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Author : VINCENT.. DESALME
Publisher :
ISBN 13 :
Total Pages : pages
Book Rating : 4.:/5 (49 download)
Download or read book UTILISATION DES DERIVEES FRACTIONNAIRES POUR LA MODELISATION DES PROCEDES BIOLOGIQUES written by VINCENT.. DESALME and published by . This book was released on 1999 with total page pages. Available in PDF, EPUB and Kindle. Book excerpt:
Author : Cédric Lhoussaine
Publisher : ISTE Group
ISBN 13 : 1789480299
Total Pages : 416 pages
Book Rating : 4.7/5 (894 download)
Download or read book Approches symboliques de la modélisation et de l’analyse des systèmes biologiques written by Cédric Lhoussaine and published by ISTE Group. This book was released on 2022-07-01 with total page 416 pages. Available in PDF, EPUB and Kindle. Book excerpt: La biologie des systèmes, ou biologie systémique, est une approche de la biologie qui consiste à englober la complexité des interactions entre les entités biologiques dans un tout systémique. Le but étant de comprendre l’émergence de propriétés physiologiques ou fonctionnelles. Approches symboliques de la modélisation et de l’analyse des systèmes biologiques présente les apports de méthodes formelles issues de l’informatique pour la modélisation de la dynamique des systèmes biologiques. Il traite plus spécifiquement des méthodes symboliques, c’est-à-dire qui peuvent établir des propriétés qualitatives des modèles. Cet ouvrage expose différentes approches liées à la sémantique, au langage, à la modélisation et à leur lien avec les données, et nous permet d’examiner des problèmes fondamentaux et des défis auxquels nous confronte la biologie des systèmes. Une première partie regroupe des travaux qui s’appuient sur les diverses données accessibles pour construire des modèles alors que la seconde présente des contributions autour des questions de la sémantique et des méthodes formelles.
Author : Min Zhang
Publisher :
ISBN 13 :
Total Pages : 0 pages
Book Rating : 4.:/5 (78 download)
Download or read book Modélisation et analyse de processus biologiques dans des algèbres de processus written by Min Zhang and published by . This book was released on 2007 with total page 0 pages. Available in PDF, EPUB and Kindle. Book excerpt: Dans cette thèse, trois calculs de processus sont étudiés et appliqués à l'analyse de processus biologiques : une variante du π -calcul introduite ici, le I π -calcul: le k-calcul de Danos et Laneve et sa variante à grain plus fin, le mk-calcul: et les systèmes réactifs biqraphiques de Milner. Le manuscrit comporte trois parties. Dans la première partie, nous modélisons la transduction du signal, et plus spécifiquement le processus d'activation de la protéine "ras". On introduit une nouvelle extension du π -calcul. le I π -calcul, pour modéliser ce processus biologique en présence d'aberrance. Le calcul est obtenu en ajoutant deux actions aberrantes au Iπ -calcul. Le Iπ -calcul quoique déjà assez expressif pour exprimer l'aberrance. peut être encore précisé par l'introduction d'informations supplémentaires dans la syntaxe, soit sous forme de "taqs" soit sous forme de types. Les tags sont plus intuitifs, mais ils introduisent de la redondance, qui est éliminée dans la présentation de cette information sous forme de types. Nous montrons l'équivalence entre les deux espèces de décoration. Le système de types / tags présenté ici est très rudimentaire. mais notre espoir est de l'enrichir pour intégrer des paramètres quantitatifs tels que la température, la concentration, etc... dans la modélisation des processus biologiques. Dans la seconde partie, nous abordons d'un point de vue formel la question de l'auto-assemblage dans le kappa-calcul, un langage de description d'interactions protéine-protéine Nous définissons un sous-ensemble de règles de calcul réversibles nous permettant d'assurer un codage sans blocage du calcul "à gros grain" (le K-calcul) dans un calcul "à grain fin" (le mk-calcul). Nous prouvons la correction de cette simulation de manière interne (à l'aide des règles réversibles), améliorant ainsi les résultats de Danos et Laneve. Enfin, dans une partie plus prospective, nous suggérons comment l'on peut utiliser les bigraphes pour modéliser et analyser les processus biologiques. Nous montrons d'abord commment coder l'exemple "ras" dans ce formalisme. Puis nous indiquons sur un exemple comment l'on peut traduire le K-calcul dans les bigraphes.
Author :
Publisher : Lulu.com
ISBN 13 : 1430318678
Total Pages : 385 pages
Book Rating : 4.4/5 (33 download)
Download or read book African Doctorates in Mathematics written by and published by Lulu.com. This book was released on 2007 with total page 385 pages. Available in PDF, EPUB and Kindle. Book excerpt: This volume presents a catalogue of over 2000 doctoral theses by Africans in all fields of mathematics, including applied mathematics, mathematics education and history of mathematics. The introduction contains information about distribution by country, institutions, period, and by gender, about mathematical density, and mobility of mathematicians. Several appendices are included (female doctorate holders, doctorates in mathematics education, doctorates awarded by African universities to non-Africans, doctoral theses by non-Africans about mathematics in Africa, activities of African mathematicians at the service of their communities). Paulus Gerdes compiled the information in his capacity of Chairman of the African Mathematical Union Commission for the History of Mathematics in Africa (AMUCHMA). The book contains a preface by Mohamed Hassan, President of the African Academy of Sciences (AAS) and Executive Director of the Academy of Sciences for the Developing World (TWAS). (383 pp.)
Author : Gilles Didier
Publisher : ISTE Group
ISBN 13 : 1789480698
Total Pages : 330 pages
Book Rating : 4.7/5 (894 download)
Download or read book Modèles et méthodes pour l’évolution biologique written by Gilles Didier and published by ISTE Group. This book was released on 2022-07-01 with total page 330 pages. Available in PDF, EPUB and Kindle. Book excerpt: À l’origine de la diversité du vivant, l’évolution biologique est le phénomène par lequel les espèces naissent, se transforment ou disparaissent au cours du temps. Son étude fait intervenir des méthodes d’analyse sophistiquées qui reposent à la fois sur la modélisation mathématique des processus biologiques qui interviennent et sur la conception d’algorithmes efficaces pour ajuster ces modèles aux données génétiques et morphologiques. Modèles et méthodes pour l’évolution biologique expose les principales méthodes utilisées pour étudier l’évolution et offre un large panorama illustrant la variété des approches formelles mises en oeuvre notamment dans l’optimisation combinatoire, les modèles stochastiques, l’inférence statistique, l’échantillonnage par Monte-Carlo. Certaines des applications marquantes de ces méthodes y sont détaillées. Elles concernent, par exemple, l’étude d’événements migratoires des anciennes populations humaines ou la progression des épidémies.
Author : Jamil Ahmad
Publisher :
ISBN 13 :
Total Pages : 260 pages
Book Rating : 4.:/5 (69 download)
Download or read book Modélisation hybride et analyse des dynamiques des réseaux de régulations biologiques en tenant compte des délais written by Jamil Ahmad and published by . This book was released on 2009 with total page 260 pages. Available in PDF, EPUB and Kindle. Book excerpt: Les réseaux de régulation biologiques (RRB) représentent les interactions entre des entités biologiques. Par exemple, les réseaux de régulation génétiques sont des graphes dont les sommets représentent les gènes ou les produits (ARN ou protéines) et les arcs représentent leurs interactions. Cette thèse propose le formalisme d'automates hybride linéaire (AHL) pour l'analyse automatique des dynamiques des RRB. Le formalisme qualitatif de René Thomas est une approche bien connue pour la modélisation discrète et l'analyse des dynamiques des RRB. Il détermine le comportement qualitatif des RRB d'une manière rigoureuse. A partir d'un modèle discret, il n'est pas réellement possible (à cause de l'abstraction complète du temps) de déterminer des trajectoires particulières et en particulier des trajectoires cycliques ou non-cycliques. En nous basant sur le formalisme discret de René Thomas, nous introduisons la modélisation hybride des RRB par le formalisme des automates hybrides linéaires (AHL) qui prennent en compte les délais de production et de dégradation des produits de gènes. La modélisation hybride capture les deux types de comportement c'est-à-dire l'évolution discrète de niveau d'expression ainsi que l'aspect temporel (avec le temps) d'évolution continue des produits de gènes. Cette modélisation nous permet de faire l'analyse des AHL par l'outil de model-checking comme Hy-Tech pour l'accessibilité, les comportements cycliques comme le noyau d'invariance, les états stables et les chemins entre deux états donnés. Ces comportements abordent les aspects qui sont intéressants pour les biologistes. Par exemple, les cycles représentent l'homéostasie tandis que les états stables représentent la multi-stationnarité. Tous les comportements que nous analysons sont caractérisés par des contraintes de délais. Ces contraintes sont des conditions pour l'existence de ces différents comportements. Nous présentons les méthodes pour les calculs de la longueur, du volume et du diamètre du noyau d'invariance. Ces différentes mesures nous permettent d'introduire une notion de stabilité du noyau d'invariance. L'approche de modélisation hybride est appliquée sur plusieurs exemples réels des RRB. Ces exemples sont le RRB de la bactérie Pseudomonas aeruginosa, le RRB du cycle circadien du mammifère, le RRB du virus phage lambda, le système d'activation et de latence de la cellule-T et le réseau pour la réponse de la carence en carbone chez Escherichia coli.
Author : Wei Niu
Publisher :
ISBN 13 :
Total Pages : 188 pages
Book Rating : 4.:/5 (8 download)
Download or read book Qualitative Analysis of Biological Systems Using Algebraic Methods written by Wei Niu and published by . This book was released on 2011 with total page 188 pages. Available in PDF, EPUB and Kindle. Book excerpt: Cette thèse est consacrée à l'analyse qualitative des systèmes biologiques, modélisés comme des systèmes d'équations différentielles ou d'équations aux différences, en utilisant des méthodes algébriques. Nous avons étudié les problèmes de la détection d'états d'équilibre, de l'analyse de stabilité et de différents types de bifurcations, et de la construction de cycles limites pour des modèles biologiques continus et discrets. Nous montrons comment réduire les problèmes de l'analyse qualitative aux problèmes de résolution de systèmes polynomiaux ou semi-algébriques. Ensuite, nous expliquons comment ces problèmes formulés peuvent être résolus en utilisant une approche algébrique basée sur les méthodes d'ensembles triangulaires, des bases de Gröbner, d'élimination des quantificateurs, et de l'isolement et la classification des solutions réelles. De nombreuses expériences ont été réalisées sur les modèles biologiques différents et certains d'entre eux ont été présentés dans cette thèse, en démontrant l'efficacité des méthodes algébriques pour l'analyse qualitative de ces modèles. Les statistiques de temps en forme de tableau ont également été fournies pour comparer les performances des différentes méthodes algébriques. Nous avons développé un progiciel Maple pour l'analyse qualitative des modèles biologiques. Pour le système d'auto-assemblage de micelle avec puits chimiques, un modèle biochimique plane non linéaire, sa stabilité, trois types de bifurcations, et cycles limites ont été analysés en détail. Les conditions algébriques exactes sur les paramètres de ce système sont dérivées pour décrire les types de bifurcations et la stabilité et les types des points de bifurcation.
Author : Maxime Folschette
Publisher :
ISBN 13 :
Total Pages : 141 pages
Book Rating : 4.:/5 (128 download)
Download or read book Modélisation algébrique de la dynamique multi-échelles des réseaux de régulation biologique written by Maxime Folschette and published by . This book was released on 2014 with total page 141 pages. Available in PDF, EPUB and Kindle. Book excerpt:
Author : Julie Aubert
Publisher :
ISBN 13 :
Total Pages : 0 pages
Book Rating : 4.:/5 (994 download)
Download or read book Analyse statistique de données biologiques à haut débit written by Julie Aubert and published by . This book was released on 2017 with total page 0 pages. Available in PDF, EPUB and Kindle. Book excerpt: Les progrès technologiques des vingt dernières années ont permis l'avènement d'une biologie à haut-débit reposant sur l'obtention de données à grande échelle de façon automatique. Les statisticiens ont un rôle important à jouer dans la modélisation et l'analyse de ces données nombreuses, bruitées, parfois hétérogènes et recueillies à différentes échelles. Ce rôle peut être de plusieurs natures. Le statisticien peut proposer de nouveaux concepts ou méthodes inspirées par les questions posées par cette biologie. Il peut proposer une modélisation fine des phénomènes observés à l'aide de ces technologies. Et lorsque des méthodes existent et nécessitent seulement une adaptation, le rôle du statisticien peut être celui d'un expert, qui connaît les méthodes, leurs limites et avantages. Le travail présenté dans cette thèse se situe à l'interface entre mathématiques appliquées et biologie, et relève plutôt des deuxième et troisième type de rôles mentionnés.Dans une première partie, j'introduis différentes méthodes développées pour l'analyse de données biologiques à haut débit, basées sur des modèles à variables latentes. Ces modèles permettent d'expliquer un phénomène observé à l'aide de variables cachées. Le modèle à variables latentes le plus simple est le modèle de mélange. Les deux premières méthodes présentées en sont des exemples: la première dans un contexte de tests multiples et la deuxième dans le cadre de la définition d'un seuil d'hybridation pour des données issues de puces à ADN. Je présente également un modèle de chaînes de Markov cachées couplées pour la détection de variations du nombre de copies en génomique prenant en compte de la dépendance entre les individus, due par exemple à une proximité génétique. Pour ce modèle, nous proposons une inférence approchée fondée sur une approximation variationnelle, l'inférence exacte ne pouvant pas être envisagée dès lors que le nombre d'individus augmente. Nous définissons également un modèle à blocs latents modélisant une structure sous-jacente par bloc de lignes et colonnes adaptées à des données de comptage issue de l'écologie microbienne. Les données issues de méta-codebarres ou de métagénomique correspondent à l'abondance de chaque unité d'intérêt (par exemple micro-organisme) d'une communauté microbienne au sein d'environnement (rhizosphère de plante, tube digestif humain, océan par exemple). Ces données ont la particularité de présenter une dispersion plus forte qu'attendue sous les modèles les plus classiques (on parle de sur-dispersion). La classification croisée est une façon d'étudier les interactions entre la structure des communautés microbiennes et les échantillons biologiques dont elles sont issues. Nous avons proposé de modéliser ce phénomène à l'aide d'une distribution Poisson-Gamma et développé une autre approximation variationnelle pour ce modèle particulier ainsi qu'un critère de sélection de modèle. La flexibilité et la performance du modèle sont illustrées sur trois jeux de données réelles.Une deuxième partie est consacrée à des travaux dédiés à l'analyse de données de transcriptomique issues des technologies de puce à ADN et de séquençage de l'ARN. La première section concerne la normalisation des données (détection et correction de biais techniques) et présente deux nouvelles méthodes que j'ai proposées avec mes co-auteurs et une comparaison de méthodes à laquelle j'ai contribuée. La deuxième section dédiée à la planification expérimentale présente une méthode pour analyser les dispositifs dit en dye-switch.Dans une dernière partie, je montre à travers deux exemples de collaboration, issues respectivement d'une analyse de gènes différentiellement exprimés à partir de données issues de puces à ADN, et d'une analyse du traductome chez l'oursin à partir de données de séquençage de l'ARN, la façon dont les compétences statistiques sont mobilisées et la plus-value apportée par les statistiques aux projets de génomique.
Author : Paul Delmar
Publisher :
ISBN 13 :
Total Pages : 165 pages
Book Rating : 4.:/5 (492 download)
Download or read book Modèle de mélange sur la variance pour l'analyse différentielle des biopuces written by Paul Delmar and published by . This book was released on 2005 with total page 165 pages. Available in PDF, EPUB and Kindle. Book excerpt: L'industrialisation de la production de données en biologie moléculaire a fait naître des besoins spécifiques en termes de méthodes statistique. Nous avons mis au point une nouvelle approche, baptisée VarMixt, pour résoudre les questions d'estimation de la variance et d'analyse différentielle des données de biopuces. Cette méthode est construite en modélisant la distribution des estimateurs de la variance par un modèle de mélange. Nous traitons des aspects d'estimation des paramètres et de sélection de modèle. Une étude empirique par simulation fournit des résultats concernant la robustesse et les performances de notre méthode, alors qu'une variété d'applications illustre sa pertinence dans des cas concrets. Une ouverture est aussi proposée vers des modèles mixtes, couplés à des modèles de mélanges, pour rendre compte de structures de corrélations plus complexes parfois présentes dans les données (variabilité technique/ variabilité biologique).
Author : Stefano Casagranda
Publisher :
ISBN 13 :
Total Pages : 0 pages
Book Rating : 4.:/5 (1 download)
Download or read book Modélisation, Analyse Et Réduction Des Systèmes Biologiques written by Stefano Casagranda and published by . This book was released on 2017 with total page 0 pages. Available in PDF, EPUB and Kindle. Book excerpt: This thesis deals with modeling, analysis and reduction of various biological models, with a focus on gene regulatory networks in the bacterium E. coli. Different mathematical approaches are used. In the first part of the thesis, we model, analyze and reduce, using classical tools, a high-dimensional transcription-translation model of RNA polymerase in E. coli. In the second part, we introduce a novel method called Principal Process Analysis (PPA) that allows the analysis of high-dimensional models, by decomposing them into biologically meaningful processes, whose activity or inactivity is evaluated during the time evolution of the system. Exclusion of processes that are always inactive, and inactive in one or several time windows, allows to reduce the complex dynamics of the model to its core mechanisms. The method is applied to models of circadian clock, endocrine toxicology and signaling pathway; its robustness with respect to variations of the initial conditions and parameter values is also tested. In the third part, we present an ODE model of the gene expression machinery of E. coli cells, whose growth is controlled by an external inducer acting on the synthesis of RNA polymerase. We describe our contribution to the design of the model and analyze with PPA the core mechanisms of the regulatory network. In the last part, we specifically model the response of RNA polymerase to the addition of external inducer and estimate model parameters from single-cell data. We discuss the importance of considering cell-to-cell variability for modeling this process: we show that the mean of single-cell fits represents the observed average data better than an average-cell fit.
Author : Jonathan Fromentin
Publisher : Omniscriptum
ISBN 13 : 9786131513312
Total Pages : 116 pages
Book Rating : 4.5/5 (133 download)
Download or read book Modélisation Et Analyse Des Réseaux de Régulation Biologiques written by Jonathan Fromentin and published by Omniscriptum. This book was released on 2010-06 with total page 116 pages. Available in PDF, EPUB and Kindle. Book excerpt: Les r seaux de r gulation biologiques sont des syst mes complexes dans lesquels les entit s biologiques interagissent entre elles, faisant ainsi merger des comportements particuliers. Dans mon activit de recherche, j'ai propos une m thodologie g n rale afin de mieux comprendre les m canismes en jeu dans ces r seaux de r gulation et tout particuli rement dans ceux ayant un comportement oscillatoire. De fa on g n rale, les diff rentes parties de cette m thodologie ont pour but, soit d'analyser des syst mes biologiques de plus en plus grands, soit de raffiner les analyses sur des mod les moins cons quents. Ces travaux utilisent les propri t s temporelles des mod les biologiques qui sont souvent abondantes mais encore relativement peu exploit es. Pour parvenir int grer les donn es temporelles, j'ai d velopp des mod lisations hybrides qui combinent dans leurs comportements des aspects purement qualitatifs ainsi que des aspects quantitatifs.
Author : Grégory Nuel
Publisher :
ISBN 13 : 9782746214910
Total Pages : 361 pages
Book Rating : 4.2/5 (149 download)
Download or read book Analyse statistique des séquences biologiques written by Grégory Nuel and published by . This book was released on 2007 with total page 361 pages. Available in PDF, EPUB and Kindle. Book excerpt:
Author : CHRISTIAN.. ACHARD
Publisher :
ISBN 13 :
Total Pages : pages
Book Rating : 4.:/5 (49 download)
Download or read book MODELISATION DES PROPRIETES D'EQUILIBRE DE MILIEUX BIOLOGIQUES ET ALIMENTAIRES A L'AIDE DE MODELES PREDICTIFS. CONTRIBUTION A LA MISE EN PLACE D'UN LOGICIEL DE SIMULATION DES PROCEDES BIOTECHNOLOGIQUES written by CHRISTIAN.. ACHARD and published by . This book was released on 1992 with total page pages. Available in PDF, EPUB and Kindle. Book excerpt: LA MODELISATION DES PROPRIETES THERMODYNAMIQUES DES MILIEUX BIOLOGIQUES OU ALIMENTAIRES A ETE REALISEE AVEC UN NOUVEAU MODELE COMPOSE D'UN TERME DE CONTRIBUTION DE GROUPES DE TYPE UNIFAC, DE L'EQUATION DE PITZER, ET D'EQUATIONS DE SOLVATATION FAISANT APPEL A UN NOMBRE D'HYDRATATION POUR CHAQUE ION. LES PARAMETRES D'INTERACTION BINAIRE ENTRE LES IONS ET L'EAU OU LES GROUPES FONCTIONNELS DES MOLECULES ORGANIQUES ONT ETE AJUSTES A DES DONNEES EXPERIMENTALES OBTENUES DANS LA LITTERATURE. CE MODELE PERMET DE PREDIRE DE NOMBREUSES PROPRIETES COMME L'ACTIVITE DE L'EAU, LES TEMPERATURES D'EBULLITION ET DE CONGELATION, LES PROPRIETES OSMOTIQUES DE SOLUTIONS AQUEUSES CONTENANT DES SUCRES, DES POLYOLS JUSQU'A 80% MASSIQUE OU DES ELECTROLYTES FORTS JUSQU'A 6 MOLES/KG DE SOLVANT. LES EFFETS DES ELECTROLYTES SUR LES PROPRIETES D'EQUILIBRE LIQUIDE-VAPEUR DES SOLUTIONS EAU-ALCOOL SONT EGALEMENT REPRESENTES AVEC UNE BONNE PRECISION. L'APPLICATION DE CE MODELE A DES SOLUTIONS CONTENANT DES ELECTROLYTES FAIBLES A ETE REALISEE EN DEVELOPPANT UNE NOUVELLE METHODOLOGIE. ELLE PERMET DE DETERMINER AUTOMATIQUEMENT LE NOMBRE ET LA NATURE DES ESPECES, LEURS CONCENTRATIONS, LEURS ACTIVITES ET LE PH DES SOLUTIONS. CETTE METHODOLOGIE A ETE APPLIQUEE A DES MILIEUX LIQUIDES DE FERMENTATION ET ALIMENTAIRES ET DONNE DE BONNES ESTIMATIONS DU PH AVEC DES ECARTS ABSOLUS TOUJOURS INFERIEURS A 0,05 UNITE DE PH. LA SUBSTITUTION DE LA METHODE UNIFAC PAR LE MODELE UNIQUAC DONNE DES RESULTATS PLUS PRECIS MAIS L'ASPECT PREDICTIF DE LA METHODE N'EST PAS CONSERVE. C'EST POURQUOI UNE PROCEDURE A ETE MISE AU POINT POUR DETERMINER AUTOMATIQUEMENT LES PARAMETRES D'INTERACTION D'UNIQUAC A PARTIR DE L'INFORMATION FOURNIE PAR UNIFAC. L'ENSEMBLE DE CES TRAVAUX EST MAINTENANT PRET A ETRE INCORPORE DANS LE LOGICIEL DE SIMULATION DE PROCEDES PROSIM
Author : Michel Laurent
Publisher : Ellipses Marketing
ISBN 13 : 9782729880460
Total Pages : 358 pages
Book Rating : 4.8/5 (84 download)
Download or read book Systèmes biologiques à dynamique non-linéaire written by Michel Laurent and published by Ellipses Marketing. This book was released on 2013-06-18 with total page 358 pages. Available in PDF, EPUB and Kindle. Book excerpt: A travers différents exemples allant du niveau moléculaire à celui des écosystèmes, cet ouvrage présente les outils permettant d'étudier et de modéliser les propriétés dynamiques des systèmes biologiques soumis à des régulations non linéaires. Les mécanismes générateurs d'états stationnaires multiples associés aux phénomènes de seuil et à la propriété d'hystérèse, ainsi que ceux à l'origine des phénomènes rythmiques et oscillatoires, sont explicités, formalisés, analysés, simulés et finalement interprétés. L'apprentissage des méthodes permettant le développement de ces études n'est pas négligé : les algorithmes sont brièvement décrits et leur mise en oeuvre informatique (en langage R) est proposée. Des exercices d'application (et leur corrigé) complètent chaque chapitre. Cet ouvrage correspond à un enseignement donné en Master de bioinformatique et biostatistiques à un public qui a, en majorité, suivi un cursus de licence de biologie. Si son niveau général est celui d'un Master, quelques éléments choisis sont néanmoins enseignés dès la deuxième année de licence de biologie. A l'opposé, les étudiants de Grandes Ecoles ayant choisi la filière Biologie trouveront ici matière à nourrir leur réflexion et éventuellement leurs propres travaux. En séparant dans des chapitres distincts les méthodes d'étude de leur application à la biologie, cet ouvrage offre plusieurs niveaux de lecture et peut intéresser un large public d'étudiants et de chercheurs non biologistes (chimistes, physiciens, économistes, etc.) intéressés par l'application des modèles dynamiques à leur propre domaine d'activité.
Author : Anne Devys
Publisher :
ISBN 13 :
Total Pages : 226 pages
Book Rating : 4.:/5 (758 download)
Download or read book Modélisation, analyse mathématique et simulation numérique de problèmes issus de la biologie written by Anne Devys and published by . This book was released on 2010 with total page 226 pages. Available in PDF, EPUB and Kindle. Book excerpt: Cette thèse est consacrée à l’étude de quatre problèmes issus de la biologie. Le premier concerne la modélisation d’une population de métastases. Le modèle abouti a une équation de McKendrick-Von Foerster : une équation de conservation munie d’un terme au bord non–local. Nous montrons l’existence d’une unique solution et étudions son comportement asymptotique à l’aide de la notion d’entropie relative généralisée. L’étude numérique utilise le schéma WENO. Le deuxième concerne la modélisation de la respiration. Nous étudions la simulation des flux d’air dans l’appareil respiratoire à l’aide d’un modèle multi–échelle. Le système obtenu possède des conditions aux bords dissipatives non–usuelles. La méthode numérique employée est une méthode de décomposition qui permet de réduire le problème à la résolution de problèmes de Stokes avec conditions aux bords de type Dirichlet–Neumann classiques. Puis nous proposons un modèle pour les échanges gazeux montrant l’hétérogénéité de l’absorption de l’oxygène le long de l’arbre bronchique. La troisième partie concerne la cascade MAPK dans des ovocytes de Xénopes. La modélisation amène à une équation de type KPP. Après une étude mathématique montrant l’existence d’un front d’onde, nous réalisons une étude numérique fine du système. Enfin, nous étudions le système de Patlak–Keller–Segel 1D après explosion. Après une étude mathématique permettant de décrire le système après explosion à l’aide d’une mesure de défaut, nous donnons un schéma numérique adoptant le point de vue du transport optimal et permettant de simuler le système après explosion.
Author : LALAUZE René
Publisher : Lavoisier
ISBN 13 : 274628832X
Total Pages : 386 pages
Book Rating : 4.7/5 (462 download)
Download or read book Capteurs chimiques, biocapteurs et biopuces written by LALAUZE René and published by Lavoisier. This book was released on 2012-09-05 with total page 386 pages. Available in PDF, EPUB and Kindle. Book excerpt: Capteurs chimiques, biocapteurs et biopuces constitue un état de l'art en matière de détection d'espèces gazeuses, ioniques et biologiques. Il présente les aspects fondamentaux et technologiques des différents types de capteurs. Les matériaux sensibles aux différentes espèces chimiques et biologiques y sont exposés en termes d'élaboration et de performance. Les transducteurs mécaniques, électriques, électrochimiques, piézoélectriques, optiques et biologiques, sont décrits sous l'angle de leur fabrication et de leur mise au point pour des applications spécifiques. Les microréacteurs, les nanotechnologies et les technologies souples font également l'objet d'une étude approfondie. Enfin, le problème du traitement de l'information à travers les réseaux neuronaux ou les nez électroniques est traité.
