuvent être réparées par deux mécanismes : la recombinaison non homologue (ou jonction des extrémités d'ADN) ou la recombinaison homologue (impliquant une homologie de séquence entre les molécules recombinantes). Dans les cellules somatiques, les deux voies principales de recombinaison homologue (RH) sont la voie Synthesis Dependent Strand Annealing (SDSA) dépendante de la recombinase RAD51 et la voie Single Strand Annealing (SSA) indépendante de RAD51. Nos résultats ont d'abord mis en évidence un rôle inattendu de XRCC2, RAD51B et RAD51D - trois paralogues de RAD51 - dans la voie SSA. Nous avons confirmé que la fonction de la protéine XRCC2 dans la voie SSA ne dépend pas de RAD51, ce qui démontre que certains paralogues de RAD51 ont acquis des fonctions indépendantes de la recombinase. La différence de sévérité des phénotypes des mutants individuels ainsi que les analyses d'épistasie menées sur le double et le triple mutant suggèrent des fonctions individuelles de ces protéines au cours du SSA. Nous proposons qu'elles facilitent l'étape d'hybridation des deux séquences complémentaires situées de part et d'autre de la cassure, bien que ceci reste à confirmer par des études in vitro. L'étude des fonctions de l'hétérodimère XPF-ERCC1 - un complexe impliqué dans le clivage des extrémités d'ADN non homologues au cours des voies de RH - a révélé un rôle inhibiteur de ce complexe sur la voie SDSA. Cette action est dépendante de son activité endonucléasique et serait liée au clivage des longues extrémités 3' sortantes réalisant l'invasion d'un duplex d'ADN homologue, l'étape initiale de la voie SDSA. Notre étude a de plus confirmé que le rôle du complexe dépend de la longueur des extrémités non homologues chez Arabidopsis, comme chez les mammifères et la levure. Bien que le complexe XPF-ERCC1 soit essentiel au clivage des longues extrémités d'ADN non homologue, il n'est pas requis à l'élimination des courtes extrémités au cours de la RH.