Impact De La Nutrition Azotee Sur Linteraction Entre Arabidopsis Thaliana Et La Bacterie Phytopathogene Erwinia Amylovora

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Impact de la nutrition azotée sur l'interaction entre Arabidopsis thaliana et la bactérie phytopathogène Erwinia amylovora

Author : Mahsa Farjad
Publisher :
ISBN 13 :
Total Pages : 0 pages
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Book Synopsis Impact de la nutrition azotée sur l'interaction entre Arabidopsis thaliana et la bactérie phytopathogène Erwinia amylovora by : Mahsa Farjad

Download or read book Impact de la nutrition azotée sur l'interaction entre Arabidopsis thaliana et la bactérie phytopathogène Erwinia amylovora written by Mahsa Farjad and published by . This book was released on 2017 with total page 0 pages. Available in PDF, EPUB and Kindle. Book excerpt: L'azote (N) est l'un des principaux nutriments nécessaires pour la croissance des plantes et le rendement de cultures. Il est bien documenté que les changements dans la disponibilité du nitrate, principale source d'azote dans les sols agricoles, influent largement sur le processus de développement de la plante, y compris sur ses réponses de défense. La première partie de ce travail correspond à une analyse transcriptomique réalisée afin d'étudier les changements transcriptionnels au cours de l'infection d'A. thaliana par E. amylovora, dans les plantes cultivées à deux régimes de nutrition azotée (limitant ou non). L'analyse des données montre que, globalement, la réponse transcriptomique à la bactérie chez les plantes cultivées en azote limitant ou non est proche malgré la différence de développement de ces plantes. Malgré ces réponses globalement proches, des différences d'expression en réponse à l'infection ont été observés pour certaines voies de signalisation, notamment pour la voie de l'acide jasmonique. L'analyse de l'interaction entre les deux stress (N et bactérie) montre qu'en réponse à la combinaison des deux stress, 32.5% de gènes ont une réponse spécifique de la combinaison des stress, suggérant une interaction entre les réponses aux stresses simples. Parmi ces gènes, plusieurs sont liés à la défense contre les agents pathogènes, comme les facteurs de transcription de type WRKYs et les protéines de résistance. Dans la deuxième partie de ce travail, nous avons démontré l'effet de la disponibilité en azote sur l'expression des facteurs du pouvoir pathogène d'E. amylovora in planta. En effet, la bactérie E. amylovora se multiplie mieux dans des plantes cultivées à faible azote (2 mM NO3−) qu'à fort azote (10 mM NO3−). De plus, nous n'avions observé qu'un mutant affecté dans le pouvoir pathogène d'E. amylovora est aussi agressif que la souche sauvage dans des plantes cultivées à fort azote (10 mM NO3−), alors qu'on observe une différence d'agressivité entre les deux souches dans des plantes cultivées à faible azote (2 mM NO3−). Les expériences menées indiquent que l'effecteur de type 3 DspA/E, principal facteur du pouvoir pathogène d'E. amylovora, est significativement plus exprimé in planta à faible azote (2 mM NO3−) qu'à fort azote (10 mM NO3−). De plus, le niveau d'expression de ce facteur de virulence d'E. amylovora in planta est inversement corrélé avec l'expression des gènes de la voie de l'acide jasmonique PDF1.2 et JAR1. On a également observé une diminution de niveau des précurseurs chloroplastiques de l'acide jasmonique dans les plantes sensibles à Ea cultivées à faible N.

Rôle de l’effecteur de type III DspA au cours de l’interaction entre arabidopsis thaliana et Erwinia amylovora

Author : Alexandre Degrave
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ISBN 13 :
Total Pages : 168 pages
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Book Synopsis Rôle de l’effecteur de type III DspA au cours de l’interaction entre arabidopsis thaliana et Erwinia amylovora by : Alexandre Degrave

Download or read book Rôle de l’effecteur de type III DspA au cours de l’interaction entre arabidopsis thaliana et Erwinia amylovora written by Alexandre Degrave and published by . This book was released on 2009 with total page 168 pages. Available in PDF, EPUB and Kindle. Book excerpt: La bactérie phytopathogène Erwinia amylovora est l’agent responsable du feu bactérien des Maloideae. Son pouvoir pathogène dépend de l’effecteur de type III DspA, une protéine injectée dans la cellule hôte par le système de sécrétion de type III bactérien (SSTT) et qui provoque une nécrose Gaudriault et al., 1997). L’objectif de ce travail de thèse était de déterminer le rôle de DspA dans la cellule végétale. Pour cela, nous avons choisi d’utiliser la plante Arabidopsis thaliana comme modèle d’étude, puisque l’inoculation d’E. amylovora provoque chez A. thaliana une nécrose dépendante de DspA. La première partie de ma thèse a consisté à caractériser l’interaction entre A.thaliana et E.amylovora. Les résultats montrent qu’E.amylovora se multiplie légèrement dans les feuilles inoculées de manière dépendante du SSTT et de DspA. De plus, la mort cellulaire est associée à la mise en place de réactions de défense chez la plante dont certaines sont induites par DspA. Par une approche transcriptomique, nous avons ensuite confirmé que DspA participe fortement à l’activation des voies de défenses. Les résultats obtenus suggèrent par ailleurs que DspA interfère notamment avec la biosynthèse des ribosomes. Enfin, des plantes A.thaliana transgéniques exprimant dspA sous contrôle d’un promoteur inductible à l’oestradiol ont été construites. L’analyse de ces plantes montre qu’une faible expression de dspA inhibe la croissance de la plante alors qu’un fort niveau d ‘expression déclenche la mort cellulaire. L’analyse des plantes transgéniques montre que DspA est principalement localisée dans le nucléole et que son expression inhibe la machinerie traductionnelle de la cellule végétale.

REGULATION OF NITROGEN ASSIMILATION IN RHIZOBIUM MELILOTI

Author : Tania Arcondéguy
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ISBN 13 :
Total Pages : 478 pages
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Book Synopsis REGULATION OF NITROGEN ASSIMILATION IN RHIZOBIUM MELILOTI by : Tania Arcondéguy

Download or read book REGULATION OF NITROGEN ASSIMILATION IN RHIZOBIUM MELILOTI written by Tania Arcondéguy and published by . This book was released on 1996 with total page 478 pages. Available in PDF, EPUB and Kindle. Book excerpt: RHIZOBIUM EST CAPABLE D'INDUIRE SUR LES RACINES DE LEGUMINEUSES DE VERITABLES ORGANES VEGETAUX AU SEIN DESQUELS LES BACTERIES REDUISENT L'AZOTE ATMOSPHERIQUE EN ION AMMONIUM GRACE AU COMPLEXE ENZYMATIQUE NITROGENASE. LORS DE CETTE SYMBIOSE, RHIZOBIUM ENVAHIT LE CYTOPLASME DES CELLULES HOTES ET SE DIFFERENCIE EN BACTEROIDE FIXATEUR D'AZOTE. EN ECHANGE DE SUBSTRATS CARBONES, CET ORGANELLE PRODUIT L'AMMONIAC, NORMALEMENT ASSIMILE PAR LES GLUTAMINE-SYNTHETASES NODULAIRES. L'HARMONIE DE CE SYSTEME REPOSE EN PARTICULIER SUR LA REGULATION DES FONCTIONS ANABOLIQUES DU BACTEROIDE QUI, LORS DE SA DIFFERENCIATION DE BACTERIE EN BACTEROIDE, PASSE D'UN ETAT D'ASSIMILATION DE L'AZOTE VERS UN ETAT D'EXPORT DE L'AZOTE. LE CONTROLE DU METABOLISME AZOTE CHEZ LES BACTERIES MET EN JEU UN REGULATEUR CENTRAL CODE PAR LE GENE GLNB, LA PROTEINE P#I#I. SELON LE MODELE QUI A ETE DEVELOPPE CHEZ LES ENTEROBACTERIES, LA PROTEINE P#I#I EST MODIFIEE PAR URIDYLYLATION EN FONCTION DU STATUT AZOTE DE LA CELLULE. CETTE PROTEINE CONTROLE L'ACTIVITE DE LA GLUTAMINE SYNTHETASE (GS) AU NIVEAU GENETIQUE ET METABOLIQUE. AU NIVEAU GENETIQUE, LA PROTEINE P#I#I REGULE L'EXPRESSION DU GENE DE LA GS, GLNA, PAR L'INTERMEDIAIRE DE L'ACTIVATEUR TRANSCRIPTIONNEL NTRC. AU NIVEAU METABOLIQUE, LA PROTEINE P#I#I REGULE L'ACTIVITE DE LA GS EN MODULANT SON ADENYLYLATION. RHIZOBIUM MELILOTI POSSEDE TROIS GLUTAMINE-SYNTHETASES, GSI, GSII ET GSIII. LA PROTEINE GSI HOMOLOGUE DE LA GS DES ENTEROBACTERIES EST LA SEULE GS DE RHIZOBIUM EXPRIMEE EN SYMBIOSE. AU COURS DE CETTE THESE, NOUS AVONS ETUDIE LA REGULATION DE L'ACTIVITE DE LA GSI ET LE ROLE DE LA PROTEINE P#I39I DANS LA SYMBIOSE ENTRE RHIZOBIUM MELILOTI ET LA LUZERNE. EN CULTURE PURE, LES MUTANTS GLNB SONT SEVEREMENT ALTERES AU NIVEAU DU METABOLISME AZOTE: DEREGULATION DE L'ADENYLYLATION DE LA GSI ET DE L'EXPRESSION DU GENE GLNII CODANT POUR LA GSII. DE PLUS, LES MUTANTS GLNB SONT FORTEMENT AFFECTES DANS LEUR PHENOTYPE SYMBIOTIQUE. ILS ENTRAINENT UN RETARD DE NODULATION ASSOCIE A UN DEFAUT D'INFECTION. BIEN QUE LES NODULES FORMES CONTIENNENT UN NIVEAU ELEVE DE NITROGENASE, LES PLANTES PRESENTENT UNE CARENCE AZOTEE MANIFESTE. CETTE CARENCE S'ACCOMPAGNE D'UNE FORTE ACCUMULATION D'AMIDON DANS LA ZONE DE FIXATION DU NODULE, SYMPTOME D'UNE PERTURBATION DE L'EQUILIBRE CARBONE/AZOTE DANS LES CELLULES VEGETALES. UNE CIBLE CONNUE DE LA PROTEINE P#I#I CHEZ LES ENTEROBACTERIES EST L'ADENYLYLATION DE LA GS. NOUS AVONS TESTE LE ROLE DE L'ADENYLYLATION DE LA GSI DE RHIZOBIUM MELILOTI EN SYMBIOSE, PAR LA CONSTRUCTION D'UNE SOUCHE DONT LA GSI N'EST PAS ADENYLYLABLE. NOUS PENSIONS QU'UN TEL MUTANT PERTURBERAIT LE FLUX D'AZOTE DU BACTEROIDE VERS LA PLANTE. CONTRAIREMENT A CETTE ATTENTE, CE MUTANT PRESENTE UN PHENOTYPE SYMBIOTIQUE NOD#+ FIX#+ DE TYPE SAUVAGE. CE PHENOTYPE S'EXPLIQUE PAR UNE FAIBLE ACTIVITE GSI DANS LES BACTEROIDES. L'EFFET DE LA PROTEINE P#I#I SUR LA SYMBIOSE EST DONC DU A D'AUTRES EFFETS. UNE HYPOTHESE SERAIT QUE LA PROTEINE P#I#I REGULE L'EXPRESSION OU L'ACTIVITE D'UN TRANSPORTEUR D'AMMONIAC BACTEROIDIEN DONT LA PRESENCE SERAIT INDISPENSABLE A LA NUTRITION AZOTEE DE LA PLANTE-HOTE

Recent advances in crop protection

Author : P.Parvatha Reddy
Publisher : Springer Science & Business Media
ISBN 13 : 8132207238
Total Pages : 282 pages
Book Rating : 4.1/5 (322 download)

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Book Synopsis Recent advances in crop protection by : P.Parvatha Reddy

Download or read book Recent advances in crop protection written by P.Parvatha Reddy and published by Springer Science & Business Media. This book was released on 2012-09-14 with total page 282 pages. Available in PDF, EPUB and Kindle. Book excerpt: In the recent years, the need to increase food production to meet the demands of rapidly increasing population from a limited land resource necessitated the use of intensive farming systems, with the inputs like narrow genetic base, high dose of fertilizers, pesticides, irrigation, monocropping, etc. which led to the development of diseases and pest. The effect of changing global climate, particularly the sharp increase in CO2 concentration, has increased the susceptibility of plants to pathogens and pests. Because of the chemicalization of agriculture, the age-old eco-friendly pest management practices like sanitation, crop rotation, mixed cropping, adjustment of date of planting, fallowing, summer ploughing, green manuring, composting, etc. are not being practiced, affecting the crops adversely. This has encouraged researchers to look for eco-friendly and novel approaches for pest management. The information on recent advances in crop protection (involving bacteria, fungi, nematodes, insects, mites and weeds) is scattered. The book delves upon the most latest developments in crop protection such as avermectins, bacteriophages, biofumigation, biotechnological approaches; bio-priming of seeds; disguising the leaf surface; use of non-pathogenic strains, plant defense activators, plant growth promoting rhizobacteria, pathogenesis-related proteins, strobilurin fungicides, RNA interference, and variety of mixtures/cultivar mixtures/multilines; soil solarization; biointensive integrated pest management; among several others (fusion protein-based biopesticides, seed mat technology and environmental methods). This book is a ready reference for students, policy-makers, scientists, researchers and extension workers.

Implications des harpines HrpNea et HrpWea, protéines de pathogénie de la bactérie Erwinia amylovora dans les étapes précoces d'interaction avec la cellule végétale

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Author : David Reboutier
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Total Pages : 282 pages
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Book Synopsis Implications des harpines HrpNea et HrpWea, protéines de pathogénie de la bactérie Erwinia amylovora dans les étapes précoces d'interaction avec la cellule végétale by : David Reboutier

Download or read book Implications des harpines HrpNea et HrpWea, protéines de pathogénie de la bactérie Erwinia amylovora dans les étapes précoces d'interaction avec la cellule végétale written by David Reboutier and published by . This book was released on 2006 with total page 282 pages. Available in PDF, EPUB and Kindle. Book excerpt: Harpins are protean effectors secreted by type III secretion system of phytopathogenic bacteria. The aim of the present work was to investigate the involvement of HrpNea and HrpWea harpins from Erwinia amylovora during the interaction between this bacteria and the plant cell. We first worked with suspension cells from the non-host plant Arabidopsis thaliana (incompatible situation). On this model, we showed that anion channel inhibition is a determinant event leading to cell death triggered by HrpNea. We then studied the effects of HrpWea. Our results showed that HrpWea has different effects depending on its concentration. At “high concentration”, HrpWea induced cell death, whereas at “low concentration”, HrpWea was able to inhibit HrpNea induced cell death. Anion channel modulation also appeared to be a determinant event of cell death inhibition. More widely, these results suggested that HrpWea could be a plant cell defense mechanism inhibitor. Finally, we studied the effects of HrpNea on the host apple cells (compatible situation). We showed differential responses between host and non-host plant cells, likely explaining that HrpNea did not trigger cell death in host plants.Taken together, these data allowed us to improve our knowledge concerning involvement of HrpNea and HrpWea in E. amylovora hypersensitive response and pathogenicity. Moreover, these results bring new data concerning the role of ion channels during cell death.

Recherche de suppresseurs de la toxicité induite chez Arabidopsis thaliana par l'effecteur de type 3 DspA/E et étude du stress oxydant au cours de l'infection

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Author : Alban Launay
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Book Synopsis Recherche de suppresseurs de la toxicité induite chez Arabidopsis thaliana par l'effecteur de type 3 DspA/E et étude du stress oxydant au cours de l'infection by : Alban Launay

Download or read book Recherche de suppresseurs de la toxicité induite chez Arabidopsis thaliana par l'effecteur de type 3 DspA/E et étude du stress oxydant au cours de l'infection written by Alban Launay and published by . This book was released on 2014 with total page 0 pages. Available in PDF, EPUB and Kindle. Book excerpt: La bactérie Erwinia amylovora est responsable de la maladie du feu bactérien des Maleae (pommier, poirier...). Le pouvoir pathogène de cette bactérie dépend d'une seringue moléculaire appelé système de sécrétion de type 3 (SSTT). Ce SSTT permet à la bactérie d'injecter des effecteurs dans les cellules de la plante. Parmi les effecteurs injectés, DspA/E est l'effecteur indispensable au pouvoir pathogène d'E. amylovora. Cet effecteur est à lui seul capable de provoquer la mort des cellules chez le pommier et le tabac et permet à la bactérie de se multiplier de manière transitoire chez A. thaliana. L'objectif de ce travail de thèse était de comprendre la fonction de DspA/E dans la cellule végétale et d'identifier des facteurs végétaux impliqués dans la toxicité de DspA/E. Afin de répondre à cette question, des plantes transgéniques exprimant DspA/E sous contrôle d'un promoteur inductible à l'estradiol ont été construites.Dans un premier temps, la caractérisation phénotypique des lignées exprimant DspA/E a été effectuée. Les résultats obtenus montrent que DspA/E est toxique lorsqu'il est exprimé in planta (il provoque la mort des cellules, inhibe la germination, la croissance racinaire et la traduction) et permet la multiplication in planta d'un mutant dspA/E. Un crible de mutants suppresseurs de la toxicité de l'effecteur DspA/E a été effectué sur une lignée transgénique exprimant DspA/E dans le but d'identifier un ou plusieurs gènes impliqués dans la toxicité de DspA/E. Ce crible suppresseur a permis d'identifier un candidat potentiel impliqué dans la photo-respiration, la glycolate oxydase 2 (GOX2). L'analyse fonctionnelle réalisée sur le mutant gox2-2 a permis de montrer que le gène GOX2 est un régulateur positif des réponses de défense d'A. thaliana en réponse à l'infection par E. amylovora.Enfin, la caractérisation du stress oxydant a permis de montrer que plusieurs formes actives de l'oxygène (H2O2 et O2.-) s'accumulent au cours de l'interaction entre A. thaliana et E. amylovora. Ceci a permis également de comprendre le rôle de DspA/E sur ce stress oxydant. Nos résultats suggèrent que la glycolate oxydase 2 participerait à l'induction du stress oxydant en perturbant le métabolisme des sucres.

Redundancy in the temporal control of floral meristem termination in Arabidopsis thaliana

Author : Nathanaël Prunet
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ISBN 13 :
Total Pages : 109 pages
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Book Synopsis Redundancy in the temporal control of floral meristem termination in Arabidopsis thaliana by : Nathanaël Prunet

Download or read book Redundancy in the temporal control of floral meristem termination in Arabidopsis thaliana written by Nathanaël Prunet and published by . This book was released on 2008 with total page 109 pages. Available in PDF, EPUB and Kindle. Book excerpt: La croissance aérienne d’Arabidopsis thaliana est assurée par le méristème apical caulinaire (MAC), qui contient des cellules souche dont les divisions permanentes permettent la mise en place continuelle de nouvelles structures. Au cours du développement reproducteur, le MAC produit des méristèmes floraux (MFs) sur ses flancs. Contrairement au MAC et bien qu’ils en soient issus, les MFs ne présentent pas de croissance indéfinie et produisent des fleurs, qui sont des structures déterminées, constituées d’un nombre fixe d’organes. Cette détermination est liée à la répression du gène WUSHEL (WUS), qui confère leur identité aux cellules souche, par le gène homéotique AGAMOUS (AG). Cet arrêt de l’entretien des cellules souche au sein du MF est lié à la mise en place des organes femelles de la fleur, les carpelles, et requiert l’action de SUPERMAN (SUP), qui permet l’établissement de la frontière entre les parties mâle et femelle de la fleur. Le travail de cette thèse consiste en la caractérisation de trois gènes, REBELOTE (RBL), SQUINT (SQN) et ULTRAPETALA1 (ULT1). La mutation combinée de 2 de ces gènes, ou de l’un d’entre eux et de CRABS CLAW (CRC), entraîne une perte marquée de l’arrêt du MF, qui continue alors indéfiniment à produire de nouveaux organes. La gamme de phénotypes obtenus suggère que l’arrêt de l’entretien des cellules souche au centre du MF est un phénomène progressif, contrôlé de manière redondante par plusieurs gènes. Une analyse génétique et moléculaire montre que les phénotypes obtenus résultent d’une baisse d’expression d’AG dans une partie interne de son domaine d’expression, au centre du MF. Cependant, ce défaut d’expression d’AG est insuffisant pour expliquer tous les phénotypes observés, et les données génétiques obtenues suggèrent que RBL, SQN et ULT1 influencent aussi l’activité de SUP. Enfin, des études préliminaires suggèrent que SQN pourrait influencer AG via la voie CLAVATA (CLV), tandis que RBL semble jouer sur la biosynthèse des microARNs, dont une famille, miR172, affecte l’activité d’AG. Finalement, RBL, SQN et ULT1 semblent contribuer à l’homéostasie du développement floral.

Organization, variability and epigenetic control of 5S rRNA genes in Arabidopsis thaliana

Author : Lauriane Simon
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Total Pages : 0 pages
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Book Synopsis Organization, variability and epigenetic control of 5S rRNA genes in Arabidopsis thaliana by : Lauriane Simon

Download or read book Organization, variability and epigenetic control of 5S rRNA genes in Arabidopsis thaliana written by Lauriane Simon and published by . This book was released on 2016 with total page 0 pages. Available in PDF, EPUB and Kindle. Book excerpt: L'ARNr 5S est une partie intégrante du ribosome indispensable pour la synthèse des protéines. Cette fonction essentielle nécessite une régulation fine de l'expression des ARNr 5S en fonction des exigences cellulaires. L'ARNr 5S est codé par des gènes organisés en répétitions en tandem principalement situés dans les régions péricentromériques des chromosomes 3, 4 et 5 dans le génome Col-0 d'Arabidopsis thaliana. L'étude approfondie de l'organisation, la dynamique et la régulation épigénétique des gènes d'ARNr 5S reste cependant difficile du fait de l'absence d'assemblage de ces régions hautement répétées dans la séquence du génome d'Arabidopsis disponible dans TAIR10.Dans cette thèse, nous apportons de nouvelles informations sur les gènes d'ARNr 5S chez Arabidopsis. Nous avons confirmé les signatures d'ADN spécifiques par séquençage haut débit, identifié des polymorphismes spécifiques des régions chromosomiques portant des ADNr 5S et ainsi défini de nouvelles séquences de référence. Nous avons également étudié le statut épigénétique des gènes ARNr 5S, montrant que ces gènes sont globalement enrichis en marques répressives. Les loci situés sur les chromosomes 4 et 5 présentent également des modifications post-traductionnelles d'histones et des variants d'histone particuliers et caractéristiques d'une activité de transcription. Nous avons aussi montré que les loci d'ADNr 5S sont très dynamiques au sein de l'espèce Arabidopsis avec des variations entre différent écotypes du nombre de copies de gènes d'ARNr 5S et de l'importance relative de chaque cluster. En utilisant l'écotype Ler et des mutants spécifiques, nous montrons que le locus du chromosome 5 est une source majeure de réarrangements chromosomiques qui affectent l'organisation de la chromatine dans le noyau. Enfin, nous suggérons que des variations de l'état chromatinien des gènes d'ARNr 5S peuvent conduire à une différence de transcription dans les différents écotypes.Cette étude permet d'établir un rôle de l'organisation de la chromatine dans la régulation transcriptionnelle et l'organisation des gènes d'ARNr 5S.

Agriculturally Important Microorganisms

Author : Harikesh Bahadur Singh
Publisher : Springer
ISBN 13 : 9789811096563
Total Pages : 0 pages
Book Rating : 4.0/5 (965 download)

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Book Synopsis Agriculturally Important Microorganisms by : Harikesh Bahadur Singh

Download or read book Agriculturally Important Microorganisms written by Harikesh Bahadur Singh and published by Springer. This book was released on 2018-07-07 with total page 0 pages. Available in PDF, EPUB and Kindle. Book excerpt: The main focus of this book is to survey the current status of research, development and use of agriculturally important microorganisms in Asian countries and develop a strategy for addressing critical issues various policy constraints due to which bio-pesticides have found limited applications. In this book the editors have tried to develop a consensus on issues of such as quality requirements, quality control, regulatory management, commercialization and marketing of agriculturally important microorganisms in Asian countries. All these issues are discussed at national level by competent authorities of Asian countries including India, China, Malaysia, Iran, Taiwan, Israel, Sri Lanka, Vietnam and Philippines.