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Etude Structurale Et Dynamique Des Peptides En Solution Par Rmn
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Book Synopsis ETUDE STRUCTURALE ET DYNAMIQUE DES PEPTIDES EN SOLUTION PAR RMN by : Bruno Kieffer
Download or read book ETUDE STRUCTURALE ET DYNAMIQUE DES PEPTIDES EN SOLUTION PAR RMN written by Bruno Kieffer and published by . This book was released on 1992 with total page pages. Available in PDF, EPUB and Kindle. Book excerpt: LA RESONANCE MAGNETIQUE NUCLEAIRE (RMN) EST UNE METHODE DE CHOIX POUR L'ETUDE DE PEPTIDES DE PETITES ET MOYENNES TAILLES IMPLIQUES DANS DES PROCESSUS DE RECONNAISSANCE INTERMOLECULAIRE. LA COMPREHENSION DE CES MECANISMES DE RECONNAISSANCE FAIT INTERVENIR NON SEULEMENT LA STRUCTURE DES MOLECULES EN PRESENCE, MAIS AUSSI LEUR CAPACITE D'ADAPTATION CONFORMATIONNELLE QUI EST RELIEE A LA FLEXIBILITE DE CES MOLECULES. L'ETUDE ET LA QUANTIFICATION DES PHENOMENES DE RELAXATION ENTRE SPINS A L'INTERIEUR D'UN PEPTIDE PERMET D'ACCEDER A DES INFORMATIONS STRUCTURALES ET DYNAMIQUES. CEPENDANT, LA COMPLEXITE DES MECANISMES DE RELAXATION OU LA FAIBLE SENSIBILITE DE NOYAUX COMME LE CARBONE 13 RENDENT LA DETERMINATION DE CES PARAMETRES DIFFICILE. NOUS AVONS DEVELOPPE DES METHODES SPECTROSCOPIQUES ET INFORMATIQUES PERMETTANT DE QUANTIFIER ET D'ANALYSER CES PARAMETRES DE RELAXATION. NOUS AVONS APPLIQUE CES METHODES A L'ANALYSE DE LA STRUCTURE ET DE LA DYNAMIQUE DE DEUX TYPES DE PEPTIDES. D'UNE PART, NOUS AVONS MODELISE LA STRUCTURE ET LA FLEXIBILITE DE DEUX PEPTIDES CYCLIQUES MIMANT UN SITE ANTIGENIQUE DE L'HEMAGGLUTININE DU VIRUS DE LA GRIPPE. D'AUTRE PART, NOUS NOUS INTERESSES A LA STRUCTURE D'UN TETRAPEPTIDE ISSU DE LA FIBRONECTINE ET IMPLIQUE DANS LE PHENOMENE D'ADHESION CELLULAIRE
Book Synopsis ETUDES PAR DYNAMIQUE MOLECULAIRE ET SPECTROSCOPIE RMN DE LA STRUCTURE LOCALE DES PETITS PEPTIDES EN SOLUTION AQUEUSE METTANT EN JEU DES RESIDUS AROMATIQUES by : FREDERICO.. NARDI
Download or read book ETUDES PAR DYNAMIQUE MOLECULAIRE ET SPECTROSCOPIE RMN DE LA STRUCTURE LOCALE DES PETITS PEPTIDES EN SOLUTION AQUEUSE METTANT EN JEU DES RESIDUS AROMATIQUES written by FREDERICO.. NARDI and published by . This book was released on 1999 with total page 154 pages. Available in PDF, EPUB and Kindle. Book excerpt: MEME SI HABITUELLEMENT LES PETITS PEPTIDES NE POSSEDENT PAS D'ARRANGEMENT EN SOLUTION AQUEUSE, CERTAINES SEQUENCES LEURS CONFERENT UNE STRUCTURE LOCALE. A PARTIR DE L'ANALYSE DES DEPLACEMENTS CHIMIQUES MESURES PAR SPECTROSCOPIE RMN, KEMMINK ET CREIGHTON J MOL BIOL (1993) 234 861 DETECTERENT DANS DE PETITS PEPTIDES EN SOLUTION AQUEUSE EXTRAITS DE LA SEQUENCE DU BPTI LA FORMATION DE STRUCTURES LOCALES METTANT EN JEU LES RESIDUS AROMATIQUES. DANS LE PEPTIDE GLY-ALA-PRO-TYR(I)-THR-GLY-ALA EN SOLUTION AQUEUSE KEMMINK AND CREIGHTON J MOL BIOL (1995) 245 251 LA TYROSINE INTERAGIT AVEC LE PROTON AMIDE DE LA GLYCINE A LA POSITION I + 2, EN FORMANT UNE INTERACTION APPELEE AROMATIQUE(I)-AMIDE(I + 2). QUAND LA PROLINE EST EN CONFORMATION CIS, L'ANNEAU AROMATIQUE INTERAGIT AUSSI AVEC LES ATOMES DU SQUELETTE DE L'ALANINE ET LES ATOMES DE L'ANNEAU DE LA PROLINE EN FORMANT UNE INTERACTION APPELEE CISPROLINE(I-1)-AROMATIQUE(I). AFIN DE CARACTERISER DANS LE DETAIL CES DEUX INTERACTIONS AU NIVEAU ATOMIQUE, NOUS AVONS ETUDIE LES UNITES PEPTIDIQUES ALA-CISPRO-TYR ET TYR-THR-GLY-PRO EN UTILISANT UN GRAND EVENTAIL DE TECHNIQUES THEORIQUES ET EXPERIMENTALES COMME L'ANALYSE DES BANQUES DE DONNEES TRIDIMENSIONNELLES, L'ECHANTILLONNAGE DES CONFORMATIONS, LA SIMULATION PAR DYNAMIQUE MOLECULAIRE, LE CALCUL D'ENERGIE LIBRE ET LA SPECTROSCOPIE RMN DU PROTON ET DU CARBONE 1 3C. L'ANALYSE DES BANQUES DE DONNEES ET LA RECHERCHE SYSTEMATIQUE DES CONFORMATIONS ONT REVELE POUR LES DEUX PEPTIDES DANS L'ETAT REPLIE AU MOINS DEUX CONFORMATIONS DOMINANTES ET DISTINCTES QUI SONT COMPATIBLES AVEC LES DONNEES EXPERIMENTALES. L'INTERACTION AROMATIQUE(I)-AMIDE(I + 2) PEUT AVOIR UN ARRANGEMENT DE LA LIAISON N-H PARALLELE OU PERPENDICULAIRE AVEC L'ANNEAU AROMATIQUE. LES INTERACTIONS INTRAMOLECULAIRES LE LONG DU SQUELETTE ET LES INTERACTIONS AVEC LES MOLECULES D'EAU STABILISENT CES STRUCTURES. L'INTERACTION CISPROLINE(I-1)-AROMATIQUE(I) PERMET UN AGENCEMENT COMPACT DE L'ANNEAU AROMATIQUE AVEC, SOIT LE PROTON H(I-2), SOIT LE PROTON H(I-1), MAIS PAS AVEC LES DEUX ENSEMBLE. A PARTIR DE TOUTES LES CONFORMATIONS JUGEES PROBABLES, DES SIMULATIONS PAR DYNAMIQUE MOLECULAIRE, ET DES CALCULS D'ENERGIE LIBRE ONT ETE EFFECTUES. EN PARALLELE, LES DEPLACEMENTS CHIMIQUES 1H ET 1 3C, ET LES CONSTANTES D'ACCOUPLEMENT 3J ONT ETE MESURES SUR LE PEPTIDE ALA-CISPRO-TYR. UN EXCELLENT ACCORD A ETE OBTENU ENTRE TOUTES LES PROPRIETES RMN MESUREES ET CALCULEES. LE SCENARIO DETAILLE ET PRECIS DU REPLIEMENT DE CES PEPTIDES OBTENU A PARTIR DE CES ETUDES EST LE RESULTAT DE L'UTILISATION COMPLEMENTAIRE ET COMBINEE DES TECHNIQUES EXPERIMENTALES ET THEORIQUES.
Book Synopsis DETERMINATION, PAR RMN, DE LA STRUCTURE TRIDIMENSIONNELLE DES PEPTIDES ET DES PROTEINES by : YINSHAN.. YANG
Download or read book DETERMINATION, PAR RMN, DE LA STRUCTURE TRIDIMENSIONNELLE DES PEPTIDES ET DES PROTEINES written by YINSHAN.. YANG and published by . This book was released on 1993 with total page pages. Available in PDF, EPUB and Kindle. Book excerpt: CE TRAVAIL A PERMIS, GRACE A DES TECHNIQUES DE RESONANCE MAGNETIQUE NUCLEAIRE (RMN) A 2 ET 3 DIMENSIONS, A L'ETUDE CONFORMATIONNELLE DE PEPTIDES ET DE PROTEINES EN SOLUTION. UNE PREMIERE APPLICATION CONCERNE UN PEPTIDE (23 ACIDES AMINES) ISSU DE LA BRANCHE N-TERMINALE DE L'ASPARTYL-TARN SYNTHETASE. IL A ETE MONTRE PAR DES EXPERIENCES DE DICHROISME CIRCULAIRE QUE LE PEPTIDE EN SOLUTION AQUEUSE INTERAGIT AVEC POLY(DT). LA TECHNIQUE DE RMN 2D A ETE UTILISEE POUR ATTRIBUER LES SPECTRES PROTON. SUR LA BASE DES CONTRAINTES DE DISTANCES INTER-PROTONIQUE TIREES DES EXPERIENCES NOESY, LA STRUCTURE TRIDIMENSIONNELLE DU PEPTIDE A ETE DETERMINEE. ENSUITE LA TRANSITION CONFORMATIONNELLE D'UNE PROTEINE, L'ALPHA-COBRATOXINE (71 ACIDES AMINES) EN FONCTION DU PH A ETE ETUDIE. L'ATTRIBUTION COMPLETE DES RESONANCES PROTONIQUES A ETE REALISEE A PH NEUTRE PAR DIFFERENTES EXPERIENCES DE RMN 2D. LA RMN COUPLEE AUX CALCULS DE DYNAMIQUE MOLECULAIRE A MONTRE QUE LA CONFORMATION GLOBALE ETAIT CONSERVEE AVEC DES DIFFERENCES LOCALES EN PARTICULIER AU NIVEAU DE L'HISTIDINE 18. LA STRUCTURE D'UNE AUTRE PROTEINE, LA SOUS-UNITE A DE LA CROTOXINE (90 ACIDES AMINES) A ETE EGALEMENT ETUDIEE. L'ATTRIBUTION COMPLETE DES RESONANCES DU PROTON A L'AIDE DES EXPERIENCES RMN-2D ET 3D A ETE EFFECTUEE. LES CARTES 2D NOESY ONT PERMIS L'EVALUATION DES DISTANCES INTER-PROTONIQUES QUI CONSTITUENT AINSI LES CONTRAINTES POUR LES CALCULS DE DYNAMIQUE MOLECULAIRE
Book Synopsis TECHNIQUES DE MODELISATION MOLECULAIRE DEDIEES A L'ETUDE STRUCTURALE DE PEPTIDES ET PROTEINES EN SOLUTION, A PARTIR DE DONNEES DE RMN. APPLICATION A L'ETUDE DE LA COMPLEMENTATION D'UN MUTANT DE LA PHOSPHOGLYCERATE KINASE ET DU CHANGEMENT CONFORMATIONNEL PH-DEPENDANT DE L'ALPHA-COBRATOXINE by : Éric Leroy
Download or read book TECHNIQUES DE MODELISATION MOLECULAIRE DEDIEES A L'ETUDE STRUCTURALE DE PEPTIDES ET PROTEINES EN SOLUTION, A PARTIR DE DONNEES DE RMN. APPLICATION A L'ETUDE DE LA COMPLEMENTATION D'UN MUTANT DE LA PHOSPHOGLYCERATE KINASE ET DU CHANGEMENT CONFORMATIONNEL PH-DEPENDANT DE L'ALPHA-COBRATOXINE written by Éric Leroy and published by . This book was released on 1996 with total page 226 pages. Available in PDF, EPUB and Kindle. Book excerpt: LES TECHNIQUES DE MODELISATION MOLECULAIRE PERMETTENT DE RECONSTRUIRE ET D'ETUDIER DES MODELES DE STRUCTURE 3D DE MOLECULES PROTEIQUES EN SOLUTION A PARTIR DE DONNEES DE RESONANCE MAGNETIQUE NUCLEAIRE. DES MODELES DE STRUCTURE 3D D'UN DODECAPEPTIDE DE SYNTHESE COMPLEMENTANT UN MUTANT DE LA PHOSPHOGLYCERATE KINASE ONT ETE RESOLUS A PARTIR DE DONNEES D'EFFET NUCLEAIRE OVERHAUSER TRANSFERE. CES MODELES CONFORTENT L'HYPOTHESE DE LA COMPLEMENTATION STRUCTURALE DU MUTANT. LA MODELISATION DU COMPLEXE SOLVATE MUTANT/PEPTIDE A FAIT APPARAITRE DES LIMITES DANS LA CAPACITE DES CHAMPS DE FORCE A TRAITER LES ERREURS CONFORMATIONNELLES LOCALES. L'ETABLISSEMENT DE MODELES DE STRUCTURE 3D DE L'ALPHA-COBRATOXINE A PH NEUTRE A PERMIS D'ETUDIER, A L'ECHELLE ATOMIQUE, LES DIFFERENCES CONFORMATIONNELLES PH-DEPENDANTES DE CETTE PROTEINE. LE CHANGEMENT CONFORMATIONNEL ENTRE LES DEUX ETATS STABLES DE LA MOLECULE A ALORS ETE MODELISE PAR LA METHODE DE SIMULATION DE DYNAMIQUE DIRIGEE. CETTE TECHNIQUE A PERMIS DE METTRE EN EVIDENCE LES DIFFERENTS RESIDUS IMPLIQUES DANS LA TRANSITION
Book Synopsis ETUDE STRUCTURALE PAR RMN DE PEPTIDES ET PROTEINES DU SYSTEME VASOREGULATEUR by : PHILIPPE.. SIZUN
Download or read book ETUDE STRUCTURALE PAR RMN DE PEPTIDES ET PROTEINES DU SYSTEME VASOREGULATEUR written by PHILIPPE.. SIZUN and published by . This book was released on 1991 with total page pages. Available in PDF, EPUB and Kindle. Book excerpt: L'OBJECTIF PRINCIPAL DE CE TRAVAIL EST DE MONTRER COMMENT LA RESONANCE MAGNETIQUE NUCLEAIRE (RMN) PERMET D'ACCEDER A LA STRUCTURE TRIDIMENSIONNELLE DE PEPTIDES ET DE PROTEINES EN SOLUTION. L'ETUDE COMPAREE DE COMPOSES VASOREGULATEURS ALLANT DE PETITS PEPTIDES HORMONAUX A UNE PROTEINE DE 65 RESIDUS, L'HIRUDINE A PERMIS DE DEGAGER LES STRATEGIES 1D ET 2D LES PLUS APPROPRIEES. IL EST APPARU QUE LA TAILLE DU PEPTIDE JOUE UN ROLE FONDAMENTAL DANS LA PROBABILITE DE STRUCTURATION EN SOLUTION, L'ABSENCE DE COOPERATIVITE LIMITANT AINSI LA MOBILITE STRUCTURALE DE PETITS PEPTIDES. CETTE DERNIERE CROIT DES QUE LA TAILLE AUGMENTE OU QUE DES POINTS DE BLOCAGE CONFORMATIONNELS (PONTS DISULFURE) EXISTENT. POUR UNE PROTEINE TELLE QUE L'HIRUDINE, LA COMBINAISON DES DONNEES RMN EXTRAITE D'EXPERIENCES SPECIFIQUES (DEPLACEMENTS CHIMIQUES CONSTANTES DE COUPLAGE, EFFETS OVERHAUSER, ACCESSIBILITE DES PROTONS AMIDES) ET DE LA MODELISATION MOLECULAIRE CONTRAINTE A PERMIS DE PROPOSER UNE STRUCTURE 3D EN SOLUTION. UNE ANALYSE COMPARATIVE DES STRUCTURES OBTENUES ET DE CELLES PREVISIBLES GRACE AUX METHODES DE PREDICTION A MIS EN LUMIERE LA NOTION DE PREDISPOSITION CONFORMATIONNELLE POUVANT SERVIR DE BASE AUX ETUDES DE RELATION STRUCTURE-ACTIVITE
Book Synopsis ETUDE STRUCTURALE ET DYNAMIQUE PAR RMN DE DEUX FAMILLES DE PEPTIDES by : GEORGES.. MER
Download or read book ETUDE STRUCTURALE ET DYNAMIQUE PAR RMN DE DEUX FAMILLES DE PEPTIDES written by GEORGES.. MER and published by . This book was released on 1996 with total page 208 pages. Available in PDF, EPUB and Kindle. Book excerpt: NOUS AVONS DETERMINE LES STRUCTURES TRIDIMENSIONNELLES, PAR RESONANCE MAGNETIQUE NUCLEAIRE (RMN), DE TROIS INHIBITEURS DE PROTEASES A SERINE DE L'INSECTE LOCUSTA MIGRATORIA: PMP-C, PMP-C FUCOSYLE (LA FORME NATURELLE) ET PMP-D2. LES TROIS MOLECULES ONT DES STRUCTURES TERTIAIRES TRES SIMILAIRES. ELLES COMPORTENT TROIS PONTS DISULFURE ET PRESENTENT UN COURT FEUILLET BETA A TROIS BRINS ANTIPARALLELES S'ORGANISANT AUTOUR D'UN CUR DE RESIDUS HYDROPHOBES. CETTE ETUDE, ASSOCIEE A UNE ANALYSE FONCTIONNELLE REALISEE DANS LE GROUPE DE HELENE HIETTER (INSTITUT DE NEUROCHIMIE DU CNRS, STRASBOURG), A PERMIS DE MONTRER QUE LE SITE REACTIF EST SITUE ENTRE DEUX DEMI-CYSTINES DE L'EXTREMITE CARBOXY-TERMINALE ET QUE CES PEPTIDES SONT LES PREMIERS REPRESENTANTS D'UNE NOUVELLE FAMILLE D'INHIBITEURS DE PROTEASES. D'UN POINT DE VUE PLUS FONDAMENTAL, PAR LA MESURE DES PARAMETRES DE RELAXATION DU CARBONE 13, NOUS AVONS MONTRE QUE PMP-D2 ETAIT ANIME DE MOUVEMENTS LENTS (DANS LE DOMAINE DE LA MILLISECONDE). CES MOUVEMENTS POURRAIENT ETRE RELIES A L'ISOMERISATION CONFORMATIONNELLE D'UN OU PLUSIEURS PONTS DISULFURE. UNE ETUDE COMPAREE DES DEUX FORMES DE PMP-C (AVEC ET SANS FUCOSE) NOUS A PERMIS D'ANALYSER L'EFFET D'UNE GLYCOSYLATION SUR LA STRUCTURE ET LA DYNAMIQUE D'UN PEPTIDE. NOS RESULTATS MONTRENT QUE LE FUCOSE ADOPTE UNE ORIENTATION PRIVILEGIEE, QU'IL NE MODIFIE PAS LA CONFORMATION DE LA CHAINE PRINCIPALE DU PEPTIDE, MAIS QU'IL AFFECTE LA DYNAMIQUE INTERNE ET STABILISE LA MOLECULE. L'ENERGIE DE STABILISATION EST D'ENVIRON 1 KCAL/MOL A 20C. D'AUTRE PART, NOUS PRESENTONS L'ANALYSE CONFORMATIONNELLE D'UNE SERIE DE PEPTIDES ANTIAGREGANTS PLAQUETTAIRES. CETTE ETUDE A REVELE QUE LES CARBONES ET PROTONS ALPHA D'UNE SEQUENCE ANTIAGREGANTE DU TYPE ARG-GLY-ASP-PHE EN COUDE BETA ETAIENT SUPERPOSABLES AUX CARBONES ET PROTONS ALPHA DES MEMES RESIDUS DANS UNE SEQUENCE ARG-GLY-XXX-PHE-ASP EN HELICE ALPHA. CES TRAVAUX ONT PAR AILLEURS DEBOUCHE SUR L'UTILISATION D'UNE PETITE TOXINE DE SCORPION COMME SUPPORT POUR FIXER UNE SEQUENCE DONNEE D'ACIDES AMINES DANS UNE CONFORMATION EN HELICE ALPHA
Book Synopsis ETUDE PAR RMN DE LA DYNAMIQUE EN SOLUTION DES DOMAINES DE LIAISON A L'ADN DE DEUX PROTEINES, ALCR ET FRUR by : GERALDINE.. GOUSSARD
Download or read book ETUDE PAR RMN DE LA DYNAMIQUE EN SOLUTION DES DOMAINES DE LIAISON A L'ADN DE DEUX PROTEINES, ALCR ET FRUR written by GERALDINE.. GOUSSARD and published by . This book was released on 2000 with total page 222 pages. Available in PDF, EPUB and Kindle. Book excerpt: L'ETUDE STRUCTURALE D'UNE PROTEINE NE SUFFIT GENERALEMENT PAS A COMPRENDRE FINEMENT SA FONCTION ET LA FACON DONT ELLE INTERAGIT AVEC SON OU SES PARTENAIRES BIOLOGIQUES. L'ETUDE DYNAMIQUE PERMET DE COMPLETER CETTE IMAGE STATIQUE DE LA MOLECULE. LE TRAVAIL QUI A ETE EFFECTUE AU COURS DE CETTE THESE EST L'ETUDE DYNAMIQUE PAR RMN DES DOMAINES DE LIAISON A L'ADN DE DEUX PROTEINES, ALCR ET FRUR, TOUTES DEUX IMPLIQUEES DANS LE PROCESSUS DE TRANSCRIPTION. L'ETUDE DE DYNAMIQUE D'ALCR A ETE EFFECTUEE SUR LE DOMAINE LIBRE MAIS AUSSI LIE A SA CIBLE NUCLEOTIDIQUE. LE SYSTEME DE SPIN QUI FUT ETUDIE EST LE SYSTEME 1 5N- 1H. CES RESULTATS ONT PERMIT DE COMPLETER CEUX DE L'ETUDE STRUCTURALE. UNE DESCRIPTION RELATIVEMENT DETAILLEE A PU ETRE FAITE SUR LA FLEXIBILITE DE LA PROTEINE LIBRE ET LIEE. LA COMPARAISON DES DEUX A PERMIS DE PROPOSER UN MODELE POUR LA RECONNAISSANCE DE L'ADN PAR ALCR. L'ETUDE DYNAMIQUE DE FRUR A ETE REALISEE SUR LE SYSTEME DE SPIN 1 3C- 1H, SUR LE DOMAINE LIBRE. UNE ETUDE DYNAMIQUE SUR LE SYSTEME 1 5N- 1H AVAIT DEJA ETE REALISEE AU LABORATOIRE. LA COMPARAISON DE NOS RESULTATS AVEC LES PRECEDENTS A PERMIS DE COMPLETER LA DESCRIPTION DE LA DYNAMIQUE INTERNE DE LA PROTEINE. DE PLUS, LA MISE EN PARALLELE DES DEUX ETUDES PERMET D'OBSERVER LES DIFFERENCES ENTRE CES DEUX TYPES D'ETUDES.
Book Synopsis STRUCTURE ET DYNAMIQUE DE FRAGMENTS PEPTIDIQUES by : François Macquaire
Download or read book STRUCTURE ET DYNAMIQUE DE FRAGMENTS PEPTIDIQUES written by François Macquaire and published by . This book was released on 1992 with total page 205 pages. Available in PDF, EPUB and Kindle. Book excerpt: L'OBJET GENERAL DE CE TRAVAIL EST L'ETUDE DES PROCESSUS DE STRUCTURATION INDUITS PAR UNE INTERFACE MEMBRANAIRE SUR LA CONFORMATION DE PEPTIDES. DES PEPTIDES ET LIPOPEPTIDES ONT ETE SYNTHETISES ET LEUR CONFORMATION ETUDIEE PAR RESONANCE MAGNETIQUE NUCLEAIRE (RMN) DES PROTONS, DANS DES SOLVANTS ORGANIQUES AINSI QU'EN SOLUTION AQUEUSE, EN ABSENCE ET EN PRESENCE DE MICELLES DE DODECYLPHOSPHOCHOLINE DEUTEREES. LA PREMIERE PARTIE DE CE TRAVAIL EST CONSACREE A L'ETUDE CONFORMATIONNELLE D'UN PEPTIDE MODELE KGRKDG ET DU LIPOPEPTIDE CORRESPONDANT, OBTENU PAR COUPLAGE AVEC UN GROUPEMENT LIPIDIQUE PAR L'INTERMEDIAIRE DE LA CHAINE LATERALE DE LA LYSINE. EN SOLUTION AQUEUSE, LE PEPTIDE LIBRE EST ESSENTIELLEMENT DESORDONNE, Y COMPRIS EN PRESENCE DE MICELLES. ANCRE A L'INTERFACE MEMBRANAIRE, LE PEPTIDE ADOPTE UNE CONFORMATION PREFERENTIELLE DE TYPE TURN. IL NOUS A AUSSI ETE POSSIBLE DE DETERMINER LA CONFORMATION PRECISE DU FRAGMENT DIACYL-GLYCERIQUE DANS UN ENVIRONNEMENT LIPIDIQUE ET ETABLIR L'ORIENTATION MOYENNE DU FRAGMENT PEPTIDIQUE PAR RAPPORT A L'INTERFACE MICELLAIRE. LA SECONDE PARTIE DE CE TRAVAIL EST CONSACREE A L'ETUDE CONFORMATIONNELLE DE FRAGMENTS PEPTIDIQUES ISSUES DE L'ANNEXINE I. LES ANNEXINES SONT UNE FAMILLE DE PROTEINES LIANT SPECIFIQUEMENT LES IONS CALCIUM ET LES PHOSPHOLIPIDES ET DONT LA SEQUENCE PRIMAIRE FORTEMENT SYMETRIQUE, AUTORISE UNE ETUDE PAR FRAGMENTS. LA CONFORMATION DE DEUX PEPTIDES DE SYNTHESE F1(18AA) ET F2(32AA), REVELEE PAR RMN, EST TRES PROCHE DE CELLE OBSERVEE DANS LE CRISTAL: BOUCLE-HELICE POUR F1 ET HELICE-BOUCLE-HELICE POUR F2. EN PRESENCE DE MICELLES, LA CONFORMATION PREFERENTIELLE (HELICES ET BOUCLE) DU FRAGMENT F2 EST STABILISEE ET QUELQUES ELEMENTS DE STRUCTURES TERTIAIRES (CONTACTS ENTRE HELICES) SONT DETECTES. L'INFLUENCE DU CALCIUM SUR LA CONFORMATION DU FRAGMENT F2 CONSISTE A STRUCTURER LA BOUCLE CE QUI INDUIT UNE STABILISATION DES DEUX HELICES, PROBABLEMENT DUE A L'AUGMENTATION DES CONTACTS ENTRE HELICES
Book Synopsis Solution Structure and Dynamics of Peptides as Studied by NMR and CD by : Klas G. J. Arvidsson
Download or read book Solution Structure and Dynamics of Peptides as Studied by NMR and CD written by Klas G. J. Arvidsson and published by . This book was released on 1994 with total page 51 pages. Available in PDF, EPUB and Kindle. Book excerpt:
Book Synopsis Développement et applications de méthodes RMN rapides pour l'étude de la structure et la dynamique des protéines by : Paul Schanda
Download or read book Développement et applications de méthodes RMN rapides pour l'étude de la structure et la dynamique des protéines written by Paul Schanda and published by . This book was released on 2007 with total page 236 pages. Available in PDF, EPUB and Kindle. Book excerpt: La RMN multidimensionnelle (RMN-nD) est la méthode de choix pour l'étude structurale et dynamique des protéines en solution avec une résolution atomique. Une limitation de la RMN-nD est la longue durée de l'acquisition: le temps d'acquisition du jeu de données nécessaire pour une étude structurale est souvent de l'ordre de plusieurs semaines. De plus des processus cinétiques, qui se passent à l'échelle de la seconde, ne sont pas accessibles aux études en temps réel par RMN-nD en utilisant les méthodes standards. Ce travail présente des développements méthodologiques qui visent à accélérer la RMN-nD en optimisant la relaxation longitudinale des protons amides. Les méthodes proposées permettent d'acquérir des spectres de corrélation 2D 1H-15 N (3D 1H-15N-13C) en quelques secondes (quelques minutes). En plus, en combinaison avec des méthodes existantes (encodage spatial, encodage Hadamard), le temps d'acquisition pour des spectres 2D peut être réduit à une seconde. Des applications à l'étude de phenomène cinétiques des protéines sont montrées.Cette thèse présente aussi une nouvelle expérience RMN qui permet d'évaluer rapidement la qualité d'un échantillon de protéine, et une nouvelle méthode pour mesurer des couplages dipolaires résiduels entre protons amides avec une meilleure sensibilité que les méthodes existantes.
Book Synopsis Développement et applications de méthodes RMN rapides pour l'étude de la structure et la dynamique des protéines by : Paul Schanda
Download or read book Développement et applications de méthodes RMN rapides pour l'étude de la structure et la dynamique des protéines written by Paul Schanda and published by . This book was released on 2007 with total page 0 pages. Available in PDF, EPUB and Kindle. Book excerpt: La RMN multidimensionnelle (RMN-nD) est la méthode de choix pour l'étude structurale et dynamique des protéines en solution avec une résolution atomique. Une limitation de la RMN-nD est la longue durée de l'acquisition: le temps d'acquisition du jeu de données nécessaire pour une étude structurale est souvent de l'ordre de plusieurs semaines. De plus des processus cinétiques, qui se passent à l'échelle de la seconde, ne sont pas accessibles aux études en temps réel par RMN-nD en utilisant les méthodes standards. Ce travail présente des développements méthodologiques qui visent à accélérer la RMN-nD en optimisant la relaxation longitudinale des protons amides. Les méthodes proposées permettent d'acquérir des spectres de corrélation 2D 1H-15 N (3D 1H-15N-13C) en quelques secondes (quelques minutes). En plus, en combinaison avec des méthodes existantes (encodage spatial, encodage Hadamard), le temps d'acquisition pour des spectres 2D peut être réduit à une seconde. Des applications à l'étude de phenomène cinétiques des protéines sont montrées.Cette thèse présente aussi une nouvelle expérience RMN qui permet d'évaluer rapidement la qualité d'un échantillon de protéine, et une nouvelle méthode pour mesurer des couplages dipolaires résiduels entre protons amides avec une meilleure sensibilité que les méthodes existantes.
Book Synopsis SYNTHESE ET ANALYSE STRUCTURALE DE N-HYDROXY PEPTIDES by : VIRGINIE.. DUPONT
Download or read book SYNTHESE ET ANALYSE STRUCTURALE DE N-HYDROXY PEPTIDES written by VIRGINIE.. DUPONT and published by . This book was released on 1993 with total page 161 pages. Available in PDF, EPUB and Kindle. Book excerpt: LE BUT DE CETTE THESE EST DE RECONNAITRE L'INFLUENCE STRUCTURALE DE LA N-HYDROXYLATION D'UNE SEQUENCE PEPTIDIQUE. POUR CELA, LES HOMOLOGUES N-HYDROXYLES DE DIPEPTIDES PROTEGES A LEURS EXTREMITES PAR UNE FONCTION AMIDE ONT ETE PREPARES ET ETUDIES EN SOLUTION PAR RMN ET SPECTROSCOPIE IR, A L'ETAT SOLIDE PAR DIFFRACTION DES RAYONS X, ET SOUMIS A UNE ANALYSE THEORIQUE PAR DYNAMIQUE MOLECULAIRE. LE PREMIER CHAPITRE EST UN RAPPEL DES CONNAISSANCES NECESSAIRES A LA COMPREHENSION DE LA SUITE. LE SECOND CHAPITRE DECRIT LA SYNTHESE DES N-HYDROXYPEPTIDES EXAMINES ET LES METHODES D'ETUDE STRUCTURALE UTILISEES. LES RESULTATS SONT EXPOSES DANS LE TROISIEME CHAPITRE, ET LE QUATRIEME CHAPITRE EST UNE DISCUSSION DE CES RESULTATS EN RELATION AVEC LES OBSERVATIONS CONDUITES SUR DES COMPOSES PSEUDOPEPTIDIQUES VOISINS. DES MODES DE REPLIEMENTS PARTICULIERS AUX N-HYDROXYPEPTIDES ONT ETE RECONNUS ET CARACTERISES. LEUR STABILITE ET LEUR GEOMETRIE SONT COMPAREES A CELLES DES MOTIFS VOISINS DANS LES PEPTIDES
Book Synopsis DETERMINATION DE LA STRUCTURE TRIDIMENSIONNELLE DE PROTEINES EN SOLUTION PAR R.M.N. by : REMI.. LE GOAS
Download or read book DETERMINATION DE LA STRUCTURE TRIDIMENSIONNELLE DE PROTEINES EN SOLUTION PAR R.M.N. written by REMI.. LE GOAS and published by . This book was released on 1991 with total page pages. Available in PDF, EPUB and Kindle. Book excerpt: LA RESONANCE MAGNETIQUE NUCLEAIRE PERMET L'ETUDE DES PROTEINES EN SOLUTION, AUSSI BIEN D'UN POINT DE VUE STRUCTURAL QUE DYNAMIQUE. APRES UN RAPPEL DES PROPRIETES DETERMINANTES DE LA STRUCTURE TRIDIMENSIONNELLE DES PROTEINES, SONT ABORDEES LES EXPERIENCES MAJEURES DE LA R.M.N. A DEUX DIMENSIONS, QUI DELIVRENT LES PARAMETRES NECESSAIRES A LA RECONSTRUCTION D'UN MODELE STRUCTURAL (DISTANCES INTER-HYDROGENES ET ANGLES DIEDRES). L'OBTENTION DE CE MODELE REPOSE, D'UNE PART SUR L'ANALYSE CORRECTE DES DISTANCES ISSUES DES EXPERIENCES, D'AUTRE PART SUR L'UTILISATION D'ALGORITHMES INFORMATIQUES PERMETTANT DE PARCOURIR EFFICACEMENT L'ESPACE CONFORMATIONNEL, TELS QUE LA METHODE DE DISTANCE-GEOMETRIE ET LA DYNAMIQUE MOLECULAIRE. UNE STRATEGIE HYBRIDE UTILISANT SUCCESSIVEMENT LES DEUX TYPES D'ALGORITHME A ETE EMPLOYEE SUR L'ALPHA-COBRATOXINE (71 ACIDES AMINES): ELLE A PERMIS L'EVALUATION DES DEUX METHODES ET A CONDUIT A UN ENSEMBLE DE SOLUTIONS STRUCTURALES QUI SONT COMPAREES AVEC LE MODELE CRISTALLOGRAPHIQUE INDEPENDAMMENT PROPOSE
Book Synopsis ETUDE DYNAMIQUE ET CONFORMATIONNELLE DE PEPTIDES PAR RMN by : PATRICIA.. RABIER
Download or read book ETUDE DYNAMIQUE ET CONFORMATIONNELLE DE PEPTIDES PAR RMN written by PATRICIA.. RABIER and published by . This book was released on 1999 with total page 266 pages. Available in PDF, EPUB and Kindle. Book excerpt: LA RELAXATION DU 1 3C NOUS FOURNIT DES INFORMATIONS SUR LA DYNAMIQUE DES PROTEINES. LA NATURE DES MOUVEMENTS DANS LES PROTEINES EST MAL CONNUE, NEANMOINS, IL EST GENERALEMENT ADMIS QU'ILS AIDENT A LA RECONNAISSANCE MUTUELLE ENTRE MOLECULES AINSI QU'A LA CATALYSE ENZYMATIQUE. GRACE AU DEVELOPPEMENT DE TECHNIQUES RMN PERMETTANT D'ENREGISTRER PLUS RAPIDEMENT LES PARAMETRES DE RELAXATION, NOUS AVONS ENTREPRIS L'ETUDE DYNAMIQUE DE DIFFERENTS PEPTIDES. PMP-D2 (35 RESIDUS) A AINSI ETE ETUDIE EN FONCTION DE LA TEMPERATURE ; PMP-C (36 RESIDUS), PRESENTANT 35% D'HOMOLOGIE AVEC LE PRECEDENT MAIS NATURELLEMENT FUCOSYLE. L'ETUDE DES DEUX FORMES GLYCOSYLEE OU NON DE CE PEPTIDE REVELE QUE LE FUCOSE RALENTIT LA FREQUENCE DES MOUVEMENTS DU PEPTIDE ET PAS UNIQUEMENT DE LA REGION A LAQUELLE IL EST ATTACHE. L'ETUDE DE PMP-D2 MET EN VALEUR LA COMPLEXITE DES MOUVEMENTS ANIMANT UN PEPTIDE. ENFIN, UN DERNIER CHAPITRE EST CONSACRE A L'ANALYSE CONFORMATIONNELLE DE PETITS PEPTIDES, FRAGMENTS DE PROTEINES. DE TELS FRAGMENTS SONT SOUVENT ETUDIES POUR DES RAISONS PRATIQUES. ILS SONT FACILEMENT SYNTHETISABLES ET LEUR ANALYSE CONFORMATIONNELLE EST PLUS FACILE ET PLUS RAPIDE. NEANMOINS, DES FRAGMENTS, ISOLES DE LEUR ENVIRONNEMENT PROTEIQUE, N'ONT SOUVENT PAS UNE CONFORMATION BIEN DEFINIE.
Book Synopsis DETERMINATION PAR RMN DE LA STRUCTURE DE PROTEINES EN SOLUTION by : AFAF.. MIKOU
Download or read book DETERMINATION PAR RMN DE LA STRUCTURE DE PROTEINES EN SOLUTION written by AFAF.. MIKOU and published by . This book was released on 1990 with total page pages. Available in PDF, EPUB and Kindle. Book excerpt: DANS LE CADRE DE L'ETUDE DE LA RELATION STRUCTURE-ACTIVITE, CE TRAVAIL SE PROPOSE D'ETABLIR UNE STRATEGIE DE DETERMINATION, PAR RESONANCE MAGNETIQUE NUCLEAIRE (RMN), DE STRUCTURE DE PROTEINES EN SOLUTION. POUR CE FAIRE, TOUTES LES ETAPES DE L'ETUDE CONFORMATIONNELLE D'UNE PROTEINE SONT DECRITES DEPUIS L'ECHANTILLON DANS UN TUBE RMN JUSQU'A LA STRUCTURE TERTIAIRE EN SOLUTION. DANS CETTE DEMARCHE GENERALE, L'ATTRIBUTION DES RESONANCES AUX DIVERS PROTONS EST UNE ETAPE CLE. UNE STRATEGIE ORIGINALE D'ATTRIBUTION EST DECRITE: ELLE SE COMPOSE D'UNE VARIANTE DE LA METHODE DES SIGNATURES (MAIN CHAIN DIRECTED) QUI PERMET D'IDENTIFIER RAPIDEMENT LES STRUCTURES SECONDAIRES COMPLETEES PAR L'ATTRIBUTION SEQUENTIELLE CLASSIQUE. LA METHODE A ETE APPLIQUEE A L'ATTRIBUTION COMPLETE DE DEUX TOXINES: L'ALPHA COBRATOXINE (71 ACIDES AMINES) EXTRAITE DU VENIN DU NAJA NAJA SIAMENSIS ET LA TOXINE III (64 ACIDES AMINES) DU SCORPION ANDROCTONUS AUSTRALIS HECTOR. L'ANALYSE DETAILLEE ET PRECISE DES CARTES NOESY A CONDUIT A UN GRAND NOMBRE DE CONTRAINTES DE DISTANCES INTERPROTONIQUES. CES CONTRAINTES STRUCTURALES ONT ETE INCORPOREES DANS DES CALCULS DE CONVERSION DISTANCE-GEOMETRIE (VEMBED) ET DE DYNAMIQUE MOLECULAIRE (AMBER). POUR CHACUNE DES DEUX TOXINES, UNE STRUCTURE PRELIMINAIRE EST OBTENUE ET EST ACTUELLEMENT EN COURS DE RAFFINEMENT
Book Synopsis ETUDE STRUCTURALE PAR RESONANCE MAGNETIQUE NUCLEAIRE HAUT CHX11F ET MODELISATION MOLECULAIRE DE PEPTIDES ANALOGUES DE LA NEUROTENSINE by : LAURENCE.. CONRAUX
Download or read book ETUDE STRUCTURALE PAR RESONANCE MAGNETIQUE NUCLEAIRE HAUT CHX11F ET MODELISATION MOLECULAIRE DE PEPTIDES ANALOGUES DE LA NEUROTENSINE written by LAURENCE.. CONRAUX and published by . This book was released on 1994 with total page 210 pages. Available in PDF, EPUB and Kindle. Book excerpt: LE BUT DE CETTE THESE EST DE DETERMINER LA STRUCTURE SECONDAIRE DE LA PARTIE C-TERMINALE DE LA NEUROTENSINE. AU COURS DE CE TRAVAIL, NOUS AVONS ETUDIE PAR RESONANCE MAGNETIQUE NUCLEAIRE (RMN) HUIT HEXAPEPTIDES ANALOGUES DE LA NEUROTENSINE. L'UTILISATION COMBINEE DES TECHNIQUES RMN A UNE ET DEUX DIMENSIONS POUR CES PETITS PEPTIDES NOUS ONT CONDUIT A LA MISE EN EVIDENCE DE L'EXISTENCE DE PLUSIEURS CONFORMERES EN EQUILIBRE. TOUTEFOIS, AC8-13NT ET JMV458, SEMBLES POSSEDER EN SOLUTION DANS L'EAU UN CONFORMERE PRIVILEGIER QUI PEUT ETRE UNE HELICE OU UN COUDE BETA DE TYPE DEUX POUR JMV458 ET DE TYPE UN, UN PRIME OU DEUX PRIME POUR AC8-13NT. LES DONNEES RMN ONT ETE PAR LA SUITE MISES A PROFIT POUR REALISER L'ETUDE CONFORMATIONNELLE DE CES DEUX PEPTIDES. NOUS AVONS MIS EN EVIDENCE POUR LE PEPTIDE AC8-13NT ETUDIE EN SOLUTION DANS L'EAU UN CONFORMERE QUI PRESENTE L'EBAUCHE D'UN COUDE BETA METTANT EN JEU LES QUATRE DERNIERS RESIDUS. NOUS AVONS MONTRE QUE CE MEME PEPTIDE POSSEDE EN SOLUTION DANS LE METHANOL UNE STRUCTURE EN COUDE BETA DE TYPE UN LEGEREMENT DEFORMEE STABILISEE PAR UNE LIAISON HYDROGENE (4 1) ENTRE LE CARBONYLE DE LA PROLINE ET LE PROTON AMIDE DE LA LEUCINE. L'AUTRE PEPTIDE ETUDIE PAR MODELISATION, JMV458 QUI DIFFERE DE AC8-13NT PAR LA NATURE DU RESIDU EN POSITION QUATRE, NE POSSEDE PAS DE STRUCTURE DEFINIE EN SOLUTION DANS L'EAU
Book Synopsis Détermination Par Rmn de Structures 3d de Peptides Et de Protéines by : Emeric Wasielewski
Download or read book Détermination Par Rmn de Structures 3d de Peptides Et de Protéines written by Emeric Wasielewski and published by Omniscriptum. This book was released on 2011-05 with total page 200 pages. Available in PDF, EPUB and Kindle. Book excerpt: Les fonctions sp cifiques des prot ines r sultent de leurs caract ristiques structurales et dynamiques. La spectroscopie RMN apporte ces deux informations, avec des strat gies d' tudes diff rentes selon la taille des biomol cules. Ce travail pr sente les tudes par RMN de deux types de mol cules intervenant dans deux contextes biologiques diff rents. D'abord le m tabolisme du fer chez les bact ries Gram-n gatif: compr hension de la reconnaissance sp cifique complexe m tallique sid rophore/r cepteur membranaire. Deux sid rophores peptidiques bact riens ont t tudi s (azoverdine d'Azomonas macrocytogenes ATCC 12334 et pyoverdine PaA de Pseudomonas aeruginosa ATCC 15692) en adaptant des m thodes utilis es sur les prot ines (HNCA en abondance naturelle de 13C, couplages dipolaires r siduels (RDC)). Le cas de conform res de PaA en change chimique interm diaire a t tudi . Ensuite la transcription et la r paration de l'ADN via l' tude de trois domaines de sous-unit s du facteur humain de transcription/r paration TFIIH: MAT1 (domaine RING C3HC4), p44 (dynamique et propri t s d' change m tallique du domaine RING C8) et p62 (utilisation des RDC pour le domaine PH).
